摘要 | 第4-6页 |
abstract | 第6-7页 |
符号说明 | 第10-11页 |
第一章 大肠杆菌核糖核酸酶RNaseE的研究进展(文献综述) | 第11-24页 |
1.1 核糖核酸酶概述 | 第11-13页 |
1.2 RNaseE的发现和命名 | 第13页 |
1.3 RNaseE的结构 | 第13-15页 |
1.4 RNaseE的功能 | 第15-21页 |
1.4.1 RNaseE组装mRNA降解体 | 第15-17页 |
1.4.2 RNaseE降解RNA的机制 | 第17页 |
1.4.3 RNaseE参与5SrRNA的合成 | 第17-18页 |
1.4.4 RNaseE参与tRNA的成熟 | 第18-20页 |
1.4.5 RNaseE影响细胞分裂 | 第20-21页 |
1.5 RNaseE的同源物 | 第21-23页 |
1.6 RNaseE定位 | 第23-24页 |
第二章 大肠杆菌DeaD蛋白影响mRNA水平 | 第24-77页 |
2.1 引言 | 第24-26页 |
2.1.1 大肠杆菌DeaD-Box解旋酶家族 | 第24页 |
2.1.2 大肠杆菌DeaD蛋白 | 第24-25页 |
2.1.3 DNA复制起始与基因表达 | 第25页 |
2.1.4 研究意义 | 第25-26页 |
2.2 实验材料 | 第26-40页 |
2.2.1 菌种及质粒 | 第26-27页 |
2.2.2 引物 | 第27-29页 |
2.2.3 培养基配制 | 第29-31页 |
2.2.4 抗生素配制 | 第31-32页 |
2.2.5 实验溶液配制 | 第32-39页 |
2.2.6 其他试剂 | 第39-40页 |
2.3 实验方法 | 第40-55页 |
2.3.1 构建质粒 | 第40-43页 |
2.3.2 感受态细胞的制备和转化 | 第43-44页 |
2.3.3 流式样品的制备 | 第44-45页 |
2.3.4 细胞周期参数测定 | 第45-46页 |
2.3.5 细菌双杂交 | 第46-47页 |
2.3.6 Westernblot实验检测DnaA蛋白表达量 | 第47-49页 |
2.3.7 带有His标签蛋白的纯化 | 第49-50页 |
2.3.8 细菌总RNA提取 | 第50页 |
2.3.9 RT-PCR实验 | 第50-52页 |
2.3.10 蛋白与RNA体外孵育实验 | 第52-53页 |
2.3.11 单个细胞总蛋白量检测 | 第53-54页 |
2.3.12 RNA-seq实验样品制备 | 第54-55页 |
2.4 实验结果 | 第55-75页 |
2.4.1 deaD基因缺失影响细胞周期 | 第55-60页 |
2.4.2 deaD基因缺失使细胞总蛋白表达量增加 | 第60-62页 |
2.4.3 ΔdeaD细胞中DnaA蛋白表达量增加 | 第62-63页 |
2.4.4 DeaD蛋白与DnaA蛋白没有相互作用 | 第63-64页 |
2.4.5 deaD基因缺失使得细胞总RNA含量增加 | 第64-65页 |
2.4.6 DeaD蛋白降解RNA依赖ATP | 第65-67页 |
2.4.7 ΔdeaD细胞与野生型细胞转录组表达差异 | 第67-69页 |
2.4.8 deaD基因的缺失影响mRNA水平 | 第69-70页 |
2.4.9 DeaD非特异性影响DNA聚合酶,核糖体等基因的mRNA | 第70-72页 |
2.4.10 DeaD蛋白特异性影响soxS和fliC等基因的mRNA | 第72-75页 |
2.5 讨论 | 第75-77页 |
2.5.1 deaD基因缺失影响细胞周期的可能机制 | 第75页 |
2.5.2 DeaD蛋白影响mRNA水平 | 第75-77页 |
参考文献 | 第77-83页 |
致谢 | 第83页 |