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G四链体荧光探针和pH调控的DNAzyme的设计及应用

摘要第8-10页
Abstract第10-11页
第一章 绪论第12-49页
    1.1 脱氧核糖核酸第12-17页
        1.1.1 脱氧核糖核酸简介第12-13页
        1.1.2 脱氧核糖核酸的一级结构第13-14页
        1.1.3 脱氧核糖核酸的二级结构之双螺旋第14-17页
    1.2 G四链体第17-25页
        1.2.1 G四链体简述第17-18页
        1.2.2 G四链体的结构第18-20页
        1.2.3 G四链体的生物功能第20-22页
            1.2.3.1 G四链体在端粒末端的调控第20-21页
            1.2.3.2 G四链体在原癌基因的调控第21-22页
        1.2.4 G四链体的荧光检测第22-25页
    1.3 i-motif DNA第25-35页
        1.3.1 i-mitifDNA简述第25页
        1.3.2 i-motif DNA的结构第25-29页
        1.3.3 i-motif DNA的生物功育能第29-31页
            1.3.3.1 端粒的i-motif DNA第30页
            1.3.3.2 原癌基因启动区域的i-motifDNA第30-31页
        1.3.4 i-motif DNA的应用第31-35页
            1.3.4.1 pH探针的设计第31-33页
            1.3.4.2 i-motif DNA在pH调控的DNA纳米机器中的应用第33-35页
    1.4 triplex DNA第35-42页
        1.4.1 triplex DNA简述第35页
        1.4.2 triplex DNA的结构第35-37页
        1.4.3 triplex DNA的生物功能第37-39页
        1.4.4 triplex DNA的应用第39-42页
            1.4.4.1 pH探针的设计第39-41页
            1.4.4.2 triplex DNA在pH调控的DNA纳米机器中的应用第41-42页
    1.5 DNAzyme第42-48页
        1.5.1 DNAzyme简述第42-43页
        1.5.2 DNAzyme的结构第43-47页
        1.5.3 DNAzyme的应用第47-48页
    1.6 本章小结第48-49页
第二章 课题设计第49-61页
    2.1 基于方酸菁类荧光基团的新型G四链体探针第49-54页
        2.1.1 引言第49-50页
        2.1.2 基于方酸菁类荧光基团的新型G四链体探针的设计策略第50-54页
    2.2 基于i-motif和triplex DNA结构的pH调控的DNAzyme的设计及其在DNA纳米机器中的应用第54-59页
        2.2.1 引言第54页
        2.2.2 基于i-motif和triplex DNA结构的pH调控的DNAzyme的设计策略第54-58页
        2.2.3 基于i-motif结构的pH调控的DNAzyme在DNA纳米机器中的应用第58-59页
    2.3 本章小结第59-61页
第三章 基于方酸菁类荧光基团的新型G四链体探针第61-74页
    3.1 引言第61页
    3.2 仪器与试剂第61-63页
        3.2.1 仪器第61-62页
        3.2.2 试剂第62-63页
        3.2.3 主要溶液的配制第63页
    3.3 化合物TSQ1的合成及表征第63-64页
    3.4 通过荧光方法检测TSQ1对DNAG四链体的荧光响应第64-69页
    3.5 通过圆二色谱法检测TSQ1对DNAG四链体的诱导效应第69-73页
    3.6 本章小结第73-74页
第四章 基于i-motif和triplex DNA结构的pH调控的DNAzyme的设计及其在DNA纳米机器中的应用第74-113页
    4.1 引言第74页
    4.2 仪器与试剂第74-80页
        4.2.1 仪器第74页
        4.2.2 试剂第74-78页
        4.2.3 主要溶液的配制和实验方法第78-80页
            4.2.3.1 主要溶液的配制第78-79页
            4.2.3.2 实验方法第79-80页
    4.3 基于i-motif结构的pH调控的DNAzyme的设计第80-99页
        4.3.1 iMNAzyme的可行性验证第81-83页
        4.3.2 iMNAzyme的实验条件优化第83-84页
        4.3.3 iMNAzyme反应动力学研究第84-86页
        4.3.4 “Proof of Concept”:研究pH对iMNAzyme催化活性的影响第86-89页
        4.3.5 “pause-and-rise”实验第89-90页
        4.3.6 iMNA zyme结构对催化活性的影响第90-99页
            4.3.6.1 I-motif结构与“嫁接”位点间的碱基对数对iMNAzyme催化活性的影响第91-94页
            4.3.6.2 C-C+平面的层数对iMNAzyme催化活性的影响第94-96页
            4.3.6.3 Loop环对iMNAzyme催化活性的影响第96-99页
    4.4 基于triplex DNA结构的pH调控的DNAzyme的设计第99-107页
        4.4.1 TNAzyme的可行性研究及pH对其的调控作用第100-102页
        4.4.2 TNAzyme结构对催化活性的影响第102-107页
            4.4.2.1 Triplex DNA结构与“嫁接”位点间的碱基对对数对TNAzyme催化活性的影响第102-105页
            4.4.2.2 Triplex DNA结构中C+:G-C三碱基单元含量比对TNAzyme催化活性的影响第105-107页
    4.5 4.3和4.4节总结第107-108页
    4.6 基于i-motif结构的pH调控的DNAzyme在DNA纳米机器中的应用第108-112页
        4.6.1 体系构建的可行性验证第110-111页
        4.6.2 pH调控DNA Walker的可行性验证第111-112页
    4.7 本章小结第112-113页
全文总结第113-114页
参考文献第114-125页
攻读博士期间已发表的论文第125-128页
致谢第128-129页
附件第129-130页

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