中文摘要 | 第3-4页 |
英文摘要 | 第4页 |
中英文缩略词 | 第8-9页 |
1 绪论 | 第9-19页 |
1.1 定量构效关系及相关科学软件发展现状 | 第9-12页 |
1.1.1 定量构效关系 | 第9-10页 |
1.1.2 QSAR专业软件与平台发展现状 | 第10-12页 |
1.2 基于微扰理论的定量构效关系的研究 | 第12-13页 |
1.3 Java语言及软件开发平台发展现状 | 第13-17页 |
1.3.1 Java语言简介 | 第13-14页 |
1.3.2 J2EE架构 | 第14-16页 |
1.3.3 基于J2EE架构的QSAR软件开发现状 | 第16-17页 |
1.4 本论文主要研究目的和内容 | 第17-19页 |
1.4.1 研究意义和目的 | 第17-18页 |
1.4.2 主要研究内容 | 第18-19页 |
2 原理和方法 | 第19-29页 |
2.1 定量构效关系 | 第19页 |
2.2 多元线性逐步回归 | 第19-20页 |
2.3 偏最小二乘回归 | 第20-22页 |
2.4 微扰-定量构效关系基本原理 | 第22页 |
2.5 微扰定量构效关系建模主要流程 | 第22-25页 |
2.5.1 数据收集与整理 | 第23页 |
2.5.2 结构优化与表征 | 第23页 |
2.5.3 基于微扰理论的QSAR模型建立 | 第23-24页 |
2.5.4 模型验证 | 第24-25页 |
2.6 基于J2EE架构的在线平台搭建 | 第25-29页 |
2.6.1 MVC设计模式 | 第25-26页 |
2.6.2 Struts2开源框架 | 第26-27页 |
2.6.3 PT-QSAR平台搭建流程 | 第27-29页 |
3 基于J2EE框架的PT-QSAR在线平台构建 | 第29-51页 |
3.1 环境配置与开发工具 | 第29-30页 |
3.1.1 软硬件环境配置 | 第29页 |
3.1.2 应用服务器和数据库选择 | 第29-30页 |
3.1.3 开发工具 | 第30页 |
3.2 开发环境搭建 | 第30-31页 |
3.2.1 基本开发环境搭建 | 第30-31页 |
3.2.2 安装系统依赖第三方库 | 第31页 |
3.3 系统需求分析 | 第31-34页 |
3.3.1 业务需求 | 第31-33页 |
3.3.2 功能需求 | 第33-34页 |
3.3.3 用户及其他需求 | 第34页 |
3.4 系统用户与用例分析 | 第34-36页 |
3.5 系统总体设计 | 第36-41页 |
3.5.1 系统总体框架 | 第36-37页 |
3.5.2 系统类图 | 第37-39页 |
3.5.3 系统数据库设计 | 第39-40页 |
3.5.4 系统模型设计 | 第40页 |
3.5.5 系统视图设计 | 第40-41页 |
3.6 系统实现 | 第41-49页 |
3.6.1 系统的设计模式 | 第41页 |
3.6.2 系统数据库实现 | 第41-43页 |
3.6.3 系统业务逻辑实现 | 第43页 |
3.6.4 系统视图实现 | 第43-49页 |
3.7 系统评测 | 第49-50页 |
3.7.1 模块测试 | 第49页 |
3.7.2 集成测试 | 第49页 |
3.7.3 系统测试 | 第49-50页 |
3.8 小结 | 第50-51页 |
4 基于微扰理论的药物活性预测平台实例研究 | 第51-77页 |
4.1 数据来源及其预处理 | 第51-57页 |
4.2 样本划分及微扰 | 第57-59页 |
4.3 变量筛选与PT-QSAR建模 | 第59页 |
4.4 模型验证 | 第59页 |
4.5 组胺H3受体抑制剂的PT-QSAR研究结果 | 第59-64页 |
4.5.1 拮抗剂分子结构表征 | 第59页 |
4.5.2 变量筛选与PLS建模 | 第59-63页 |
4.5.3 经典QSAR建模结果 | 第63-64页 |
4.5.4 小结 | 第64页 |
4.6 碳酸酐酶Ⅳ抑制剂的PT-QSAR研究结果 | 第64-70页 |
4.6.1 拮抗剂分子结构表征 | 第64-65页 |
4.6.2 变量筛选与PLS建模 | 第65-69页 |
4.6.3 经典QSAR建模结果 | 第69-70页 |
4.6.4 小结 | 第70页 |
4.7 腺苷A1受体拮抗剂的PT-QSAR研究结果 | 第70-77页 |
4.7.1 拮抗剂分子结构表征 | 第70页 |
4.7.2 变量筛选与PLS建模 | 第70-74页 |
4.7.3 经典QSAR研究结果 | 第74-75页 |
4.7.4 小结 | 第75-77页 |
5 结论与展望 | 第77-79页 |
5.1 研究结论 | 第77页 |
5.2 前景展望 | 第77-79页 |
致谢 | 第79-81页 |
参考文献 | 第81-87页 |
附录 | 第87-90页 |
A 微扰脚本 | 第87-90页 |
B 作者在攻读硕士学位期间参与发表的论文目录 | 第90页 |
C 作者在攻读硕士学位期间参与的科研项目 | 第90页 |