| 摘要 | 第6-9页 |
| ABSTRACT | 第9-12页 |
| 引言 | 第13-16页 |
| 第一章 猕猴粪便病毒宏基因组学分析 | 第16-35页 |
| 1. 实验材料 | 第16-17页 |
| 1.1. 实验试剂 | 第16页 |
| 1.2. 实验耗材 | 第16页 |
| 1.3. 实验仪器 | 第16-17页 |
| 1.4. 生物信息软件 | 第17页 |
| 2. 实验方法 | 第17-23页 |
| 2.1. 样品收集 | 第17页 |
| 2.2. 粪便样品前处理 | 第17-18页 |
| 2.3. 样品核酸酶消化 | 第18页 |
| 2.4. 病毒RNA提取 | 第18-19页 |
| 2.5. 病毒RNA反转录和双链DNA合成 | 第19-20页 |
| 2.6. PCR扩增 | 第20-21页 |
| 2.7. Hiseq高通量测序 | 第21-23页 |
| 3. 实验结果 | 第23-33页 |
| 3.1. 样品SISPA扩增结果 | 第23页 |
| 3.2. DNA文库质检结果 | 第23-24页 |
| 3.3. 数据产出质量分析 | 第24页 |
| 3.4. 病毒宏基因组分析结果 | 第24-33页 |
| 4. 讨论 | 第33-35页 |
| 第二章 猕猴粪便新病毒的研究 | 第35-70页 |
| 1. 实验材料 | 第36-38页 |
| 1.1. 样品来源 | 第36页 |
| 1.2. 试剂和耗材 | 第36-37页 |
| 1.3. 溶液配制 | 第37页 |
| 1.4. 实验仪器 | 第37-38页 |
| 1.5. 实验细胞 | 第38页 |
| 1.6. 生物学软件 | 第38页 |
| 2. 实验方法 | 第38-50页 |
| 2.1. 潜在有意义病毒的RT-PCR鉴定 | 第38-40页 |
| 2.2. 病毒核酸提取 | 第40-41页 |
| 2.3. 病毒RNA反转录 | 第41-42页 |
| 2.4. 病毒核酸PCR扩增(用于病毒流行病学的筛查) | 第42-43页 |
| 2.5. 病毒全基因组的扩增 | 第43-47页 |
| 2.6. 细胞复苏 | 第47-48页 |
| 2.7. 细胞传代 | 第48页 |
| 2.8. 病毒接种和培养 | 第48页 |
| 2.9. 病毒定量 | 第48-50页 |
| 2.10. 病毒进化树的构建 | 第50页 |
| 2.11. 5'-UTR RNA二级结构预测 | 第50页 |
| 3. 实验结果 | 第50-67页 |
| 3.1. 新型肠道病毒SEV-gx | 第50-56页 |
| 3.2. 新型小RNA病毒Mobovirus A | 第56-67页 |
| 4. 讨论 | 第67-70页 |
| 4.1. 肠道病毒SEV-gx | 第67-68页 |
| 4.2. 小RNA病毒Mobovirus A | 第68-70页 |
| 研究总结 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-76页 |
| 综述 | 第76-84页 |
| 参考文献 | 第82-84页 |
| 缩略词对照表 | 第84-85页 |
| 个人简历 | 第85-86页 |
| 致谢 | 第86-87页 |