| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 缩略词表 | 第10-13页 |
| 第1章 文献综述 | 第13-33页 |
| 1.1 传统遗传评估方法概述 | 第13-19页 |
| 1.1.1 选择指数法 | 第15-16页 |
| 1.1.2 最佳线性无偏预测BLUP | 第16-18页 |
| 1.1.3 标记辅助选择 | 第18-19页 |
| 1.2 全基因组选择概述 | 第19-28页 |
| 1.2.1 全基因组选择的原理 | 第19-20页 |
| 1.2.2 全基因组选择的方法 | 第20-25页 |
| 1.2.3 全基因组选择的研究进展 | 第25-27页 |
| 1.2.4 全基因组选择的影响因素及其优势 | 第27-28页 |
| 1.3 社会性遗传效应概述 | 第28-32页 |
| 1.3.1 社会性遗传效应的研究进展 | 第29-32页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第32-33页 |
| 第2章 利用特定的父系、母系优化肉牛生产系统 | 第33-47页 |
| 2.1 引言 | 第33页 |
| 2.2 材料和方法 | 第33-42页 |
| 2.2.1 杂交生产系统 | 第33-35页 |
| 2.2.2 生物模型的描述 | 第35-42页 |
| 2.3 结果 | 第42-44页 |
| 2.4 讨论 | 第44-46页 |
| 2.5 小结 | 第46-47页 |
| 第3章 在控制近交(情况)下利用遗传算法优化社会性遗传效应的选择进展 | 第47-60页 |
| 3.1 引言 | 第47页 |
| 3.2 材料与方法 | 第47-52页 |
| 3.2.1 数据模拟 | 第47-49页 |
| 3.2.2 统计模型 | 第49-51页 |
| 3.2.3 选择准确率和选择反应 | 第51页 |
| 3.2.4 控制近交率 | 第51-52页 |
| 3.2.5 选择方案的比较 | 第52页 |
| 3.3 结果 | 第52-56页 |
| 3.3.1 不同方案近交水平和选择反应的比较 | 第52-55页 |
| 3.3.2 EBV和平均关系间的权重率对优化方案的影响 | 第55页 |
| 3.3.3 社会性遗传效应大小对优化方案的影响 | 第55页 |
| 3.3.4 群体大小对优化方案的影响 | 第55-56页 |
| 3.4 讨论 | 第56-57页 |
| 3.5 小结 | 第57-60页 |
| 第4章 基于低密度SNP芯片的肉牛生长性状MAS遗传评估方法的构建 | 第60-71页 |
| 4.1 引言 | 第60-61页 |
| 4.2 材料和方法 | 第61-64页 |
| 4.2.1 基因型和表型数据 | 第61页 |
| 4.2.2 SNP标记的过滤 | 第61-62页 |
| 4.2.3 SNP与性状的关联检验 | 第62页 |
| 4.2.4 标记分值(marker score)的计算 | 第62页 |
| 4.2.5 标记辅助评估模型构建 | 第62-63页 |
| 4.2.6 选择效力评估 | 第63-64页 |
| 4.3 结果 | 第64-67页 |
| 4.3.1 关联分析结果 | 第64-65页 |
| 4.3.2 标记分值和表型值的遗传参数 | 第65页 |
| 4.3.3 MABLUP与CBLUP的预测准确性评估 | 第65-67页 |
| 4.4 讨论 | 第67-70页 |
| 4.4.1 模型的可行性 | 第67-68页 |
| 4.4.2 SNP标记效应的验证 | 第68-69页 |
| 4.4.3 表型数据对预测准确性的影响 | 第69-70页 |
| 4.4.4 TMAE的适用范围 | 第70页 |
| 4.5 小结 | 第70-71页 |
| 第5章 一种肉牛剩余采食量和胴体品质的全基因组遗传改良模型的构建 | 第71-81页 |
| 5.1 引言 | 第71-72页 |
| 5.2 实验材料和方法 | 第72-75页 |
| 5.2.1 表型和基因型数据 | 第72-73页 |
| 5.2.2 SNP标记过滤 | 第73页 |
| 5.2.3 关联分析(The association test) | 第73-74页 |
| 5.2.4 标记值的计算 | 第74页 |
| 5.2.5 双性状辅助评价模型的构建 | 第74-75页 |
| 5.2.6 评价MABLUP的选择效率 | 第75页 |
| 5.3 结果 | 第75-78页 |
| 5.3.1 关联分析结果 | 第75-76页 |
| 5.3.2 标记值和表型的遗传参数 | 第76-77页 |
| 5.3.3 MABLUP和CBLUP的精度 | 第77-78页 |
| 5.4 讨论 | 第78-80页 |
| 5.4.1 模型的影响因素 | 第78-79页 |
| 5.4.2 MABLUP模型的实施 | 第79页 |
| 5.4.3 肉牛群体基因组选择效率 | 第79-80页 |
| 5.5 小结 | 第80-81页 |
| 第6章 结论与创新点 | 第81-82页 |
| 6.1 结论 | 第81页 |
| 6.2 本文创新之处 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-90页 |
| 致谢 | 第90-91页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第91页 |
