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两类生物计算问题及其在数据挖掘中的应用研究

摘要第7-10页
ABSTRACT第10-13页
1 绪论第14-28页
    1.1 研究背景和意义第14-15页
    1.2 研究现状及发展趋势第15-23页
        1.2.1 膜计算的研究现状及发展趋势第15-18页
        1.2.2 DNA 计算的研究现状及发展趋势第18-20页
        1.2.3 聚类算法的研究现状及发展趋势第20-23页
    1.3 论文研究内容及组织第23-28页
        1.3.1 研究内容第23-24页
        1.3.2 论文的创新点第24-26页
        1.3.3 论文内容组织第26-28页
2 主要膜计算模型的扩展第28-37页
    2.1 膜计算基本符号、概念及模型第28-33页
        2.1.1 细胞型 P 系统第29-30页
        2.1.2 组织型 P 系统第30-31页
        2.1.3 神经型 P 系统第31-33页
    2.2 三种主要的膜计算模型的扩展第33-37页
        2.2.1 层结构细胞型膜计算模型第33-34页
        2.2.2 带有动态促进/抑制因子的组织型膜计算模型第34-35页
        2.2.3 具有拓展规则及多输出的脉冲神经膜计算模型第35-37页
3 新型结构膜计算模型研究第37-57页
    3.1 新型结构膜计算模型第37-44页
        3.1.1 基于格(偏序结构)的交流膜计算模型第37-40页
        3.1.2 基于单纯形的交流膜计算模型第40-44页
    3.2 新型结构膜计算模型计算能力证明第44-57页
        3.2.1 形式语言与自动机理论基础第44-47页
        3.2.2 格交流膜计算模型计算能力证明第47-53页
        3.2.3 单纯形交流膜计算模型计算能力证明第53-57页
4 基于膜计算的聚类算法研究第57-78页
    4.1 基于动态促进/抑制因子的组织型膜系统的拓扑聚类算法第57-63页
        4.1.1 基本思想第57-59页
        4.1.2 算法计算过程描述第59-60页
        4.1.3 实验验证第60-63页
    4.2 基于拓展规则及多输出的脉冲神经膜系统的网格聚类算法第63-69页
        4.2.1 菱形网格图概念及描述第63-65页
        4.2.2 聚类问题转化第65-67页
        4.2.3 算法有效性验证第67-69页
    4.3 基于格结构交流膜系统的密度聚类算法第69-78页
        4.3.1 基本思想第69-70页
        4.3.2 膜系统设计第70-71页
        4.3.3 实验验证第71-75页
        4.3.4 基于格结构交流膜系统的三种聚类算法对比第75-78页
5 基于 DNA 计算的聚类算法研究第78-101页
    5.1 DNA 计算模型第78-82页
        5.1.1 Adlman-Lipton DNA 计算模型第78-80页
        5.1.2 改进的粘贴 DNA 计算模型第80-81页
        5.1.3 k-臂 DNA 计算模型第81-82页
    5.2 基于 DNA 计算的聚类算法研究第82-101页
        5.2.1 基于 Adlman-Lipton 计算模型的拓扑聚类算法第82-87页
            5.2.1.1 算法思想及流程分析第82-83页
            5.2.1.2 实验验证第83-86页
            5.2.1.3 算法步骤分析第86-87页
        5.2.2 基于改进的粘贴 DNA 计算模型的拓扑聚类算法第87-91页
            5.2.2.1 算法思想及过程描述第87-90页
            5.2.2.2 实验验证第90-91页
        5.2.3 基于 k-臂 DNA 计算模型的划分聚类算法研究第91-101页
            5.2.3.1 网格树设计第91-92页
            5.2.3.2 聚类问题到网格树的转化第92-94页
            5.2.3.3 实验验证第94-97页
            5.2.3.4 算法分析第97-101页
6 基于膜计算、DNA 计算的数据挖掘应用第101-123页
    6.1 膜计算、DNA 计算在真实数据集中的聚类应用第101-107页
        6.1.1 膜计算在膀胱炎病人病例数据集中的聚类应用第101-106页
        6.1.2 DNA 计算在鸢尾花数据集中的聚类应用第106-107页
    6.2 膜计算在文本聚类中的应用第107-112页
    6.3 膜计算在空气质量评估中的分类应用第112-123页
7 总结与展望第123-126页
    7.1 总结第123-125页
    7.2 进一步的工作第125-126页
参考文献第126-141页
攻博期间发表的科研成果目录第141-144页
致谢第144页

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