| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 第1章 文献综述 | 第11-19页 |
| 1. 洞穴鱼类研究概述 | 第11-12页 |
| 2. 洞穴鱼类体色白化的研究进展 | 第12-15页 |
| 2.1 动物体色的形成机制 | 第12-14页 |
| 2.2 洞穴鱼类体色白化的研究进展 | 第14-15页 |
| 3. 玫瑰高原鳅的研究现状 | 第15-16页 |
| 4. 转录组高通量测序的应用 | 第16-17页 |
| 5. 本研究实验目的及意义 | 第17-19页 |
| 第2章 基于转录组学的玫瑰高原鳅体色白化的遗传学基础研究 | 第19-51页 |
| 1. 引言 | 第19页 |
| 2. 材料与方法 | 第19-26页 |
| 2.1 实验 | 第19页 |
| 2.2 实验样品 | 第19-20页 |
| 2.3 实验方法 | 第20-26页 |
| 2.3.1 样品采集 | 第20页 |
| 2.3.2 取材 | 第20页 |
| 2.3.3 转录组测序 | 第20-23页 |
| 2.3.4 转录组数据实验验证 | 第23-26页 |
| 3. 结果 | 第26-28页 |
| 3.1 测序、组装结果统计及Unigene功能注释 | 第26页 |
| 3.2 简单重复序列分析 | 第26页 |
| 3.3 SNP分析 | 第26-27页 |
| 3.4 基因表达量及差异表达基因分析 | 第27-28页 |
| 3.4.1 聚类分析 | 第27页 |
| 3.4.2 差异表达基因 | 第27页 |
| 3.4.3 差异表达基因GO注释 | 第27页 |
| 3.4.4 KEGG注释 | 第27-28页 |
| 3.4.5 dusp6、hspa5、map2k4和ef2c表达差异显著性分析 | 第28页 |
| 3.4.6 转录组数据qPCR验证 | 第28页 |
| 4. 讨论 | 第28-29页 |
| 5. 小结 | 第29-31页 |
| 附图表 | 第31-51页 |
| 第3章 基于玫瑰高原鳅转录组测序预测的tyrp1基因分析 | 第51-65页 |
| 1. 引言 | 第51页 |
| 2. 材料与方法 | 第51-53页 |
| 2.1 实验材料 | 第51-52页 |
| 2.2 实验方法 | 第52-53页 |
| 2.2.1 选择性剪接预测 | 第52页 |
| 2.2.2 tyrp1基因外显子预测 | 第52页 |
| 2.2.3 TX-1、TX-2 氨基酸序列预测 | 第52页 |
| 2.2.4 qPCR验证TYRP1和TX-1 | 第52页 |
| 2.2.5 TX-2 编码蛋白的生物信息学分析 | 第52-53页 |
| 3. 结果 | 第53-54页 |
| 3.1 选择性剪切预测结果 | 第53页 |
| 3.2 tyrp1基因外显子预测 | 第53页 |
| 3.3 TX-1 和TX-2 的氨基酸序列 | 第53页 |
| 3.4 qPCR验证tyrp1和TX-1 | 第53页 |
| 3.5 TX-2 编码蛋白的生物信息 | 第53-54页 |
| 3.5.1 TX-2 编码蛋白的理化性质 | 第53-54页 |
| 3.5.2 TX-2 中存在一个跨膜结构 | 第54页 |
| 4. 讨论 | 第54-56页 |
| 5. 小结 | 第56-57页 |
| 附图 | 第57-65页 |
| 参考文献 | 第65-75页 |
| 致谢 | 第75页 |
