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基于橄榄果实转录组的多酚代谢相关差异基因表达分析

缩略词第8-9页
摘要第9-11页
Abstract第11-12页
第一章 前言第13-22页
    1 研究背景第13-14页
    2 植物多酚代谢途径相关研究进展第14-17页
    3 基因测序技术研究进展第17-21页
        3.1 第一代测序技术第17页
        3.2 第二代测序技术第17页
        3.3 第三代测序技术第17-18页
        3.4 第二代测序技术的转录组研究第18-21页
            3.4.1 RNA-seq技术的原理第18-19页
            3.4.2 RNA-seq技术的标准分析流程第19-20页
            3.4.3 RNA-seq技术的优势第20-21页
    4 本研究的目的和意义第21-22页
第二章 橄榄果实多酚和黄酮含量的测定第22-28页
    1 材料与方法第22-24页
        1.1 材料第22-23页
        1.2 仪器与试剂第23页
        1.3 方法第23-24页
            1.3.1 多酚含量测定第23页
            1.3.2 黄酮含量测定第23-24页
    2 结果与分析第24-28页
        2.1 多酚含量第24-26页
        2.2 黄酮含量第26-28页
第三章 橄榄多酚类物质代谢途径关键基因的筛选第28-46页
    1 材料与方法第28-32页
        1.1 材料第28页
        1.2 仪器与试剂第28页
        1.3 方法第28-32页
            1.3.1 橄榄果实总RNA提取方法的比较第28-30页
            1.3.2 cDNA文库构建第30-31页
            1.3.3 De novo组装和注释第31页
            1.3.4 差异表达基因的筛选第31-32页
    2 结果与分析第32-46页
        2.1 橄榄果实总RNA质量分析第32-33页
            2.1.1 凝胶电泳分析第32-33页
            2.1.2 紫外分光光度计分析第33页
        2.2 建库及De novo组装结果第33-35页
        2.3 功能注释第35-38页
        2.4 功能分类及代谢通路富集分析第38-41页
            2.4.1 KOG注释第38-39页
            2.4.2 GO注释第39-41页
            2.4.3 KEGG代谢通路富集分析第41页
        2.5 候选差异表达基因的筛选与鉴定第41-46页
            2.5.1 主成分分析(PCA)第41-42页
            2.5.2 差异表达基因的筛选第42-43页
            2.5.3 多酚类物质代谢相关基因的鉴定第43-46页
第四章 橄榄多酚类物质代谢关键基因荧光定量PCR验证第46-53页
    1 材料与方法第46-48页
        1.1 材料第46页
        1.2 仪器和试剂第46页
        1.3 方法第46-48页
            1.3.1 橄榄果实总RNA的提取第46页
            1.3.2 cDNA的合成第46页
            1.3.3 荧光定量PCR第46-48页
    2 结果与分析第48-53页
第五章 讨论与结论第53-56页
    1 讨结第53-54页
    2 结论第54-56页
参考文献第56-64页
附录第64-86页
致谢第86页

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