| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩写词 | 第7-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-26页 |
| 1.1 研究意义 | 第13页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第13-23页 |
| 1.2.1 牛心朴子研究进展 | 第13-14页 |
| 1.2.2 植物干旱响应基因研究进展 | 第14-16页 |
| 1.2.3 植物抗冷基因研究进展 | 第16-17页 |
| 1.2.4 转录组学在植物干旱、低温胁迫研究中的应用 | 第17-20页 |
| 1.2.5 转录因子NF-Y的研究进展 | 第20-22页 |
| 1.2.6 EDS1基因的研究进展 | 第22-23页 |
| 1.3 研究目的与技术路线 | 第23-26页 |
| 1.3.1 研究目的 | 第23-24页 |
| 1.3.2 技术路线 | 第24-26页 |
| 第二章 牛心朴子干旱胁迫响应转录组分析 | 第26-49页 |
| 2.0 引言 | 第26页 |
| 2.1 材料与仪器 | 第26-27页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第26页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第26-27页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第27页 |
| 2.2 实验方法 | 第27页 |
| 2.2.1 样品RNA提取与检测 | 第27页 |
| 2.2.2 文库的构建及测序 | 第27页 |
| 2.3 测序数据的分析 | 第27-29页 |
| 2.3.1 测序数据质量评估 | 第27页 |
| 2.3.2 转录本的组装 | 第27页 |
| 2.3.3 基因功能注释 | 第27页 |
| 2.3.4 CDS预测 | 第27-28页 |
| 2.3.5 SSR分析 | 第28页 |
| 2.3.6 差异基因富集分析 | 第28页 |
| 2.3.7 差异基因验证 | 第28-29页 |
| 2.3.8 扫描电镜分析 | 第29页 |
| 2.4 结果与分析 | 第29-45页 |
| 2.4.1 牛心朴子RNA质量检测 | 第29-30页 |
| 2.4.2 测序数据质量 | 第30页 |
| 2.4.3 转录本拼接统计 | 第30-31页 |
| 2.4.4 基因功能注释 | 第31-35页 |
| 2.4.5 CDS预测结果 | 第35页 |
| 2.4.6 SSR分析结果 | 第35-37页 |
| 2.4.7 基因差异表达分析 | 第37-38页 |
| 2.4.8 差异基因GO富集分析 | 第38-39页 |
| 2.4.9 差异基因KEGG富集分析 | 第39-40页 |
| 2.4.10 差异基因Real-time PCR验证 | 第40-41页 |
| 2.4.11 牛心朴子响应干旱的差异表达基因 | 第41-42页 |
| 2.4.12 参与角质层蜡质生物合成的差异基因 | 第42-45页 |
| 2.4.13 牛心朴子扫描电镜分析 | 第45页 |
| 2.5 讨论 | 第45-49页 |
| 2.5.1 转录组测序分析 | 第45-46页 |
| 2.5.2 牛心朴子响应干旱胁迫的差异基因 | 第46-47页 |
| 2.5.3 角质层蜡质生物合成与植物抗旱性 | 第47-49页 |
| 第三章 牛心朴子低温胁迫响应转录组分析 | 第49-72页 |
| 3.0 引言 | 第49页 |
| 3.1 材料与仪器 | 第49-50页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第49页 |
| 3.1.2 实验试剂 | 第49页 |
| 3.1.3 实验仪器 | 第49-50页 |
| 3.2 实验方法 | 第50页 |
| 3.2.1 样品RNA提取与检测 | 第50页 |
| 3.2.2 文库的构建及测序 | 第50页 |
| 3.3 测序数据的分析 | 第50-51页 |
| 3.3.1 测序数据质量评估 | 第50页 |
| 3.3.2 转录本的组装 | 第50页 |
| 3.3.3 基因功能注释 | 第50页 |
| 3.3.4 SSR分析 | 第50页 |
| 3.3.5 差异基因富集分析 | 第50页 |
| 3.3.6 差异基因Real-time PCR验证 | 第50-51页 |
| 3.3.7 透射电镜分析 | 第51页 |
| 3.4 结果与分析 | 第51-69页 |
| 3.4.1 牛心朴子低温胁迫下的结构变化 | 第51-52页 |
| 3.4.2 牛心朴子RNA质量检测 | 第52-53页 |
| 3.4.3 测序数据质量 | 第53页 |
| 3.4.4 转录本拼接统计 | 第53-54页 |
| 3.4.5 基因功能注释 | 第54-58页 |
| 3.4.6 SSR分析 | 第58-60页 |
| 3.4.7 基因差异表达分析 | 第60-61页 |
| 3.4.8 差异基因GO富集分析 | 第61-62页 |
| 3.4.9 差异基因KEGG富集分析 | 第62-67页 |
| 3.4.10 牛心朴子响应低温的转录因子分析 | 第67-69页 |
| 3.4.11 差异基因Real-time PCR验证 | 第69页 |
| 3.5 讨论 | 第69-72页 |
| 3.5.1 转录组测序分析 | 第69-70页 |
| 3.5.2 牛心朴子响应低温胁迫的差异基因分析 | 第70-72页 |
| 第四章 调控牛心朴子抗旱响应转录因子CkNF-YB1的克隆及其功能鉴定 | 第72-91页 |
| 4.1 引言 | 第72页 |
| 4.2 材料与方法 | 第72-77页 |
| 4.2.1 植物材料 | 第72页 |
| 4.2.2 试剂与仪器 | 第72-73页 |
| 4.2.3 菌株及质粒 | 第73页 |
| 4.2.4 转录因子CkNF-YB1克隆 | 第73-74页 |
| 4.2.5 CkNF-YB1的序列分析 | 第74页 |
| 4.2.6 Real-time PCR分析基因表达特征 | 第74-75页 |
| 4.2.7 CkNF-YB1的亚细胞定位 | 第75页 |
| 4.2.8 CkNF-YB1转录激活验证 | 第75页 |
| 4.2.9 拟南芥突变体基因型鉴定 | 第75-76页 |
| 4.2.10 植物表达载体的构建 | 第76页 |
| 4.2.11 转CkNF-YB1基因拟南芥植株的获得 | 第76页 |
| 4.2.12 Real-time PCR检测CkNF-YB1调控转基因拟南芥下游基因的表达 | 第76-77页 |
| 4.2.13 转CkNF-YB1基因拟南芥抗旱性分析 | 第77页 |
| 4.3 结果 | 第77-89页 |
| 4.3.1 转录因子CkNF-YB1的克隆 | 第77-78页 |
| 4.3.2 转录因子CkNF-YB1特征分析 | 第78-79页 |
| 4.3.3 CkNF-YB1进化树构建 | 第79-80页 |
| 4.3.4 CkNF-YB1的表达特征分析 | 第80-81页 |
| 4.3.5 CkNF-YB1的转录激活验证 | 第81-82页 |
| 4.3.6 拟南芥突变体基因型鉴定 | 第82-83页 |
| 4.3.7 植物表达载体的构建及转CkNF-YB1基因拟南芥的筛选、鉴定 | 第83-84页 |
| 4.3.8 CkNF-YB1的亚细胞定位 | 第84页 |
| 4.3.9 转CkNF-YB1基因植株生长发育 | 第84-86页 |
| 4.3.10 转CkNF-YB1基因拟南芥的萌发特性实验 | 第86页 |
| 4.3.11 转CkNF-YB1基因拟南芥的失水率实验 | 第86-87页 |
| 4.3.12 转CkNF-YB1基因拟南芥的干旱胁迫实验 | 第87-88页 |
| 4.3.13 转CkNF-YB1基因拟南芥干旱胁迫响应基因的表达分析 | 第88-89页 |
| 4.4 讨论 | 第89-91页 |
| 第五章 牛心朴子抗病基因CkEDS1的克隆及其功能鉴定 | 第91-103页 |
| 5.1 引言 | 第91页 |
| 5.2 材料与方法 | 第91-94页 |
| 5.2.1 植物材料与菌株 | 第91页 |
| 5.2.2 试剂与仪器 | 第91页 |
| 5.2.3 CkEDS1基因的克隆 | 第91-92页 |
| 5.2.4 CkEDS1的序列分析 | 第92页 |
| 5.2.5 Real-time PCR分析CkEDS1基因表达特征 | 第92页 |
| 5.2.6 CkEDS1的亚细胞定位 | 第92-93页 |
| 5.2.7 拟南芥突变体基因型鉴定 | 第93页 |
| 5.2.8 植物表达载体的构建 | 第93页 |
| 5.2.9 转CkEDS1基因拟南芥植株的获得 | 第93页 |
| 5.2.10 Real-time PCR检测抗病相关基因表达量 | 第93页 |
| 5.2.11 转CkEDS1基因拟南芥抗病性分析 | 第93页 |
| 5.2.12 转CkEDS1基因棉花获得 | 第93-94页 |
| 5.3 结果 | 第94-101页 |
| 5.3.1 CkEDS1基因的克隆 | 第94-95页 |
| 5.3.2 CkEDS1的序列分析 | 第95页 |
| 5.3.3 CkEDS1的进化树构建 | 第95-96页 |
| 5.3.4 CkEDS1的表达特征 | 第96-97页 |
| 5.3.5 拟南芥突变体基因型鉴定 | 第97页 |
| 5.3.6 转CkEDS1基因拟南芥植株的获得 | 第97-98页 |
| 5.3.7 CkEDS1的亚细胞定位 | 第98-99页 |
| 5.3.8 转CkEDS1基因植株抗病性分析 | 第99-100页 |
| 5.3.9 转CkEDS1基因拟南芥抗病基因的表达分析 | 第100-101页 |
| 5.3.10 转CkEDS1基因棉花抗病性分析 | 第101页 |
| 5.4 讨论 | 第101-103页 |
| 第六章 结论 | 第103-105页 |
| 6.1 牛心朴子干旱胁迫转录组分析 | 第103页 |
| 6.2 牛心朴子低温胁迫转录组分析 | 第103页 |
| 6.3 调控牛心朴子抗旱响应转录因子CkNF-YB1的克隆及其功能鉴定 | 第103-104页 |
| 6.4 牛心朴子抗病基因CkEDS1的克隆及其功能鉴定 | 第104页 |
| 6.5 创新点 | 第104-105页 |
| 参考文献 | 第105-118页 |
| 致谢 | 第118-119页 |
| 个人简介 | 第119页 |
