前言 | 第4-5页 |
中文摘要 | 第5-8页 |
Abstract | 第8-10页 |
英文缩写词表 | 第14-15页 |
第1章 绪论 | 第15-27页 |
1.1 RUNX1 及其家族成员 | 第15-16页 |
1.2 RUNX1 的启动子及其异构体 | 第16页 |
1.3 RUNX1 与基因转录调节 | 第16-18页 |
1.4 RUNX1 与胚胎造血 | 第18页 |
1.5 RUNX1 的异常调控与白血病的关系 | 第18-19页 |
1.6 RUNX1 转位与白血病的关系 | 第19-21页 |
1.6.1 t(3;21)(q26;q22)转位与白血病 | 第19-20页 |
1.6.2 t(12;21)(p13;q22)转位与白血病 | 第20页 |
1.6.3 t(1;21)(p36;q22)转位与白血病 | 第20页 |
1.6.4 The t(8;21)(q22;q22)转位与白血病 | 第20-21页 |
1.7 RUNX1-ETO 融合蛋白的表观遗传学调控及其与白血病的关系 | 第21页 |
1.8 长链非编码 RNA 研究进展 | 第21-24页 |
1.8.1 长链非编码 RNA 分类 | 第22页 |
1.8.2 长链非编码的表达特点 | 第22-23页 |
1.8.3 长链非编码的基因调控模式 | 第23-24页 |
1.9 RUNX1 长链非编码 RNA 的发现及立题依据 | 第24-25页 |
1.10 研究 LncRNA 对 RUNX1 及 RUNX1-ETO 调控的临床意义 | 第25-27页 |
第2章 研究路线 | 第27-29页 |
2.1 结构分析及差异性表达 | 第27-28页 |
2.2 RUNXOR 功能分析 | 第28-29页 |
第3章 材料与方法 | 第29-57页 |
3.1 主要实验仪器 | 第29页 |
3.2 主要试剂 | 第29-32页 |
3.2.1 细胞培养试剂及耗材 | 第29-30页 |
3.2.2 细胞 DNA/RNA 提取、逆转录、PCR 相关试剂及耗材 | 第30页 |
3.2.3 琼脂糖凝胶电泳相关试剂及耗材 | 第30-31页 |
3.2.4 RAT、RIP、3C 相关试剂及耗材 | 第31页 |
3.2.5 实验相关细胞株 | 第31-32页 |
3.3 主要实验方法及步骤 | 第32-57页 |
3.3.1 细胞培养 | 第32页 |
3.3.2 细胞总 RNA 提取 | 第32-33页 |
3.3.3 RNA 含量及纯度的测定 | 第33页 |
3.3.4 RNA 内残留 DNA 的处理及纯化 | 第33页 |
3.3.5 DNA 消化反应体系和条件(表 3.1) | 第33-34页 |
3.3.6 RNA 纯化 | 第34页 |
3.3.7 cDNA 逆转录条件 | 第34页 |
3.3.8 PCR 扩增 | 第34-35页 |
3.3.9 琼脂糖凝胶电泳 | 第35-37页 |
3.3.10 PCR 产物纯化回收 | 第37-38页 |
3.3.11 限制性酶切反应体系及酶切反应条件 | 第38-39页 |
3.3.12 引物设计 | 第39-44页 |
3.3.13 链特异性逆转录(Strand-Specific RT,SSRT) | 第44-47页 |
3.3.14 荧光素酶/绿色荧光蛋白报告实验 | 第47-48页 |
3.3.15 细菌转化 | 第48-49页 |
3.3.16 PCR 法筛选目的菌落及细菌培养扩增 | 第49页 |
3.3.17 质粒提取(小抽) | 第49-50页 |
3.3.18 质粒瞬时转染 | 第50页 |
3.3.19 荧光素酶/绿色荧光蛋白活性测定 | 第50-51页 |
3.3.20 RNA 免疫共沉淀实验(RNA immunoprecipitation, RIP)37 | 第51-52页 |
3.3.21 染色质免疫共沉淀实验(Chromatin immunoprecipitation,ChIP) | 第52-54页 |
3.3.22 逆转录相关捕获实验(Reverse transcription associated trap assay, RAT) | 第54-55页 |
3.3.23 染色体构象捕获实验(Chromosome conformation capture, 3C) | 第55-57页 |
第4章 结果 | 第57-71页 |
4.1 RUNXOR 长链非编码 RNA 全长图谱绘制结果 | 第57-58页 |
4.2 RUNXOR 转录方向及剪切情况 | 第58-59页 |
4.3 RUNXOR RNA 聚合酶抑制实验 | 第59页 |
4.4 RUNXOR 启动子活性检测 | 第59-61页 |
4.5 RUNXOR 的细胞内分布 | 第61页 |
4.6 RUNXOR 的差异性表达 | 第61-62页 |
4.7 RUNXOR 染色体调控元件的相互作用关系 | 第62-65页 |
4.8 RUNXOR 和 RUNX1 相关转位基因的相互作用关系 | 第65-66页 |
4.9 RUNXOR 和 RUNX1 染色体内环结构的关系 | 第66-67页 |
4.10 RUNXOR 能表观遗传学调控 RUNX1 启动子 | 第67-69页 |
4.11 RAT 方法的可靠性验证 | 第69-71页 |
第5章 讨论 | 第71-75页 |
第6章 结论 | 第75-77页 |
参考文献 | 第77-89页 |
攻读博士期间发表的学术论文及其它成果 | 第89-91页 |
致谢 | 第91-92页 |