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RUNXOR长链非编码RNA在急性髓系白血病中的作用及机制研究

前言第4-5页
中文摘要第5-8页
Abstract第8-10页
英文缩写词表第14-15页
第1章 绪论第15-27页
    1.1 RUNX1 及其家族成员第15-16页
    1.2 RUNX1 的启动子及其异构体第16页
    1.3 RUNX1 与基因转录调节第16-18页
    1.4 RUNX1 与胚胎造血第18页
    1.5 RUNX1 的异常调控与白血病的关系第18-19页
    1.6 RUNX1 转位与白血病的关系第19-21页
        1.6.1 t(3;21)(q26;q22)转位与白血病第19-20页
        1.6.2 t(12;21)(p13;q22)转位与白血病第20页
        1.6.3 t(1;21)(p36;q22)转位与白血病第20页
        1.6.4 The t(8;21)(q22;q22)转位与白血病第20-21页
    1.7 RUNX1-ETO 融合蛋白的表观遗传学调控及其与白血病的关系第21页
    1.8 长链非编码 RNA 研究进展第21-24页
        1.8.1 长链非编码 RNA 分类第22页
        1.8.2 长链非编码的表达特点第22-23页
        1.8.3 长链非编码的基因调控模式第23-24页
    1.9 RUNX1 长链非编码 RNA 的发现及立题依据第24-25页
    1.10 研究 LncRNA 对 RUNX1 及 RUNX1-ETO 调控的临床意义第25-27页
第2章 研究路线第27-29页
    2.1 结构分析及差异性表达第27-28页
    2.2 RUNXOR 功能分析第28-29页
第3章 材料与方法第29-57页
    3.1 主要实验仪器第29页
    3.2 主要试剂第29-32页
        3.2.1 细胞培养试剂及耗材第29-30页
        3.2.2 细胞 DNA/RNA 提取、逆转录、PCR 相关试剂及耗材第30页
        3.2.3 琼脂糖凝胶电泳相关试剂及耗材第30-31页
        3.2.4 RAT、RIP、3C 相关试剂及耗材第31页
        3.2.5 实验相关细胞株第31-32页
    3.3 主要实验方法及步骤第32-57页
        3.3.1 细胞培养第32页
        3.3.2 细胞总 RNA 提取第32-33页
        3.3.3 RNA 含量及纯度的测定第33页
        3.3.4 RNA 内残留 DNA 的处理及纯化第33页
        3.3.5 DNA 消化反应体系和条件(表 3.1)第33-34页
        3.3.6 RNA 纯化第34页
        3.3.7 cDNA 逆转录条件第34页
        3.3.8 PCR 扩增第34-35页
        3.3.9 琼脂糖凝胶电泳第35-37页
        3.3.10 PCR 产物纯化回收第37-38页
        3.3.11 限制性酶切反应体系及酶切反应条件第38-39页
        3.3.12 引物设计第39-44页
        3.3.13 链特异性逆转录(Strand-Specific RT,SSRT)第44-47页
        3.3.14 荧光素酶/绿色荧光蛋白报告实验第47-48页
        3.3.15 细菌转化第48-49页
        3.3.16 PCR 法筛选目的菌落及细菌培养扩增第49页
        3.3.17 质粒提取(小抽)第49-50页
        3.3.18 质粒瞬时转染第50页
        3.3.19 荧光素酶/绿色荧光蛋白活性测定第50-51页
        3.3.20 RNA 免疫共沉淀实验(RNA immunoprecipitation, RIP)37第51-52页
        3.3.21 染色质免疫共沉淀实验(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)第52-54页
        3.3.22 逆转录相关捕获实验(Reverse transcription associated trap assay, RAT)第54-55页
        3.3.23 染色体构象捕获实验(Chromosome conformation capture, 3C)第55-57页
第4章 结果第57-71页
    4.1 RUNXOR 长链非编码 RNA 全长图谱绘制结果第57-58页
    4.2 RUNXOR 转录方向及剪切情况第58-59页
    4.3 RUNXOR RNA 聚合酶抑制实验第59页
    4.4 RUNXOR 启动子活性检测第59-61页
    4.5 RUNXOR 的细胞内分布第61页
    4.6 RUNXOR 的差异性表达第61-62页
    4.7 RUNXOR 染色体调控元件的相互作用关系第62-65页
    4.8 RUNXOR 和 RUNX1 相关转位基因的相互作用关系第65-66页
    4.9 RUNXOR 和 RUNX1 染色体内环结构的关系第66-67页
    4.10 RUNXOR 能表观遗传学调控 RUNX1 启动子第67-69页
    4.11 RAT 方法的可靠性验证第69-71页
第5章 讨论第71-75页
第6章 结论第75-77页
参考文献第77-89页
攻读博士期间发表的学术论文及其它成果第89-91页
致谢第91-92页

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