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基于微扰理论的药物活性定量预测平台构建

中文摘要第3-4页
英文摘要第4页
中英文缩略词第8-9页
1 绪论第9-19页
    1.1 定量构效关系及相关科学软件发展现状第9-12页
        1.1.1 定量构效关系第9-10页
        1.1.2 QSAR专业软件与平台发展现状第10-12页
    1.2 基于微扰理论的定量构效关系的研究第12-13页
    1.3 Java语言及软件开发平台发展现状第13-17页
        1.3.1 Java语言简介第13-14页
        1.3.2 J2EE架构第14-16页
        1.3.3 基于J2EE架构的QSAR软件开发现状第16-17页
    1.4 本论文主要研究目的和内容第17-19页
        1.4.1 研究意义和目的第17-18页
        1.4.2 主要研究内容第18-19页
2 原理和方法第19-29页
    2.1 定量构效关系第19页
    2.2 多元线性逐步回归第19-20页
    2.3 偏最小二乘回归第20-22页
    2.4 微扰-定量构效关系基本原理第22页
    2.5 微扰定量构效关系建模主要流程第22-25页
        2.5.1 数据收集与整理第23页
        2.5.2 结构优化与表征第23页
        2.5.3 基于微扰理论的QSAR模型建立第23-24页
        2.5.4 模型验证第24-25页
    2.6 基于J2EE架构的在线平台搭建第25-29页
        2.6.1 MVC设计模式第25-26页
        2.6.2 Struts2开源框架第26-27页
        2.6.3 PT-QSAR平台搭建流程第27-29页
3 基于J2EE框架的PT-QSAR在线平台构建第29-51页
    3.1 环境配置与开发工具第29-30页
        3.1.1 软硬件环境配置第29页
        3.1.2 应用服务器和数据库选择第29-30页
        3.1.3 开发工具第30页
    3.2 开发环境搭建第30-31页
        3.2.1 基本开发环境搭建第30-31页
        3.2.2 安装系统依赖第三方库第31页
    3.3 系统需求分析第31-34页
        3.3.1 业务需求第31-33页
        3.3.2 功能需求第33-34页
        3.3.3 用户及其他需求第34页
    3.4 系统用户与用例分析第34-36页
    3.5 系统总体设计第36-41页
        3.5.1 系统总体框架第36-37页
        3.5.2 系统类图第37-39页
        3.5.3 系统数据库设计第39-40页
        3.5.4 系统模型设计第40页
        3.5.5 系统视图设计第40-41页
    3.6 系统实现第41-49页
        3.6.1 系统的设计模式第41页
        3.6.2 系统数据库实现第41-43页
        3.6.3 系统业务逻辑实现第43页
        3.6.4 系统视图实现第43-49页
    3.7 系统评测第49-50页
        3.7.1 模块测试第49页
        3.7.2 集成测试第49页
        3.7.3 系统测试第49-50页
    3.8 小结第50-51页
4 基于微扰理论的药物活性预测平台实例研究第51-77页
    4.1 数据来源及其预处理第51-57页
    4.2 样本划分及微扰第57-59页
    4.3 变量筛选与PT-QSAR建模第59页
    4.4 模型验证第59页
    4.5 组胺H3受体抑制剂的PT-QSAR研究结果第59-64页
        4.5.1 拮抗剂分子结构表征第59页
        4.5.2 变量筛选与PLS建模第59-63页
        4.5.3 经典QSAR建模结果第63-64页
        4.5.4 小结第64页
    4.6 碳酸酐酶Ⅳ抑制剂的PT-QSAR研究结果第64-70页
        4.6.1 拮抗剂分子结构表征第64-65页
        4.6.2 变量筛选与PLS建模第65-69页
        4.6.3 经典QSAR建模结果第69-70页
        4.6.4 小结第70页
    4.7 腺苷A1受体拮抗剂的PT-QSAR研究结果第70-77页
        4.7.1 拮抗剂分子结构表征第70页
        4.7.2 变量筛选与PLS建模第70-74页
        4.7.3 经典QSAR研究结果第74-75页
        4.7.4 小结第75-77页
5 结论与展望第77-79页
    5.1 研究结论第77页
    5.2 前景展望第77-79页
致谢第79-81页
参考文献第81-87页
附录第87-90页
    A 微扰脚本第87-90页
    B 作者在攻读硕士学位期间参与发表的论文目录第90页
    C 作者在攻读硕士学位期间参与的科研项目第90页

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