| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 英文缩写词表 | 第8-16页 |
| 第一章 绪论 | 第16-47页 |
| 1.1 军团菌简介 | 第16-18页 |
| 1.1.1 军团菌的发现 | 第16页 |
| 1.1.2 军团菌特点及分类 | 第16页 |
| 1.1.3 军团菌的环境分布 | 第16-17页 |
| 1.1.4 军团菌自然界生存史 | 第17-18页 |
| 1.2 军团菌的分子分型研究 | 第18-20页 |
| 1.2.1 军团菌分型鉴定 | 第18-20页 |
| 1.3 军团菌胞内生活史 | 第20-25页 |
| 1.3.1 军团菌复制小泡(LCV)的胞内过程 | 第21-23页 |
| 1.3.2 军团菌摄取和逃逸 | 第23-25页 |
| 1.4 军团菌Dot/Icm IV型分泌系统 | 第25-26页 |
| 1.4.1 Dot/Icm IV型系统简介 | 第25页 |
| 1.4.2 Dot/Icm IV型系统效应蛋白 | 第25-26页 |
| 1.5 嗜肺军团菌与先天免疫受体 | 第26-30页 |
| 1.5.1 Toll样受体与嗜肺军团菌 | 第27-28页 |
| 1.5.2 NOD样受体与嗜肺军团菌 | 第28-29页 |
| 1.5.3 RIG-Ⅰ样受体与嗜肺军团菌 | 第29-30页 |
| 1.6 嗜肺军团菌与炎症反应 | 第30-38页 |
| 1.6.1 嗜肺军团菌与NAIP5/NLRC4炎症体 | 第31-34页 |
| 1.6.2 hNAIP与嗜肺军团菌 | 第34页 |
| 1.6.3 NLRP3与嗜肺军团菌 | 第34-35页 |
| 1.6.4 Caspase-11 和非典型激活NLRP3炎症体与嗜肺军团菌 | 第35页 |
| 1.6.5 AIM2炎症体与嗜肺军团菌 | 第35-36页 |
| 1.6.6 嗜肺军团菌感染引起的其他免疫反应 | 第36-37页 |
| 1.6.7 嗜肺军团菌的凋亡抑制 | 第37-38页 |
| 1.7 嗜肺军团菌的鞭毛蛋白 | 第38-44页 |
| 1.7.1 军团菌鞭毛简介 | 第38页 |
| 1.7.2 嗜肺军团菌运动性的调控 | 第38-40页 |
| 1.7.3 FlaA基因调控与嗜肺军团菌毒力 | 第40-42页 |
| 1.7.4 鞭毛与细胞免疫 | 第42-44页 |
| 1.8 本论文选题意义 | 第44-47页 |
| 第二章 澳门地区嗜肺军团菌的分布及其流行病学分析 | 第47-64页 |
| 2.1 引言 | 第47页 |
| 2.2 实验材料与设备 | 第47-50页 |
| 2.2.1 主要试剂 | 第47-48页 |
| 2.2.2 主要仪器设备 | 第48-49页 |
| 2.2.3 实验引物 | 第49-50页 |
| 2.2.4 实验菌株 | 第50页 |
| 2.3 实验过程与方法 | 第50-52页 |
| 2.3.1 样品处理 | 第50页 |
| 2.3.2 细菌分离培养和血清学鉴定 | 第50-51页 |
| 2.3.3 细菌脂肪酸鉴定与分型 | 第51页 |
| 2.3.4 细菌DNA提取及毒力基因检测 | 第51-52页 |
| 2.3.5 16S rRNA, mip和SBT基因分型 | 第52页 |
| 2.4 实验结果 | 第52-60页 |
| 2.4.1 环境中军团菌的分离和血清学鉴定 | 第52-53页 |
| 2.4.2 毒力基因检测 | 第53-54页 |
| 2.4.3 脂肪酸分型 | 第54页 |
| 2.4.4 16S rRNA分型结果 | 第54-55页 |
| 2.4.5 mip基因分型 | 第55-56页 |
| 2.4.6 SBT分型 | 第56-60页 |
| 2.5 讨论 | 第60-62页 |
| 2.6 本章小结 | 第62-64页 |
| 第三章 澳门地区嗜肺军团菌的耐药情况分析 | 第64-70页 |
| 3.1 引言 | 第64页 |
| 3.2 实验材料和设备 | 第64页 |
| 3.2.1 主要试剂 | 第64页 |
| 3.2.2 培养基 | 第64页 |
| 3.2.3 菌株来源 | 第64页 |
| 3.3 实验过程和方法 | 第64-65页 |
| 3.3.1 菌株复苏与培养 | 第64-65页 |
| 3.3.2 最小抑菌浓度测定(MIC) | 第65页 |
| 3.4 实验结果 | 第65-68页 |
| 3.5 讨论 | 第68-69页 |
| 3.6 本章小结 | 第69-70页 |
| 第四章 嗜肺军团菌侵染不同细胞及其胞内增殖过程比较 | 第70-89页 |
| 4.1 引言 | 第70-71页 |
| 4.2 实验材料与设备 | 第71-74页 |
| 4.2.1 菌株和质粒 | 第71-72页 |
| 4.2.2 细胞株及培养 | 第72-73页 |
| 4.2.3 实验引物 | 第73页 |
| 4.2.4 实验主要材料 | 第73页 |
| 4.2.5 实验仪器 | 第73-74页 |
| 4.3 实验流程与方法 | 第74-79页 |
| 4.3.1 敲除株Th的构建 | 第74-77页 |
| 4.3.2 菌株Th-gfp的构建 | 第77页 |
| 4.3.3 菌株Th-gfp生理变化 | 第77-78页 |
| 4.3.4 菌株Th-gfp的遗传稳定性评估 | 第78页 |
| 4.3.5 细菌对不同细胞株粘附率的比较 | 第78-79页 |
| 4.3.6 嗜肺军团菌胞内增殖过程观察 | 第79页 |
| 4.4 实验结果 | 第79-86页 |
| 4.4.1 菌株Th构建 | 第79-80页 |
| 4.4.2 菌株Th-gfp的构建 | 第80-81页 |
| 4.4.3 基因重组对菌株的影响及Th-gfp遗传稳定性评估 | 第81-83页 |
| 4.4.4 嗜肺军团菌Th-gfp对不同细胞的粘附力和侵袭力 | 第83-84页 |
| 4.4.5 嗜肺军团菌Th-gfp在不同细胞内的增殖曲线 | 第84-85页 |
| 4.4.6 嗜肺军团菌Th-gfp在不同细胞内增殖的形态学比较 | 第85-86页 |
| 4.5 讨论 | 第86-87页 |
| 4.6 本章小结 | 第87-89页 |
| 第五章 嗜肺军团菌感染对细胞转录组的影响 | 第89-99页 |
| 5.1 引言 | 第89页 |
| 5.2 实验材料与设备 | 第89-90页 |
| 5.2.1 菌株和细胞 | 第89页 |
| 5.2.2 培养基 | 第89-90页 |
| 5.2.3 实验主要材料 | 第90页 |
| 5.2.4 实验仪器 | 第90页 |
| 5.3 实验流程和方法 | 第90-92页 |
| 5.3.1 实验流程 | 第90-91页 |
| 5.3.2 实验方法 | 第91-92页 |
| 5.4 实验结果 | 第92-97页 |
| 5.4.1 取样时间 | 第92-93页 |
| 5.4.2 利用GO和KEGG分析转录组数据 | 第93-97页 |
| 5.5 讨论 | 第97页 |
| 5.6 本章小结 | 第97-99页 |
| 第六章 flaA或flaA-C基因缺失对细菌在宿主细胞内增殖影响 | 第99-108页 |
| 6.1 引言 | 第99页 |
| 6.2 实验材料与设备 | 第99-101页 |
| 6.2.1 菌株和质粒 | 第99-100页 |
| 6.2.2 细胞株及培养 | 第100页 |
| 6.2.3 实验引物 | 第100-101页 |
| 6.2.4 实验主要材料和仪器 | 第101页 |
| 6.3 实验流程和方法 | 第101-102页 |
| 6.3.1 敲除株LF和LC的构建 | 第101页 |
| 6.3.2 敲除回补株LR的构建 | 第101-102页 |
| 6.3.3 菌株LP、LF、LC和LR的生长曲线和胞内增殖曲线测定 | 第102页 |
| 6.4 实验结果 | 第102-106页 |
| 6.4.1 敲除株LF和LC构建 | 第102-104页 |
| 6.4.2 FlaA敲除回补株的构建 | 第104-105页 |
| 6.4.3 菌株LP、LF、LC和LR的生长曲线 | 第105-106页 |
| 6.5 讨论 | 第106-107页 |
| 6.6 本章小结 | 第107-108页 |
| 第七章 flaA或flaA-C基因缺失对宿主细胞受体识别的影响 | 第108-123页 |
| 7.1 引言 | 第108页 |
| 7.2 实验材料与设备 | 第108-109页 |
| 7.2.1 菌株和细胞 | 第108页 |
| 7.2.2 培养基 | 第108页 |
| 7.2.3 实验主要材料 | 第108页 |
| 7.2.4 实验仪器 | 第108-109页 |
| 7.3 实验流程和方法 | 第109页 |
| 7.3.1 实验流程 | 第109页 |
| 7.3.2 实验方法 | 第109页 |
| 7.4 实验结果 | 第109-120页 |
| 7.4.1 LP、LF和LC感染后宿主细胞的转录组差异 | 第109-110页 |
| 7.4.2 利用GO和KEGG分析转录组数据 | 第110-120页 |
| 7.5 讨论 | 第120-121页 |
| 7.6 本章小结 | 第121-123页 |
| 结论与展望 | 第123-126页 |
| 结论 | 第123-124页 |
| 展望 | 第124-126页 |
| 参考文献 | 第126-154页 |
| 附录 1 | 第154-156页 |
| 附录 2 | 第156-160页 |
| 攻读博士学位期间取得的研究成果 | 第160-161页 |
| 致谢 | 第161-162页 |
| 附件 | 第162页 |
