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甘蓝型油菜低温诱导的转录组和蛋白组分析

摘要第7-10页
Abstract第10-12页
缩略语表第13-14页
1 文献综述第14-31页
    1.1 低温对植物的影响第14-16页
        1.1.1 冷害对植物的影响第14-15页
        1.1.2 冻害对植物的影响第15-16页
    1.2 植物响应低温的信号转导途径第16-21页
        1.2.1 植物对低温的感知第17-18页
        1.2.2 ABA依赖的低温信号转导途径第18-19页
        1.2.3 依赖于CBF的低温信号转导途径第19-20页
        1.2.4 其他低温信号转导途径第20-21页
    1.3 植物对低温胁迫的响应机制第21-28页
        1.3.1 植物形态发育对低温胁迫的响应第21-22页
        1.3.2 植物生理生化对低温胁迫的响应第22-23页
        1.3.3 植物转录因子对低温胁迫的响应第23-27页
        1.3.4 植物蛋白质对低温胁迫的响应第27-28页
    1.4 油菜对低温胁迫响应的研究进展第28-30页
    1.5 本研究的目的和意义第30-31页
2 材料和方法第31-38页
    2.1 材料第31页
    2.2 实验方法第31-38页
        2.2.1 叶片总DNA提取第31页
        2.2.2 叶片总RNA提取第31-32页
        2.2.3 叶绿素含量测定第32页
        2.2.4 可溶性糖含量测定第32-33页
        2.2.5 脯氨酸测定第33页
        2.2.6 电导率测定第33页
        2.2.7 半薄切片第33-34页
        2.2.8 透射电镜第34页
        2.2.9 转录组数据分析第34-35页
        2.2.10 转录因子数据分析第35页
        2.2.11 蛋白组数据分析第35-36页
        2.2.12 转录组与蛋白组数据关联分析第36页
        2.2.13 PCR反应第36页
        2.2.14 Real time PCR第36-38页
3 结果与分析第38-84页
    3.1 甘蓝型油菜植株形态及叶片发育对低温胁迫的响应第38-42页
        3.1.1 低温胁迫下的植株形态发育观察第38页
        3.1.2 低温胁迫下的半薄切片观察第38-40页
        3.1.3 低温胁迫下的透射电镜观察第40-42页
    3.2 甘蓝型油菜生理生化对低温胁迫的响应第42-45页
        3.2.1 甘蓝型油菜细胞膜对低温胁迫的响应第42-43页
        3.2.2 叶片脯氨酸含量对低温胁迫的响应第43页
        3.2.3 叶片可溶性糖含量对低温胁迫的响应第43-44页
        3.2.4 叶片叶绿素含量对低温胁迫的响应第44-45页
    3.3 甘蓝型油菜低温诱导的转录组分析第45-53页
        3.3.1 RNA-Seq数据分析第45-46页
        3.3.2 基因功能预测与分类第46-47页
        3.3.3 差异表达基因分析第47-51页
        3.3.4 差异表达基因GO功能注释第51页
        3.3.5 差异表达基因通路分析第51-53页
    3.4 甘蓝型油菜低温诱导的AP2/ERF转录因子分析第53-66页
        3.4.1 低温诱导的转录因子类型分析第53页
        3.4.2 低温诱导的AP2/ERF转录因子挖掘第53-58页
        3.4.3 AP2/ERF转录因子聚类第58-59页
        3.4.4 AP2/ERF转录因子染色体定位第59-61页
        3.4.5 AP2/ERF转录因子功能分析第61-62页
        3.4.6 AP2/ERF转录因子调控特性第62-66页
    3.5 甘蓝型油菜低温诱导的蛋白组分析第66-76页
        3.5.1 蛋白质鉴定第66-69页
        3.5.2 蛋白质定量分析第69-73页
        3.5.3 蛋白质差异表达分析第73-76页
    3.6 甘蓝型油菜低温诱导的转录组与蛋白组关联分析第76-84页
        3.6.1 关联数量关系第76-77页
        3.6.2 表达趋势相同的差异基因分析第77-80页
        3.6.3 表达趋势相反的差异基因分析第80-84页
4 讨论第84-90页
    4.1 早期低温胁迫影响油菜的形态及生理生化指标第84-85页
    4.2 大量未知功能基因和蛋白在油菜响应低温胁迫中发挥作用第85-86页
    4.3 AP2/ERF转录因子在植物响应低温胁迫中起调控作用第86-88页
    4.4 植物低温胁迫应答是一个动态的调控过程第88-89页
    4.5 植物抗寒调控机制是一个复杂的生命过程第89-90页
参考文献第90-107页
致谢第107-109页
附录1. 作者简介和研究生阶段发表的文章第109-110页
附录2. 转录组分析的相关数据第110-112页
附录3. AP2/ERF转录因子分析的相关数据第112-117页

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