| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 前言 | 第12-22页 |
| 1.1 系统发育学及其研究进展 | 第12-14页 |
| 1.1.1 系统发育学概述 | 第12-14页 |
| 1.1.2 系统发育学研究方法 | 第14页 |
| 1.2 生物信息学 | 第14-16页 |
| 1.3 海胆的研究现状 | 第16-22页 |
| 1.3.1 海胆目前形态学研究概况 | 第16-18页 |
| 1.3.2 线粒体及其基因组 | 第18-20页 |
| 1.3.3 海胆纲线粒体基因组研究现状 | 第20页 |
| 1.3.4 本次研究的目的及意义 | 第20-22页 |
| 第二章 两种角孔海胆和两种刻肋海胆的形态学研究 | 第22-47页 |
| 2.1 材料与方法 | 第23-25页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第23页 |
| 2.1.2 样品处理 | 第23-24页 |
| 2.1.3 扫描电子显微镜 | 第24-25页 |
| 2.2 两种角孔海胆的形态学研究 | 第25-37页 |
| 2.2.1 杂色角孔海胆Salmacis sphaeroides variegata Mortensen,1942 | 第26-31页 |
| 2.2.2 疏棘角孔海胆Salmacis bicolor rarispina L.Agassiz,1846 | 第31-37页 |
| 2.3 两种刻肋海胆的形态学研究 | 第37-45页 |
| 2.3.1 哈氏刻肋海胆Temnopleurus hardwickii(Gray,1855) | 第37-42页 |
| 2.3.2 细雕刻肋海胆Temnopleurus toreumaticus(Leske,1778) | 第42-45页 |
| 2.4 讨论 | 第45-47页 |
| 第三章 杂色角孔海胆的线粒体基因组全序测定及组成分析 | 第47-57页 |
| 3.1 实验材料 | 第47页 |
| 3.2 实验方法与步骤 | 第47-49页 |
| 3.2.1 DNA的提取 | 第47-48页 |
| 3.2.2 引物设计 | 第48页 |
| 3.2.3 PCR扩增、产物检测与纯化 | 第48-49页 |
| 3.3 数据分析 | 第49-50页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第50-57页 |
| 3.4.1 杂色角孔海胆的线粒体基因组组成 | 第50-51页 |
| 3.4.2 碱基组成及结构分析 | 第51-54页 |
| 3.4.3 蛋白质编码基因 | 第54-56页 |
| 3.4.4 rRNA基因和tRNA基因 | 第56页 |
| 3.4.5 非编码区 | 第56-57页 |
| 第四章 疏棘角孔海胆的线粒体基因组全序测定及组成分析 | 第57-65页 |
| 4.1 实验材料 | 第57页 |
| 4.2 实验方法与步骤 | 第57页 |
| 4.2.1 DNA的提取 | 第57页 |
| 4.2.2 引物设计 | 第57页 |
| 4.2.3 PCR扩增、产物检测与纯化 | 第57页 |
| 4.3 数据分析 | 第57-58页 |
| 4.4 结果与讨论 | 第58-65页 |
| 4.4.1 疏棘角孔海胆的线粒体基因组组成 | 第58-59页 |
| 4.4.2 碱基组成及结构分析 | 第59-62页 |
| 4.4.3 蛋白质编码基因 | 第62-64页 |
| 4.4.4 rRNA基因和tRNA基因 | 第64页 |
| 4.4.5 非编码区 | 第64-65页 |
| 第五章 基于海胆线粒体基因组全序列及各基因片段的系统发育分析 | 第65-73页 |
| 5.1 实验材料 | 第65页 |
| 5.2 数据处理 | 第65-66页 |
| 5.2.1 线粒体基因序列多态分析 | 第65页 |
| 5.2.2 系统发育分析 | 第65-66页 |
| 5.3 结果分析 | 第66-73页 |
| 5.3.1 2种角孔海胆的线粒体基囚序列多态分析 | 第66-67页 |
| 5.3.2 基于13种海胆线粒体基因全序的系统发育分析 | 第67-68页 |
| 5.3.3 基于蛋白质编码基因的系统发育分析 | 第68-70页 |
| 5.3.4 基于核糖体RNA的系统发育分析 | 第70-71页 |
| 5.3.5 基于22个tRNA的系统发育分析 | 第71-73页 |
| 第六章 总结 | 第73-76页 |
| 6.1 形态学研究 | 第73-74页 |
| 6.2 基于线粒体基因组全序的系统发育分析 | 第74-76页 |
| 参考文献 | 第76-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 个人简历及发表的学术论文 | 第84页 |
