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牛PPARα、PPARβ基因多态性及其与生长性状相关性分析

摘要第6-8页
Abstract第8-10页
第1章 引言第14-26页
    1.1 中国地方黄牛品种介绍第15-17页
        1.1.1 秦川牛第15页
        1.1.2 鲁西黄牛第15-16页
        1.1.3 南阳黄牛第16页
        1.1.4 郏县红牛第16-17页
    1.2 动物育种策略第17-20页
        1.2.1 限制性片段长度多态性标记(RFLP)第17-18页
        1.2.2 随机扩增多态性标记(RAPD)第18-19页
        1.2.3 扩增片段长度多态性标记(AFLP)第19页
        1.2.4 微卫星多态性标记(SSR)第19页
        1.2.5 单核苷酸多态性标记(SNP)第19-20页
    1.3 分子遗传标记在动物育种中的应用第20-22页
        1.3.1 标记辅助选择育种第21页
        1.3.2 构建动物遗传图谱第21页
        1.3.3 个体识别及亲缘关系的鉴定第21-22页
    1.4 PPARα、PPARβ基因的研究进展第22-25页
        1.4.1 PPARα基因的结构特征及组织分布第22-23页
        1.4.2 PPARα基因的生物学功能研究第23-24页
        1.4.3 PPARβ基因的结构特征及组织分布第24页
        1.4.4 PPARβ基因的生物学功能研究第24-25页
    1.5 研究的目的和意义第25-26页
第2章 材料与方法第26-35页
    2.1 试验材料第26-28页
        2.1.1 试验动物第26页
        2.1.2 生长数据第26-27页
        2.1.3 主要仪器设备第27页
        2.1.4 试验中常用试剂第27-28页
    2.2 试验方法第28-34页
        2.2.1 牛全血基因组DNA提取第28页
        2.2.2 提取的DNA质量检测第28页
        2.2.3 DNA池的构建第28页
        2.2.4 引物设计第28-32页
        2.2.5 PCR扩增第32页
        2.2.6 PCR-RFLP反应及测序第32-34页
    2.3 试验结果的统计分析第34-35页
        2.3.1 遗传多态性分析第34页
        2.3.2 遗传标记与性状的关联分析统计模型第34-35页
第3章 结果与分析第35-75页
    3.1 牛PPARα基因突变位点检测及与牛生长性状相关性分析第35-53页
        3.1.1 牛PPARα基因DNA池扩增后的测序结果第35页
        3.1.2 牛PPARα基因三个多态位点突变区域的PCR扩增第35-36页
        3.1.3 牛PPARα基因三个多态位点的PCR-RFLP分析第36-39页
        3.1.4 牛PPARα基因三个多态位点的群体遗传学分析第39-42页
        3.1.5 牛PPARα基因三个多态位点与牛经济性状的关联分析第42-51页
        3.1.6 牛PPARα基因三个位点间的组合效应与牛生长性状的关联分析第51-53页
    3.2 牛PPARβ基因突变位点检测及与牛生长性状相关性分析第53-72页
        3.2.1 牛PPARβ基因DNA池扩增后的测序结果第53页
        3.2.2 牛PPARβ基因三个多态位点突变区域的PCR扩增第53-54页
        3.2.3 牛PPARβ基因三个多态位点的PCR-RFLP分析第54-57页
        3.2.4 牛PPARβ基因三个多态位点的群体遗传学分析第57-60页
        3.2.5 牛PPARβ基因三个多态位点与牛经济性状的关联分析第60-70页
        3.2.6 牛PPARβ基因三个位点间的组合效应与牛经济性状的关联分析第70-72页
    3.3 牛PPARα、PPARβ基因的连锁不平衡及单倍型分析第72-75页
        3.3.1 牛PPARα基因三个多态位点的连锁不平衡分析第72页
        3.3.2 牛PPARα基因三个多态位点的单倍型分析第72-73页
        3.3.3 牛PPARβ基因三个多态位点的连锁不平衡分析第73页
        3.3.4 牛PPARβ基因三个多态位点的单倍型分析第73-75页
第4章 生物信息学分析第75-88页
    4.1 牛PPARα蛋白的生物信息学分析第75-81页
        4.1.1 牛PPARα基因结构的基本信息第75页
        4.1.2 PPARα氨基酸的基本分析第75-76页
        4.1.3 PPARα蛋白的疏水结构第76页
        4.1.4 PPARα蛋白的二级结构第76-78页
        4.1.5 PPARα蛋白的磷酸化位点分析第78页
        4.1.6 PPARα蛋白的糖基化位点分析第78-79页
        4.1.7 PPARα蛋白信号肽与跨膜结构分析第79-80页
        4.1.8 PPARα蛋白Domin分析第80-81页
        4.1.9 亚细胞定位第81页
    4.2 牛PPARβ蛋白的生物信息学分析第81-88页
        4.2.1 牛PPARβ基因结构的基本信息第81页
        4.2.2 PPARβ氨基酸的基本分析第81-82页
        4.2.3 PPARβ蛋白的疏水结构第82页
        4.2.4 PPARβ蛋白的二级结构第82-84页
        4.2.5 PPARβ蛋白的磷酸化位点分析第84页
        4.2.6 PPARβ蛋白的糖基化位点分析第84-85页
        4.2.7 PPARβ蛋白信号肽与跨膜结构分析第85-86页
        4.2.8 PPARβ蛋白Domin分析第86-87页
        4.2.9 亚细胞定位第87-88页
第5章 讨论第88-91页
    5.1 牛PPARα基因SNPs的遗传多样性分析第88-89页
    5.2 牛PPARβ基因SNPs的遗传多样性分析第89-91页
第6章 结论第91-93页
致谢第93-94页
参考文献第94-100页
攻读学位期间获得与学位论文相关的科研成果目录第100-101页
附录第101-104页

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