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大肠杆菌DeaD蛋白影响mRNA水平

摘要第4-6页
abstract第6-7页
符号说明第10-11页
第一章 大肠杆菌核糖核酸酶RNaseE的研究进展(文献综述)第11-24页
    1.1 核糖核酸酶概述第11-13页
    1.2 RNaseE的发现和命名第13页
    1.3 RNaseE的结构第13-15页
    1.4 RNaseE的功能第15-21页
        1.4.1 RNaseE组装mRNA降解体第15-17页
        1.4.2 RNaseE降解RNA的机制第17页
        1.4.3 RNaseE参与5SrRNA的合成第17-18页
        1.4.4 RNaseE参与tRNA的成熟第18-20页
        1.4.5 RNaseE影响细胞分裂第20-21页
    1.5 RNaseE的同源物第21-23页
    1.6 RNaseE定位第23-24页
第二章 大肠杆菌DeaD蛋白影响mRNA水平第24-77页
    2.1 引言第24-26页
        2.1.1 大肠杆菌DeaD-Box解旋酶家族第24页
        2.1.2 大肠杆菌DeaD蛋白第24-25页
        2.1.3 DNA复制起始与基因表达第25页
        2.1.4 研究意义第25-26页
    2.2 实验材料第26-40页
        2.2.1 菌种及质粒第26-27页
        2.2.2 引物第27-29页
        2.2.3 培养基配制第29-31页
        2.2.4 抗生素配制第31-32页
        2.2.5 实验溶液配制第32-39页
        2.2.6 其他试剂第39-40页
    2.3 实验方法第40-55页
        2.3.1 构建质粒第40-43页
        2.3.2 感受态细胞的制备和转化第43-44页
        2.3.3 流式样品的制备第44-45页
        2.3.4 细胞周期参数测定第45-46页
        2.3.5 细菌双杂交第46-47页
        2.3.6 Westernblot实验检测DnaA蛋白表达量第47-49页
        2.3.7 带有His标签蛋白的纯化第49-50页
        2.3.8 细菌总RNA提取第50页
        2.3.9 RT-PCR实验第50-52页
        2.3.10 蛋白与RNA体外孵育实验第52-53页
        2.3.11 单个细胞总蛋白量检测第53-54页
        2.3.12 RNA-seq实验样品制备第54-55页
    2.4 实验结果第55-75页
        2.4.1 deaD基因缺失影响细胞周期第55-60页
        2.4.2 deaD基因缺失使细胞总蛋白表达量增加第60-62页
        2.4.3 ΔdeaD细胞中DnaA蛋白表达量增加第62-63页
        2.4.4 DeaD蛋白与DnaA蛋白没有相互作用第63-64页
        2.4.5 deaD基因缺失使得细胞总RNA含量增加第64-65页
        2.4.6 DeaD蛋白降解RNA依赖ATP第65-67页
        2.4.7 ΔdeaD细胞与野生型细胞转录组表达差异第67-69页
        2.4.8 deaD基因的缺失影响mRNA水平第69-70页
        2.4.9 DeaD非特异性影响DNA聚合酶,核糖体等基因的mRNA第70-72页
        2.4.10 DeaD蛋白特异性影响soxS和fliC等基因的mRNA第72-75页
    2.5 讨论第75-77页
        2.5.1 deaD基因缺失影响细胞周期的可能机制第75页
        2.5.2 DeaD蛋白影响mRNA水平第75-77页
参考文献第77-83页
致谢第83页

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