| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词表(Abbreviation) | 第12-13页 |
| 绪论 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-32页 |
| 1 管家基因特征 | 第14-18页 |
| 1.1 管家基因识别 | 第14页 |
| 1.2 管家基因结构 | 第14-16页 |
| 1.3 管家基因染色质特征 | 第16-17页 |
| 1.4 管家基因进化特征 | 第17页 |
| 1.5 管家基因启动子体系结构特征 | 第17-18页 |
| 1.6 管家基因调控元件特征 | 第18页 |
| 2 管家基因研究进展 | 第18-24页 |
| 2.1 管家基因进化速率慢原因分析 | 第18-19页 |
| 2.2 管家基因基因结构紧凑性分析 | 第19-21页 |
| 2.3 管家基因区分新途径-依据不同的重复序列环境 | 第21-24页 |
| 3 管家基因分类 | 第24-30页 |
| 4 管家基因的识别 | 第30-32页 |
| 第二章 葡萄管家基因的识别及生物信息学分析 | 第32-46页 |
| 1 材料与方法 | 第33-35页 |
| 1.1 基因表达数据 | 第33-34页 |
| 1.2 识别管家基因的标准 | 第34页 |
| 1.3 基因结构数据 | 第34页 |
| 1.4 基因本体注释 | 第34页 |
| 1.5 确定实验室实验对照的管家基因清单 | 第34-35页 |
| 2 结果与分析 | 第35-43页 |
| 2.1 葡萄基因组中四种类型基因基因结构分析 | 第35-38页 |
| 2.2 管家基因的功能分析 | 第38-40页 |
| 2.3 所识别管家基因的表达特征 | 第40-43页 |
| 2.4 确定实验室实验对照的管家基因清单 | 第43页 |
| 3 讨论 | 第43-46页 |
| 第三章 葡萄Actin基因家族鉴定及其进化和表达分析 | 第46-66页 |
| 1 材料与方法 | 第47-51页 |
| 1.1 材料 | 第47页 |
| 1.2 Actin基因家族数据集的建立和染色体定位分析 | 第47页 |
| 1.3 Actin基因结构特征 | 第47-48页 |
| 1.4 Actin基因氨基酸属性分析 | 第48页 |
| 1.5 Actin蛋白亚细胞定位、蛋白二级结构分析及蛋白三维结构绘图 | 第48页 |
| 1.6 Actin基因系统发育树的构建 | 第48页 |
| 1.7 Actin基因在不同组织表达分析 | 第48页 |
| 1.8 半定量PCR | 第48-51页 |
| 2 结果与分析 | 第51-63页 |
| 2.0 葡萄各组织总RNA提取质量检测 | 第51-52页 |
| 2.1 葡萄Actin家族的全基因组鉴定 | 第52-53页 |
| 2.2 葡萄Actin基因家族结构特征分析 | 第53-55页 |
| 2.3 葡萄Actin蛋白质氨基酸属性分析 | 第55-57页 |
| 2.4 葡萄Actin蛋白家族二级结构、三级结构及亚细胞定位 | 第57-58页 |
| 2.5 葡萄Actin家族基因系统进化关系 | 第58-59页 |
| 2.6 葡萄Actin基因在芯片中的表达分析 | 第59-61页 |
| 2.7 Actin家族不同基因在魏可葡萄各组织中的表达分析 | 第61-63页 |
| 3 结论与讨论 | 第63-66页 |
| 第四章 3-磷酸甘油醛脱氢酶基因家族鉴定和进化分析 | 第66-84页 |
| 1 材料与方法 | 第67-70页 |
| 1.1 材料 | 第67页 |
| 1.2 GAPDH基因家族数据集的建立和染色体定位分析 | 第67页 |
| 1.3 GAPDH基因结构特征 | 第67页 |
| 1.4 GAPDH基因氨基酸属性分析 | 第67页 |
| 1.5 GAPDH蛋白亚细胞定位、蛋白二级结构分析及蛋白三维结构 | 第67-68页 |
| 1.6 GAPDH基因系统发育树的构建 | 第68页 |
| 1.7 GAPDH基因在不同组织表达分析 | 第68页 |
| 1.8 半定量PCR | 第68-70页 |
| 2 结果与分析 | 第70-81页 |
| 2.1 葡萄GAPDH家族的全基因组鉴定 | 第70-71页 |
| 2.2 葡萄GAPDH基因家族结构特征分析 | 第71-72页 |
| 2.3 葡萄GAPDH基因家族蛋白质特性 | 第72-75页 |
| 2.4 葡萄GAPDH蛋白家族二级结构、三级结构及亚细胞定位 | 第75-78页 |
| 2.5 葡萄GAPDH家族基因系统进化关系 | 第78页 |
| 2.6 葡萄GAPDH基因在芯片中的表达分析 | 第78-80页 |
| 2.7 GAPDH家族不同基因在魏可葡萄各组织中的表达分析 | 第80-81页 |
| 3 结论与讨论 | 第81-84页 |
| 第五章 葡萄微管蛋白基因家族鉴定及其进化和表达分析 | 第84-108页 |
| 1 材料与方法 | 第85-87页 |
| 1.1 材料 | 第85页 |
| 1.2 TUA和TUB基因家族数据集的建立和染色体定位分析 | 第85页 |
| 1.3 TUA和TUB基因结构特征 | 第85页 |
| 1.4 TUA和TUB基因氨基酸属性分析 | 第85-86页 |
| 1.5 TUA和TUB蛋白亚细胞定位、蛋白二级结构分析及蛋白三维结构 | 第86页 |
| 1.6 系统发育树的构建 | 第86页 |
| 1.7 TUA和TUB基因在不同组织表达分析 | 第86页 |
| 1.8 TUA和TUB基因在不同组织表达分析 | 第86页 |
| 1.9 半定量PCR | 第86-87页 |
| 2 结果与分析 | 第87-105页 |
| 2.1 葡萄TUA和TUB家族的全基因组鉴定 | 第87-88页 |
| 2.2 葡萄微管蛋白基因结构分析 | 第88-91页 |
| 2.3 葡萄微管蛋白蛋白质特性分析 | 第91-96页 |
| 2.4 葡萄微管蛋白二级结构、三级结构及亚细胞定位 | 第96-99页 |
| 2.5 葡萄TUA和TUB家族基因系统进化关系 | 第99-100页 |
| 2.6 葡萄TUA和TUB基因在芯片中的表达分析 | 第100-103页 |
| 2.7 TUA家族不同基因在魏可葡萄各组织中的表达分析 | 第103页 |
| 2.8 TUB家族不同基因在魏可葡萄各组织中的表达分析 | 第103-105页 |
| 3 结论与讨论 | 第105-108页 |
| 全文结论 | 第108-110页 |
| 创新点 | 第110-112页 |
| 参考文献 | 第112-132页 |
| 附表 | 第132-150页 |
| 论文发表情况 | 第150-152页 |
| 致谢 | 第152页 |
