| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-20页 |
| ·基因调控网络的研究现状 | 第12-16页 |
| ·贝叶斯网络 | 第13-14页 |
| ·布尔网络 | 第14页 |
| ·神经网络模型 | 第14-15页 |
| ·微分方程模型 | 第15页 |
| ·本文提出的基于生物计算的整合基因芯片数据分析方法(已发表SCI) | 第15-16页 |
| ·SPP1、COL11A1、CDH3、MMP1的生物学研究现状 | 第16-18页 |
| ·SPP1、COL11A1、CDH3、MMP1分子结构和生物功能研究 | 第16页 |
| ·与肺腺癌相关的SPP1、COL11A1、CDH3、MMP1研究 | 第16-18页 |
| ·本文所研究的主要问题以及结构 | 第18-20页 |
| 第二章 材料与方法 | 第20-25页 |
| ·微阵列数据 | 第20页 |
| ·基因选择算法 | 第20-21页 |
| ·候选基因调控网络的建立 | 第21-22页 |
| ·基因功能聚类分析 | 第22-23页 |
| ·本章小结 | 第23-25页 |
| 第三章 肺腺癌中SPP1分子网络建立及功能分析(已发表SCI) | 第25-42页 |
| ·SPP1上、下游入侵性分子网络的建立 | 第25-26页 |
| ·SPP1上、下游入侵性分子网络功能模块划分 | 第26-28页 |
| ·讨论 | 第28-34页 |
| ·SPP1上游入侵性分子网络分析 | 第28-32页 |
| ·SPP1下游入侵性分子网络分析 | 第32-34页 |
| ·本章小结 | 第34-42页 |
| 第四章 肺腺癌中COL11A1分子网络建立及功能分析 | 第42-59页 |
| ·COL11A1信号传导网络构建与分析 | 第42-52页 |
| ·COL11A1_1上、下游信号传导模块划分 | 第42-43页 |
| ·COL11A1_1上、下游信号传导网络的建立 | 第43页 |
| ·讨论 | 第43-46页 |
| ·离子传输模块 | 第44页 |
| ·定位模块 | 第44-45页 |
| ·信号模块 | 第45页 |
| ·蛋白质结合模块 | 第45-46页 |
| ·本节小结 | 第46-52页 |
| ·COL11A1转移网络构建与分析 | 第52-58页 |
| ·COL11A1_1上、下游转移模块划分 | 第52页 |
| ·COL11A1_1上、下游转移网络的建立 | 第52页 |
| ·讨论 | 第52-54页 |
| ·胶原模块 | 第53页 |
| ·骨骼发育模块 | 第53页 |
| ·糖蛋白模块 | 第53-54页 |
| ·器官发育模块 | 第54页 |
| ·本节小结 | 第54-58页 |
| ·本章小结 | 第58-59页 |
| 第五章 肺腺癌中CDH3分子网络建立及功能分析 | 第59-71页 |
| ·CDH3上、下游分子网络的建立 | 第59页 |
| ·CDH3上、下游分子网络功能模块划分 | 第59-61页 |
| ·讨论 | 第61-64页 |
| ·膜相关模块 | 第62-63页 |
| ·变异相关模块 | 第63-64页 |
| ·信号相关模块 | 第64页 |
| ·本章小结 | 第64-71页 |
| 第六章 肺腺癌中MMP1分子网络建立及功能分析 | 第71-89页 |
| ·MMP1上、下游分子网络的建立 | 第71-72页 |
| ·MMP1上、下游分子网络功能模块划分 | 第72-76页 |
| ·讨论 | 第76-80页 |
| ·酶和代谢相关模块 | 第76-78页 |
| ·胞外相关模块 | 第78-79页 |
| ·离子和信号相关模块 | 第79-80页 |
| ·本章小结 | 第80-89页 |
| 第七章 总结与展望 | 第89-91页 |
| ·总结 | 第89-90页 |
| ·展望 | 第90-91页 |
| 参考文献 | 第91-102页 |
| 附录 | 第102-113页 |
| 致谢 | 第113-114页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第114页 |
