| 摘要 | 第3-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-19页 |
| 1.1 引言 | 第9-10页 |
| 1.2 蛋白质甲基化修饰 | 第10-12页 |
| 1.2.1 精氨酸甲基化 | 第11页 |
| 1.2.2 赖氨酸甲基化 | 第11-12页 |
| 1.3 生物信息学方法计算识别甲基化位点 | 第12-14页 |
| 1.3.1 甲基化预测的计算机语言基础 | 第13-14页 |
| 1.3.2 构建甲基化位点预测网络服务 | 第14页 |
| 1.4 实验研究的主要内容 | 第14-16页 |
| 参考文献 | 第16-19页 |
| 第2章 基于信息增益优化特征方法准确预测物种特异性甲基化位点 | 第19-36页 |
| 2.1 引言 | 第19-21页 |
| 2.2 实验与方法 | 第21-23页 |
| 2.2.1 甲基化数据的收集与准备 | 第21页 |
| 2.2.2 特征提取 | 第21-23页 |
| 2.2.3 特征优化方法IG | 第23页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第23-32页 |
| 2.3.1 序列信息特征的分析结果 | 第23-25页 |
| 2.3.2 进化信息特征的分析结果 | 第25-27页 |
| 2.3.3 理化性质特征的分析结果 | 第27页 |
| 2.3.4 特征优化的分析结果 | 第27-29页 |
| 2.3.5 物种特异性甲基化预测工具PSSMe | 第29页 |
| 2.3.6 与其他预测工具的比较 | 第29-32页 |
| 2.4 结论 | 第32页 |
| 参考文献 | 第32-36页 |
| 第3章 基于序列信息及功能特征计算预测精氨酸和赖氨酸不同类型甲基化位点 | 第36-52页 |
| 3.1 引言 | 第36-38页 |
| 3.2 实验与方法 | 第38-41页 |
| 3.2.1 数据收集及预处理 | 第38-39页 |
| 3.2.2 特征提取 | 第39-40页 |
| 3.2.3 特征优化 | 第40-41页 |
| 3.2.4 模型的评估参数 | 第41页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第41-48页 |
| 3.3.1 序列特征分析结果 | 第41-43页 |
| 3.3.2 进化特征分析结果 | 第43-44页 |
| 3.3.3 功能特征分析结果 | 第44-47页 |
| 3.3.4 模型的评估和比较 | 第47-48页 |
| 3.4 结论 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-52页 |
| 第4章 氨基酸突变对甲基化位点及相关癌症疾病影响的系统分析 | 第52-65页 |
| 4.1 引言 | 第52-54页 |
| 4.2 实验与方法 | 第54-56页 |
| 4.2.1 数据收集 | 第54页 |
| 4.2.2 预测与甲基化有关的突变工具PSSMe-CMs | 第54-55页 |
| 4.2.3 预测不同类型与甲基化相关的氨基酸变异 | 第55-56页 |
| 4.2.4 预测人类癌症变异蛋白识别潜在的methyCMs | 第56页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第56-61页 |
| 4.3.1 统计与甲基化有关的变异的氨基酸突变情况 | 第56-57页 |
| 4.3.2 分析methyCMs位点的无序性和保守性 | 第57-59页 |
| 4.3.3 分析methyCMs蛋白亚细胞定位的分布情况 | 第59页 |
| 4.3.4 分析methyCMs蛋白的富集功能和通路 | 第59-61页 |
| 4.4 结论 | 第61页 |
| 参考文献 | 第61-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 附录 | 第66-77页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第77页 |
