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朱鹮Ⅰ、Ⅱ类MHC多位点单倍型及其适应性进化研究

致谢第5-6页
摘要第6-8页
Abstract第8-10页
第一部分 绪论第19-34页
    1 朱鹮的研究背景第19-24页
        1.1 朱鹮的生物及生态学特征第19页
            1.1.1 朱鹮的生物学特征第19页
            1.1.2 朱鹮的生态习性第19页
        1.2 朱鹮的生存历史及保护现状第19-22页
            1.2.1 朱鹮的历史生存危机第20页
            1.2.2 朱鹮物种的保护工作第20-22页
        1.3 朱鹮的分子层次研究第22-24页
    2 主要组织相容性复合体(MHC)第24-32页
        2.1 MHC基因的分类、结构及功能第24-25页
        2.2 MHC基因的进化第25-27页
            2.2.1 MHC基因的进化机制第25-26页
            2.2.2 基因复制第26-27页
        2.3 MHC基因的多态性第27-29页
            2.3.1 多态性维持机制第27-28页
            2.3.2 选择作用的检测方式第28页
            2.3.3 瓶颈效应对多态性的影响第28-29页
        2.4 MHC在鸟类及单倍型水平的研究第29-30页
            2.4.1 鸟类的MHC研究第29页
            2.4.2 MHC单倍型的研究第29-30页
        2.5 MHC在保护遗传学中的意义及应用第30-32页
    3 微卫星标记及其应用第32-33页
    4 立论依据、研究目的及内容第33-34页
第二部分 研究内容第34-112页
    5 朱鹮MHC Ⅰ类基因的研究第34-69页
        5.1 材料第34-36页
            5.1.1 样品第34页
            5.1.2 主要试剂第34-36页
            5.1.3 主要仪器设备第36页
        5.2 方法第36-44页
            5.2.1 实验思路及流程第36-40页
            5.2.2 各项主要实验的具体操作第40-44页
        5.3 结果第44-60页
            5.3.1 朱鹦基因组DNA的提取结果第44-45页
            5.3.2 朱鹮MHC Ⅰ类基因的种群分型结果第45-49页
            5.3.3 朱鹮MHC Ⅰ类基因的表达检测及cDNA全长获取第49-50页
            5.3.4 朱鹮MHC Ⅰ类基因的序列特征及变异第50-53页
            5.3.5 鸟类MHC Ⅰ类基因的比较第53-58页
            5.3.6 朱鹮MHC Ⅰ类基因的重组与基因转换第58-60页
        5.4 讨论第60-67页
            5.4.1 朱鹮MHC Ⅰ类基因的特征第60-63页
            5.4.2 单个Ⅰ类主要基因的解释机制第63-64页
            5.4.3 朱鹮MHC Ⅰ类基因的进化第64-67页
        5.5 小结第67-69页
    6 朱鹮MHC Ⅱ类基因及多位点单倍型的研究第69-98页
        6.1 材料第69页
            6.1.1 样品第69页
            6.1.2 主要试剂第69页
            6.1.3 主要仪器设备第69页
        6.2 方法第69-76页
            6.2.1 实验思路及流程第69-74页
            6.2.2 各项主要实验的具体操作第74-76页
        6.3 结果第76-88页
            6.3.1 朱鹮MHC Ⅱ类基因的SSCP分型第76-78页
            6.3.2 基于等位基因组合分布的多位点MHC单倍型分析第78-79页
            6.3.3 单倍型间Ⅱ类区的基因组结构差异第79-82页
            6.3.4 朱鹮MHCⅡ类基因的特征第82-84页
            6.3.5 DAB基因exon 2的跨物种进化第84-86页
            6.3.6 重组、基因转换及正向选择第86-88页
        6.4 讨论第88-96页
            6.4.1 朱鹮MHC Ⅱ类基因的序列差异第88-89页
            6.4.2 朱鹮MHC单倍型的进化分析第89-94页
            6.4.3 朱鹮MHC Ⅱ类复制基因的两种进化命运第94-95页
            6.4.4 基因转换第95-96页
        6.5 小结第96-98页
    7 MHC单倍型与微卫星标记结合的朱鹮种群分析第98-112页
        7.1 材料第98页
            7.1.1 样品第98页
            7.1.2 主要试剂第98页
            7.1.3 主要仪器设备第98页
        7.2 方法第98-103页
            7.2.1 实验思路及流程第98-100页
            7.2.2 各项主要实验的操作步骤第100-103页
        7.3 结果第103-107页
            7.3.1 朱鹮种群内的遗传多样性第103-104页
            7.3.2 朱鹮种群分化第104-106页
            7.3.3 朱鹮种群分化在MHC和微卫星间的比较第106-107页
        7.4 讨论第107-111页
            7.4.1 MHC单倍型间潜在的免疫功能差异第107-108页
            7.4.2 朱鹦种群的低水平多样性第108-109页
            7.4.3 目前的朱鹮种群结构第109-110页
            7.4.4 物种保护及管理意见第110-111页
        7.5 小结第111-112页
第三部分 结论第112-115页
    8 主要结论、创新点及展望第112-115页
        8.1 主要结论第112-113页
        8.2 创新点第113-114页
        8.3 展望第114-115页
参考文献第115-138页
作者简历第138页

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