| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 量化计算的基础理论 | 第12-30页 |
| 1.1 引言 | 第12-13页 |
| 1.2 从头计算方法 | 第13-17页 |
| 1.2.1 Hartree-Fock理论 | 第14-16页 |
| 1.2.2 Post Hartree-Fock方法 | 第16-17页 |
| 1.3 半经验方法 | 第17-18页 |
| 1.4 密度泛函理论 | 第18-24页 |
| 1.4.1 Thomas-Fermi-Dirac近似 | 第18-19页 |
| 1.4.2 Hohenberg-Kohn定理 | 第19-21页 |
| 1.4.3 Kohn-Sham方程 | 第21-22页 |
| 1.4.4 交换相关能泛函 | 第22-24页 |
| 1.5 基组 | 第24-26页 |
| 1.6 分子红外振动光谱 | 第26页 |
| 1.7 研究工具 | 第26-27页 |
| 1.8 参考文献 | 第27-30页 |
| 第二章 多肽的研究概论 | 第30-40页 |
| 2.1 多肽研究的科学意义 | 第30-32页 |
| 2.2 多肽结构研究的研究概论 | 第32-36页 |
| 2.2.1 寡肽与金属离子的络合 | 第32-33页 |
| 2.2.2 多肽结构的实验光谱 | 第33-35页 |
| 2.2.3 多肽结构的理论搜索 | 第35-36页 |
| 2.3 本论文的研究目的 | 第36-37页 |
| 2.4 参考文献 | 第37-40页 |
| 第三章 酪氨酸-甘氨酸,色氨酸-甘氨酸以及甘氨酸-色氨酸的单分子光谱的系统研究 | 第40-60页 |
| 3.1 引言 | 第40-41页 |
| 3.2 计算方法 | 第41-42页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第42-55页 |
| 3.3.1 酪氨酸-甘氨酸 | 第42-48页 |
| 3.3.2 色氨酸-甘氨酸 | 第48-52页 |
| 3.3.3 甘氨酸-色氨酸 | 第52-55页 |
| 3.4 归纳与总结 | 第55-56页 |
| 3.5 参考文献 | 第56-60页 |
| 第四章 丙氨酸-丙氨酸及苯丙氨酸-丙氨酸与Ⅰ/Ⅱ主族类金属离子间的相互作用 | 第60-78页 |
| 4.1 引言 | 第60-61页 |
| 4.2 计算方法 | 第61-62页 |
| 4.2.1 金属络合物在气相下的系统搜索法 | 第61-62页 |
| 4.2.2 计算策略 | 第62页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第62-74页 |
| 4.3.1 构象和能量 | 第62-70页 |
| 4.3.2 结合能 | 第70-71页 |
| 4.3.3 红外光谱 | 第71-74页 |
| 4.4 归纳及总结 | 第74-75页 |
| 4.5 参考文献 | 第75-78页 |
| 第五章 残基关联性分析及路径拼接在寡肽结构预测方面的运用 | 第78-102页 |
| 5.1 引言 | 第78-79页 |
| 5.2 计算方法 | 第79-82页 |
| 5.2.1 寡肽势能面的描述 | 第79页 |
| 5.2.2 二级结构关联性研究策略 | 第79-82页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第82-98页 |
| 5.3.1 单残基的二维聚类分布 | 第82-87页 |
| 5.3.2 近邻残基的四维聚类分布及残基关联性研究 | 第87-92页 |
| 5.3.3 限制性拼接侧链的描述及效率 | 第92-96页 |
| 5.3.4 路径拼接法的运用 | 第96-98页 |
| 5.4 归纳及总结 | 第98-99页 |
| 5.5 参考文献 | 第99-102页 |
| 第六章 片段拼接策略在四肽结构预测的应用 | 第102-126页 |
| 6.1 引言 | 第102-103页 |
| 6.2 计算方法 | 第103-104页 |
| 6.2.1 系统法探究势能面 | 第103-104页 |
| 6.2.2 四肽与其相应二肽的关联性 | 第104页 |
| 6.3 结果与讨论 | 第104-122页 |
| 6.3.1 四肽结构 | 第104-113页 |
| 6.3.2 四肽的特征结构归纳及其与二肽结构的关联性 | 第113-118页 |
| 6.3.3 高效的预测四肽构型的拼接方法 | 第118-119页 |
| 6.3.4 拼接方法的表现 | 第119-120页 |
| 6.3.5 拼接方法应用到更大的多肽 | 第120-122页 |
| 6.4 总结 | 第122页 |
| 6.5 参考文献 | 第122-126页 |
| 第七章 总结 | 第126-128页 |
| 致谢 | 第128-130页 |
| 博士期间发表的论文 | 第130页 |
