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全基因组单核苷酸多态性交互作用识别方法研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
1 绪论第9-17页
    1.1 研究背景和意义第9-10页
    1.2 国内外研究现状第10-14页
    1.3 本文的主要内容第14-15页
    1.4 本文的组织结构第15-17页
2 单核苷酸多态性(SNP)交互作用相关概念第17-23页
    2.1 单核苷酸多态性(SNP)相关概念第17-18页
    2.2 SNP交互作用与相关模型第18-22页
        2.2.1 SNP交互作用第18-19页
        2.2.2 SNP交互作用模型第19-22页
    2.3 本章小结第22-23页
3 基于病例对照组(case-control)的高阶SNP交互作用识别方法研究第23-43页
    3.1 HiSeeker基本原理第24-32页
        3.1.1 第一阶段:候选两位点组合选择第24-29页
        3.1.2 第二阶段:高阶SNP交互作用识别第29-32页
    3.2 实验结果分析第32-41页
        3.2.1 模拟实验结果分析第32-37页
        3.2.2 真实实验结果分析第37-39页
        3.2.3 实验参数设置第39-40页
        3.2.4 运行时间分析第40-41页
    3.3 本章小结第41-43页
4 基于三元家庭(triofamilies)的SNP交互作用识别方法研究第43-59页
    4.1 TrioMDR基本原理第44-49页
        4.1.1 基因型维度约简第44-46页
        4.1.2 互作效应建模第46-47页
        4.1.3 半参数P-value校正机制第47-49页
    4.2 实验结果分析第49-57页
        4.2.1 模拟数据生成第49-51页
        4.2.2 I型错误率对比第51-54页
        4.2.3 识别能力对比第54-56页
        4.2.4 运行时间分析第56页
        4.2.5 参数敏感性分析第56-57页
    4.3 本章小结第57-59页
5 总结与展望第59-61页
    5.1 论文总结第59-60页
    5.2 论文展望第60-61页
参考文献第61-69页
附录第69-75页
致谢第75-77页
发表论文及参加课题一览表第77页

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