| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略词 | 第9-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-24页 |
| 1.1 家禽精子活力的研究进展 | 第14-16页 |
| 1.1.1 提高家禽精子活力的重要意义 | 第14页 |
| 1.1.2 禽类精子活力的产生过程 | 第14-15页 |
| 1.1.3 精子活力的测定标准和方法 | 第15页 |
| 1.1.4 影响家禽精子活力的因素 | 第15-16页 |
| 1.2 精子活力相关的代谢和信号通路 | 第16-18页 |
| 1.2.1 cAMP依赖的蛋白激酶A(cAMP-PKA)信号通路 | 第16-17页 |
| 1.2.2 ROS与精子活力 | 第17-18页 |
| 1.2.3 钙离子通路 | 第18页 |
| 1.3 ncRNA与精子功能 | 第18-20页 |
| 1.3.1 miRNA与精子功能 | 第18-19页 |
| 1.3.2 piRNA与精子功能 | 第19-20页 |
| 1.3.3 lncRNA与精子功能 | 第20页 |
| 1.4 转录组学研究进展 | 第20-22页 |
| 1.4.1 转录组与转录组学 | 第20-21页 |
| 1.4.2 转录组测序技术在家禽研究中的应用 | 第21-22页 |
| 1.4.3 转录组测序技术在睾丸发育和雄性不育研究中的应用 | 第22页 |
| 1.5 本研究的目的及意义 | 第22-24页 |
| 第二章 高、低精子活力公鸡的筛选及弱精症成因初步分析 | 第24-30页 |
| 2.1 引言 | 第24页 |
| 2.2 试验材料 | 第24页 |
| 2.2.1 试验群体 | 第24页 |
| 2.2.2 主要仪器与试剂 | 第24页 |
| 2.3 试验方法 | 第24-26页 |
| 2.3.1 精液品质指标检测 | 第24-25页 |
| 2.3.2 交配试验 | 第25页 |
| 2.3.3 睾丸样本的采集和石蜡切片制作 | 第25-26页 |
| 2.4 试验结果 | 第26-27页 |
| 2.4.1 高、低精子活力公鸡的繁殖指标 | 第26页 |
| 2.4.2 高低精子活力公鸡的睾丸组织形态观察 | 第26-27页 |
| 2.5 讨论 | 第27-28页 |
| 2.6 小结 | 第28-30页 |
| 第三章 鸡精子活力相关基因和lnCRNA的鉴定和分析 | 第30-50页 |
| 3.1 引言 | 第30页 |
| 3.2 试验材料 | 第30-31页 |
| 3.2.1 试验群体 | 第30页 |
| 3.2.2 主要仪器与试剂 | 第30-31页 |
| 3.3 试验方法 | 第31-35页 |
| 3.3.1 睾丸RNA提取 | 第31页 |
| 3.3.2 RNA质量检测 | 第31-32页 |
| 3.3.3 链特异性文库构建和测序 | 第32-33页 |
| 3.3.4 测序数据分析 | 第33-34页 |
| 3.3.5 qPCR验证 | 第34-35页 |
| 3.4 试验结果 | 第35-44页 |
| 3.4.1 辜丸RNA的质量检测 | 第35-36页 |
| 3.4.2 测序原始数据质量 | 第36页 |
| 3.4.3 基因组比对 | 第36-37页 |
| 3.4.4 lncRNA的鉴定 | 第37页 |
| 3.4.5 鸡睾丸lnCRNA的特征 | 第37-40页 |
| 3.4.6 lncRNA的靶基因预测 | 第40页 |
| 3.4.7 差异lncRNA和mRNA的鉴定 | 第40-43页 |
| 3.4.8 精子活力关联的信号通路的鉴定 | 第43页 |
| 3.4.9 lncRNA-mRNA互作分析 | 第43-44页 |
| 3.5 讨论 | 第44-48页 |
| 3.5.1 本研究测序策略和分析方法的选择 | 第44-45页 |
| 3.5.2 鸡睾丸lncRNA的特征 | 第45-46页 |
| 3.5.3 鸡精子活力相关的lncRNA和mRNA | 第46-47页 |
| 3.5.4 鸡精子活力相关的信号通路 | 第47-48页 |
| 3.6 小结 | 第48-50页 |
| 第四章 基于small RNA测序筛选鸡精子活力相关的miRNA | 第50-66页 |
| 4.1 引言 | 第50页 |
| 4.2 试验材料 | 第50-51页 |
| 4.2.1 试验动物和样本收集 | 第50页 |
| 4.2.2 主要仪器和试剂 | 第50-51页 |
| 4.3 试验方法 | 第51-54页 |
| 4.3.1 睾丸RNA提取和质量检测 | 第51页 |
| 4.3.2 small RNA文库构建和上机测序 | 第51-52页 |
| 4.3.3 small RNA测序数据分析 | 第52-54页 |
| 4.3.4 qPCR验证 | 第54页 |
| 4.4 试验结果 | 第54-63页 |
| 4.4.1 small RNA测序概况 | 第54-55页 |
| 4.4.2 small RNA的分类注释 | 第55-56页 |
| 4.4.3 已知miRNA的表达 | 第56-57页 |
| 4.4.4 新miRNA的鉴定 | 第57页 |
| 4.4.5 差异miRNA的鉴定 | 第57-59页 |
| 4.4.6 miRNA的靶基因预测和功能分析 | 第59-61页 |
| 4.4.7 miRNA-mRNA互作网络构建 | 第61-62页 |
| 4.4.8 qPCR验证结果 | 第62-63页 |
| 4.5 讨论 | 第63-65页 |
| 4.5.1 鸡睾丸small RNA长度分布 | 第63页 |
| 4.5.2 鸡睾丸miRNA | 第63-64页 |
| 4.5.3 鸡精子活力相关的miRNA | 第64-65页 |
| 4.5.4 鸡精子活力相关的信号通路 | 第65页 |
| 4.6 小结 | 第65-66页 |
| 第五章 鸡精子活力相关mRNA-miRNA-lncRNA联合分析 | 第66-74页 |
| 5.1 引言 | 第66页 |
| 5.2 试验材料 | 第66页 |
| 5.3 试验方法 | 第66-67页 |
| 5.3.1 lncRNA、mRNA和miRNA靶向结合预测 | 第66-67页 |
| 5.3.2 miRNA-mRNA-lncRNA互作网络构建 | 第67页 |
| 5.3.3 蛋白质网络互作分析 | 第67页 |
| 5.4 试验结果 | 第67-71页 |
| 5.4.1 lncRNA、mRNA和miRNA靶向结合预测 | 第67页 |
| 5.4.2 mRNA-miRNA-lncRNA互作网络构建 | 第67-70页 |
| 5.4.3 蛋白质互作网络构建 | 第70-71页 |
| 5.5 讨论 | 第71-73页 |
| 5.5.1 mRNA-miRNA-lncRNA联合分析 | 第71-72页 |
| 5.5.2 参与精子活力的mRNA-miRNA-lncRNA通路 | 第72页 |
| 5.5.3 蛋白质互作网络分析 | 第72-73页 |
| 5.6 小结 | 第73-74页 |
| 第六章 全文结论 | 第74-76页 |
| 6.1 本研究主要结论 | 第74页 |
| 6.2 本研究的创新点 | 第74页 |
| 6.3 展望 | 第74-76页 |
| 参考文献 | 第76-90页 |
| 致谢 | 第90-92页 |
| 附表 | 第92-112页 |
| 个人简介 | 第112页 |
