| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略语表 | 第12-13页 |
| 1 文献综述 | 第13-35页 |
| 1.1 植物异源多倍体研究进展 | 第13-23页 |
| 1.1.1 遗传学变化 | 第13-14页 |
| 1.1.2 表观遗传学变化 | 第14-16页 |
| 1.1.3 基因表达变化 | 第16-23页 |
| 1.1.3.1 部分同源偏向表达 | 第16-18页 |
| 1.1.3.2 表达水平显性 | 第18-21页 |
| 1.1.3.3 基因组偏向性表达的可能机制 | 第21-23页 |
| 1.2 芸薹属多倍体研究进展 | 第23-32页 |
| 1.2.1 芸薹属的起源 | 第23-25页 |
| 1.2.2 多倍化早期遗传、表观遗传、基因表达变化 | 第25-27页 |
| 1.2.3 基因组间序列比较 | 第27-29页 |
| 1.2.4 核仁显性现象 | 第29-30页 |
| 1.2.5 远缘杂交过程中染色体消除 | 第30-31页 |
| 1.2.6 人工合成种多倍体在种质创新中的应用 | 第31-32页 |
| 1.3 转录组测序简介 | 第32-33页 |
| 1.4 本研究的内容、目的与意义 | 第33-35页 |
| 2 合成芸薹属异源四倍体转录组研究 | 第35-56页 |
| 2.1 引言 | 第35页 |
| 2.2 材料与方法 | 第35-39页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第35页 |
| 2.2.2 RNA-seq文库构建和测序 | 第35-36页 |
| 2.2.3 测序数据的处理与比对 | 第36页 |
| 2.2.4 差异表达基因分析 | 第36-37页 |
| 2.2.5 核糖体蛋白基因分析 | 第37页 |
| 2.2.6 q RT-PCR分析 | 第37-38页 |
| 2.2.7 补充数据 | 第38-39页 |
| 2.3 结果与分析 | 第39-51页 |
| 2.3.1 转录本比对和总体基因表达情况 | 第39页 |
| 2.3.2 异源四倍体差异表达基因筛选 | 第39-42页 |
| 2.3.3 超亲表达基因分析 | 第42-44页 |
| 2.3.4 异源四倍体中共有的超亲表达基因 | 第44-45页 |
| 2.3.5 异源四倍体中基因沉默和新基因的表达 | 第45-48页 |
| 2.3.6 人工合成甘蓝型油菜差异基因分析 | 第48页 |
| 2.3.7 核糖体蛋白基因表达分析 | 第48-50页 |
| 2.3.8 q RT-PCR对差异表达基因进行验证 | 第50-51页 |
| 2.4 讨论 | 第51-55页 |
| 2.4.1 多倍化过程中基因超亲表达的影响 | 第51-52页 |
| 2.4.2 基因沉默和新表达呈负相关 | 第52-53页 |
| 2.4.3 细胞质对基因表达的影响 | 第53页 |
| 2.4.4 核糖体蛋白基因组织特异性表达 | 第53-55页 |
| 2.5 总结 | 第55页 |
| 2.6 展望 | 第55-56页 |
| 3 分离白菜遗传图谱的构建与比较 | 第56-65页 |
| 3.1 引言 | 第56页 |
| 3.2 材料与方法 | 第56-59页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第56页 |
| 3.2.2 DNA的提取 | 第56-57页 |
| 3.2.3 多态性引物的筛选与扩增 | 第57-58页 |
| 3.2.4 扩增产物的电泳检测 | 第58页 |
| 3.2.5 连锁图谱的构建与比较 | 第58-59页 |
| 3.3 结果与分析 | 第59-63页 |
| 3.3.1 遗传图谱的构建 | 第59-60页 |
| 3.3.2 遗传图谱的比较 | 第60-63页 |
| 3.4 讨论 | 第63-64页 |
| 3.5 展望 | 第64-65页 |
| 4 合成甘蓝型油菜杂种转录组研究 | 第65-85页 |
| 4.1 引言 | 第65-66页 |
| 4.2 材料和方法 | 第66-69页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第66页 |
| 4.2.2 RNA提取和文库构建 | 第66页 |
| 4.2.3 测序数据的处理和比对 | 第66-67页 |
| 4.2.4 差异基因分析 | 第67页 |
| 4.2.5 补充数据 | 第67-69页 |
| 4.3 结果与分析 | 第69-80页 |
| 4.3.1 甘蓝型油菜杂种中差异和非加性基因表达 | 第69页 |
| 4.3.2 合成杂种间差异基因比较 | 第69-71页 |
| 4.3.3 基因表达模式分类 | 第71-74页 |
| 4.3.4 基因表达水平显性 | 第74-78页 |
| 4.3.5 部分同源基因偏向表达 | 第78-80页 |
| 4.4 讨论 | 第80-84页 |
| 4.4.1 合成杂种中加性表达普遍存在 | 第80页 |
| 4.4.2 表达水平显性存在平衡 | 第80-81页 |
| 4.4.3 部分同源基因表达模式得以保留 | 第81-82页 |
| 4.4.4 杂种中基因表达模式较为保守 | 第82页 |
| 4.4.5 驯化过程中基因组表达平衡得以维持 | 第82-84页 |
| 4.5 总结 | 第84页 |
| 4.6 展望 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-96页 |
| 附录Ⅰ | 第96-119页 |
| 附录Ⅱ | 第119-120页 |
| 致谢 | 第120-122页 |