摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第1章 绪论 | 第10-22页 |
1.1 蛋白质结构与结构数据库 | 第10-13页 |
1.1.1 蛋白质结构层次与分类 | 第10-12页 |
1.1.2 蛋白质结构数据库 | 第12-13页 |
1.2 蛋白质折叠类型分类研究 | 第13-18页 |
1.2.1 蛋白质折叠类型分类数据库 | 第13-16页 |
1.2.2 蛋白质折叠类型的识别与分类方法 | 第16-18页 |
1.3 α/β类蛋白质折叠类型研究 | 第18-20页 |
1.3.1 α/β类蛋白质折叠类型的构建模式 | 第18页 |
1.3.2 α/β类蛋白质折叠类型分类 | 第18-20页 |
1.4 课题来源及意义 | 第20-22页 |
第2章 α/β类蛋白质折叠类型的多模板分类方法研究 | 第22-38页 |
2.1 引言 | 第22-23页 |
2.2 材料的选择 | 第23-31页 |
2.2.1 实验集及模板蛋白的选择 | 第23-27页 |
2.2.2 模板特征参数的提取 | 第27-31页 |
2.3 方法 | 第31-32页 |
2.3.1 打分函数的建立 | 第31-32页 |
2.3.2 Multi-Fscore 分类方法 | 第32页 |
2.3.3 评估参数 | 第32页 |
2.4 结果及讨论 | 第32-36页 |
2.4.1 对 LIFCA 数据库中α/β类蛋白质的检验 | 第32-33页 |
2.4.2 与 TM-score 进行比较 | 第33-35页 |
2.4.3 模板结构的不规则性对分类结构的影响 | 第35页 |
2.4.4 排异性检验 | 第35-36页 |
2.5 本章小结 | 第36-38页 |
第3章 α/β类蛋白质折叠类型的单模板分类方法研究 | 第38-48页 |
3.1 引言 | 第38页 |
3.2 材料 | 第38-40页 |
3.2.1 实验样本集及模板蛋白的选择 | 第38-40页 |
3.2.2 模板特征参数的确定与提取 | 第40页 |
3.3 方法 | 第40-42页 |
3.4 结果与讨论 | 第42-46页 |
3.5 本章小结 | 第46-48页 |
结论与展望 | 第48-50页 |
1. α/β 类蛋白质折叠类型模板数据库的构建 | 第48页 |
2. α/β 类蛋白质折叠类型分类方法的建立与评估 | 第48页 |
3. α/β 类蛋白质折叠类型的单模板分类方法研究 | 第48-49页 |
4. α/β 类蛋白质折叠类型分类方法存在的问题 | 第49-50页 |
参考文献 | 第50-56页 |
附录 | 第56-60页 |
攻读硕士学位期间所发表的学术论文 | 第60页 |
攻读硕士学位期间参加的科研项目 | 第60-62页 |
致谢 | 第62页 |