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葡萄管家基因识别与分析

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
缩略词表(Abbreviation)第12-13页
绪论第13-14页
第一章 文献综述第14-32页
    1 管家基因特征第14-18页
        1.1 管家基因识别第14页
        1.2 管家基因结构第14-16页
        1.3 管家基因染色质特征第16-17页
        1.4 管家基因进化特征第17页
        1.5 管家基因启动子体系结构特征第17-18页
        1.6 管家基因调控元件特征第18页
    2 管家基因研究进展第18-24页
        2.1 管家基因进化速率慢原因分析第18-19页
        2.2 管家基因基因结构紧凑性分析第19-21页
        2.3 管家基因区分新途径-依据不同的重复序列环境第21-24页
    3 管家基因分类第24-30页
    4 管家基因的识别第30-32页
第二章 葡萄管家基因的识别及生物信息学分析第32-46页
    1 材料与方法第33-35页
        1.1 基因表达数据第33-34页
        1.2 识别管家基因的标准第34页
        1.3 基因结构数据第34页
        1.4 基因本体注释第34页
        1.5 确定实验室实验对照的管家基因清单第34-35页
    2 结果与分析第35-43页
        2.1 葡萄基因组中四种类型基因基因结构分析第35-38页
        2.2 管家基因的功能分析第38-40页
        2.3 所识别管家基因的表达特征第40-43页
        2.4 确定实验室实验对照的管家基因清单第43页
    3 讨论第43-46页
第三章 葡萄Actin基因家族鉴定及其进化和表达分析第46-66页
    1 材料与方法第47-51页
        1.1 材料第47页
        1.2 Actin基因家族数据集的建立和染色体定位分析第47页
        1.3 Actin基因结构特征第47-48页
        1.4 Actin基因氨基酸属性分析第48页
        1.5 Actin蛋白亚细胞定位、蛋白二级结构分析及蛋白三维结构绘图第48页
        1.6 Actin基因系统发育树的构建第48页
        1.7 Actin基因在不同组织表达分析第48页
        1.8 半定量PCR第48-51页
    2 结果与分析第51-63页
        2.0 葡萄各组织总RNA提取质量检测第51-52页
        2.1 葡萄Actin家族的全基因组鉴定第52-53页
        2.2 葡萄Actin基因家族结构特征分析第53-55页
        2.3 葡萄Actin蛋白质氨基酸属性分析第55-57页
        2.4 葡萄Actin蛋白家族二级结构、三级结构及亚细胞定位第57-58页
        2.5 葡萄Actin家族基因系统进化关系第58-59页
        2.6 葡萄Actin基因在芯片中的表达分析第59-61页
        2.7 Actin家族不同基因在魏可葡萄各组织中的表达分析第61-63页
    3 结论与讨论第63-66页
第四章 3-磷酸甘油醛脱氢酶基因家族鉴定和进化分析第66-84页
    1 材料与方法第67-70页
        1.1 材料第67页
        1.2 GAPDH基因家族数据集的建立和染色体定位分析第67页
        1.3 GAPDH基因结构特征第67页
        1.4 GAPDH基因氨基酸属性分析第67页
        1.5 GAPDH蛋白亚细胞定位、蛋白二级结构分析及蛋白三维结构第67-68页
        1.6 GAPDH基因系统发育树的构建第68页
        1.7 GAPDH基因在不同组织表达分析第68页
        1.8 半定量PCR第68-70页
    2 结果与分析第70-81页
        2.1 葡萄GAPDH家族的全基因组鉴定第70-71页
        2.2 葡萄GAPDH基因家族结构特征分析第71-72页
        2.3 葡萄GAPDH基因家族蛋白质特性第72-75页
        2.4 葡萄GAPDH蛋白家族二级结构、三级结构及亚细胞定位第75-78页
        2.5 葡萄GAPDH家族基因系统进化关系第78页
        2.6 葡萄GAPDH基因在芯片中的表达分析第78-80页
        2.7 GAPDH家族不同基因在魏可葡萄各组织中的表达分析第80-81页
    3 结论与讨论第81-84页
第五章 葡萄微管蛋白基因家族鉴定及其进化和表达分析第84-108页
    1 材料与方法第85-87页
        1.1 材料第85页
        1.2 TUA和TUB基因家族数据集的建立和染色体定位分析第85页
        1.3 TUA和TUB基因结构特征第85页
        1.4 TUA和TUB基因氨基酸属性分析第85-86页
        1.5 TUA和TUB蛋白亚细胞定位、蛋白二级结构分析及蛋白三维结构第86页
        1.6 系统发育树的构建第86页
        1.7 TUA和TUB基因在不同组织表达分析第86页
        1.8 TUA和TUB基因在不同组织表达分析第86页
        1.9 半定量PCR第86-87页
    2 结果与分析第87-105页
        2.1 葡萄TUA和TUB家族的全基因组鉴定第87-88页
        2.2 葡萄微管蛋白基因结构分析第88-91页
        2.3 葡萄微管蛋白蛋白质特性分析第91-96页
        2.4 葡萄微管蛋白二级结构、三级结构及亚细胞定位第96-99页
        2.5 葡萄TUA和TUB家族基因系统进化关系第99-100页
        2.6 葡萄TUA和TUB基因在芯片中的表达分析第100-103页
        2.7 TUA家族不同基因在魏可葡萄各组织中的表达分析第103页
        2.8 TUB家族不同基因在魏可葡萄各组织中的表达分析第103-105页
    3 结论与讨论第105-108页
全文结论第108-110页
创新点第110-112页
参考文献第112-132页
附表第132-150页
论文发表情况第150-152页
致谢第152页

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