| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-19页 |
| 1.1 引言 | 第13页 |
| 1.2 当前药物发现策略 | 第13-15页 |
| 1.3 细胞水平的活性是连接靶标水平和动物水平活性的桥梁 | 第15-16页 |
| 1.4 NCI-60 数据库的研究现状 | 第16-18页 |
| 1.5 本研究的目的与任务 | 第18-19页 |
| 第二章 抗癌细胞活性预测模型的构建与模型评估 | 第19-39页 |
| 2.1 引言 | 第19-20页 |
| 2.2 机器学习 | 第20-21页 |
| 2.2.1 支持向量机 | 第20页 |
| 2.2.2 K-最近邻算法 | 第20页 |
| 2.2.3 朴素贝叶斯 | 第20-21页 |
| 2.2.4 递归分区 | 第21页 |
| 2.2.5 随机森林 | 第21页 |
| 2.3 机器学习分类模型的验证 | 第21-22页 |
| 2.4 模型预测能力的验证方法 | 第22-23页 |
| 2.5 结果分析 | 第23-35页 |
| 2.5.1 数据集的准备 | 第23-24页 |
| 2.5.2 化学多样性和空间分析 | 第24-26页 |
| 2.5.3 分子描述符和分子指纹 | 第26-28页 |
| 2.5.4 训练集和测试集的比例分析 | 第28-29页 |
| 2.5.5 基于分子描述符构建的模型分析 | 第29-30页 |
| 2.5.6 基于分子指纹构建的模型分析 | 第30-33页 |
| 2.5.7 外部验证 | 第33-34页 |
| 2.5.8 Y-scrambling结果分析 | 第34-35页 |
| 2.6 本章小结 | 第35-36页 |
| 2.7 实验部分 | 第36-39页 |
| 2.7.1 软件与程序 | 第36页 |
| 2.7.2 实验材料与步骤 | 第36-39页 |
| 第三章 新型抗肿瘤先导化合物的发现 | 第39-49页 |
| 3.1 引言 | 第39页 |
| 3.2 虚拟筛选 | 第39-40页 |
| 3.3 细胞抗增殖实验筛选 | 第40页 |
| 3.4 结果分析 | 第40-46页 |
| 3.4.1 虚拟筛选结果 | 第40-41页 |
| 3.4.2 体外抗增殖实验筛选结果 | 第41-46页 |
| 3.5 本章小结 | 第46页 |
| 3.6 虚拟筛选实验部分 | 第46页 |
| 3.6.1 软件 | 第46页 |
| 3.6.2 虚拟筛选步骤 | 第46页 |
| 3.7 MTT实验部分 | 第46-49页 |
| 3.7.1 实验试剂 | 第46-47页 |
| 3.7.2 实验仪器 | 第47页 |
| 3.7.3 主要溶液配方 | 第47页 |
| 3.7.4 细胞系及来源 | 第47-48页 |
| 3.7.5 细胞培养 | 第48页 |
| 3.7.6 MTT实验[56] | 第48-49页 |
| 第四章 抗癌先导化合物G03的作用机制研究 | 第49-79页 |
| 4.1 引言 | 第49页 |
| 4.2 药物-靶标相互作用关系研究 | 第49-51页 |
| 4.2.1 药物-靶标相互作用关系的预测 | 第49-50页 |
| 4.2.2 表面等离子体共振 | 第50-51页 |
| 4.3 微管 | 第51-54页 |
| 4.3.1 微管的组成 | 第52页 |
| 4.3.2 微管的动力学特征 | 第52页 |
| 4.3.3 微管的结构修饰 | 第52-53页 |
| 4.3.4 微管的功能 | 第53页 |
| 4.3.5 微管靶点抗癌药物 | 第53-54页 |
| 4.4 细胞周期和凋亡 | 第54页 |
| 4.5 癌细胞迁移、侵袭与肿瘤转移 | 第54-55页 |
| 4.6 结果分析 | 第55-68页 |
| 4.6.1 G03的靶标预测 | 第55-56页 |
| 4.6.2 G03作用于微管蛋白 | 第56-57页 |
| 4.6.3 G03在体外促进微管蛋白聚合 | 第57-58页 |
| 4.6.4 G03有稳定微管的作用 | 第58-61页 |
| 4.6.5 G03促进微管蛋白乙酰化 | 第61-63页 |
| 4.6.6 G03作用于细胞周期，阻滞G2/M期 | 第63页 |
| 4.6.7 G03促进细胞凋亡 | 第63-66页 |
| 4.6.8 G03能抑制细胞的运迁移和侵袭能力 | 第66-68页 |
| 4.7 本章小结 | 第68页 |
| 4.8 实验部分 | 第68-79页 |
| 4.8.1 实验仪器 | 第68-69页 |
| 4.8.2 实验试剂 | 第69-70页 |
| 4.8.3 主要实验试剂配方 | 第70-72页 |
| 4.8.4 细胞培养 | 第72页 |
| 4.8.5 SPR实验 | 第72-73页 |
| 4.8.6 微管浊度实验 | 第73-74页 |
| 4.8.7 免疫荧光实验 | 第74页 |
| 4.8.8 微管稳定性实验 | 第74-75页 |
| 4.8.9 乙酰化实验 | 第75页 |
| 4.8.10 蛋白免疫印迹实验（Western Blot） | 第75-77页 |
| 4.8.11 细胞周期实验 | 第77页 |
| 4.8.12 细胞凋亡实验 | 第77页 |
| 4.8.13 划痕愈合实验 | 第77-78页 |
| 4.8.14 Transwell实验 | 第78-79页 |
| 结论和展望 | 第79-80页 |
| 结论 | 第79页 |
| 展望 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-85页 |
| 附录 1 | 第85-86页 |
| 14 个活性化合物的结构 | 第85-86页 |
| 附录 2 | 第86-89页 |
| 化合物G03的结构确证图谱 | 第86-89页 |
| 附录 3 | 第89-90页 |
| SPR实验补充数据 | 第89-90页 |
| 紫杉醇 | 第89页 |
| G03 | 第89-90页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第90-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 附件 | 第92页 |