| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第1章 前言 | 第10-45页 |
| 1.1 DNA简介 | 第10-13页 |
| 1.1.1 DNA的多级结构 | 第10页 |
| 1.1.2 长链DNA的弹性 | 第10-13页 |
| 1.2 解旋酶 | 第13-18页 |
| 1.2.1 解旋酶的分类 | 第13页 |
| 1.2.2 Pif1解旋酶 | 第13-14页 |
| 1.2.3 RecQ和BLM解旋酶 | 第14-18页 |
| 1.3 单分子技术 | 第18-32页 |
| 1.3.1 单分子磁镊 | 第18-20页 |
| 1.3.2 单分子荧光共振能量转移(smFRET) | 第20-24页 |
| 1.3.3 其他单分子技术 | 第24-29页 |
| 1.3.4 单分子技术的联用 | 第29-32页 |
| 1.4 新型横向磁镊的搭建 | 第32-43页 |
| 1.4.1 引言 | 第32-33页 |
| 1.4.2 材料与方法 | 第33-36页 |
| 1.4.3 结果与讨论 | 第36-42页 |
| 1.4.4 结论 | 第42-43页 |
| 1.5 本文的主要工作 | 第43-45页 |
| 第2章 材料与方法 | 第45-51页 |
| 2.1 | 第45-51页 |
| 2.1.1 DNA序列及退火流程 | 第45-46页 |
| 2.1.2 蛋白质表达和纯化 | 第46-47页 |
| 2.1.3 样品和数据采集 | 第47页 |
| 2.1.4 计算纳米张力器的力 | 第47-48页 |
| 2.1.5 寻找台阶的无偏算法 | 第48-49页 |
| 2.1.6 分辨台阶的能力 | 第49页 |
| 2.1.7 对解旋过程的蒙特卡罗模拟 | 第49-51页 |
| 第3章 高精度smFRET的设计 | 第51-60页 |
| 3.1 引言 | 第51-53页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第53-59页 |
| 3.2.1 以传统叉形DNA为底物 | 第53-54页 |
| 3.2.2 纳米张力器的设计 | 第54-55页 |
| 3.2.3 纳米张力器实现单碱基分辨 | 第55-59页 |
| 3.3 结论 | 第59-60页 |
| 第4章 高精度smFRET研究Pif1和RecQ的步进解旋动理学 | 第60-68页 |
| 4.1 引言 | 第60页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第60-66页 |
| 4.2.1 0pN条件下,Pif1和RecQ解旋DNA的步长不均一 | 第60-64页 |
| 4.2.2 6pN条件下,Pif1的步长是均一的1bp | 第64-66页 |
| 4.2.3 6pN条件下,RecQ的步长不均一 | 第66页 |
| 4.3 结论 | 第66-68页 |
| 第5章 高精度smFRET研究BLM步进及对应过程的结构分析 | 第68-82页 |
| 5.1 引言 | 第68-69页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第69-81页 |
| 5.2.1 BLM的解旋结果符合“打开-释放”的步进模型 | 第69-70页 |
| 5.2.2 BLM和DNA的3'端有多个结构 | 第70-74页 |
| 5.2.3 BLM和DNA的5'端具有相互作用 | 第74-77页 |
| 5.2.4 BLM的几个单点突变使结构和解旋发生改变 | 第77-80页 |
| 5.2.5 BLM的解旋模型图 | 第80页 |
| 5.2.6 RecQ也有解旋模型对应的多个结构 | 第80-81页 |
| 5.3 结论 | 第81-82页 |
| 第6章 解旋酶步进的定量统一模型 | 第82-95页 |
| 6.1 引言 | 第82页 |
| 6.2 结果与讨论 | 第82-93页 |
| 6.2.1 步进解旋模型 | 第82-85页 |
| 6.2.2 模型在单条DNA链上一个特殊条件下的解析解 | 第85-88页 |
| 6.2.3 模型与多个解旋酶在不同条件下的数据吻合 | 第88-93页 |
| 6.2.4 模型重现解旋的步进过程 | 第93页 |
| 6.3 结论 | 第93-95页 |
| 第7章 结论 | 第95-97页 |
| 参考文献 | 第97-107页 |
| 附录 | 第107-108页 |
| 个人简历及发表文章目录 | 第108-111页 |
| 致谢 | 第111页 |
