| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩略语表(Abbreviation) | 第10-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-18页 |
| 引言 | 第11页 |
| 1.1 伪狂犬病毒（PRV）的分子结构 | 第11-12页 |
| 1.2 PRV流行病学特征 | 第12-13页 |
| 1.3 长链非编码RNA（long noncoding RNA）的转录与功能 | 第13-15页 |
| 1.4 疱疹病毒编码的长链非编码RNA | 第15-16页 |
| 1.5 微流体系统 | 第16-17页 |
| 1.6 研究目的与意义 | 第17-18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-35页 |
| 2.1 实验材料 | 第18-22页 |
| 2.1.1 载体、质粒、病毒、细胞、菌种 | 第18页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第18-19页 |
| 2.1.3 培养基 | 第19-20页 |
| 2.1.4 Northern blot所用试剂 | 第20页 |
| 2.1.5 其它溶液 | 第20-21页 |
| 2.1.6 本研究中所用的核苷酸引物 | 第21-22页 |
| 2.1.7 本研究中所用的si RNA | 第22页 |
| 2.2 试验方法 | 第22-35页 |
| 2.2.1 RNA的抽提 | 第22页 |
| 2.2.2 RNA的质量鉴定 | 第22-23页 |
| 2.2.3 构建链特异性转录组文库与测序 | 第23页 |
| 2.2.4 测序数据分析 | 第23-24页 |
| 2.2.5 去除RNA中的基因组DNA | 第24-25页 |
| 2.2.6 反转录 | 第25页 |
| 2.2.7 PCR扩增方法 | 第25-26页 |
| 2.2.8 PCR产物电泳检测 | 第26页 |
| 2.2.9 DNA纯化分离的方法 | 第26-27页 |
| 2.2.10 DNA 3′末端链接单个腺苷酸 | 第27页 |
| 2.2.11 T载体克隆 | 第27-28页 |
| 2.2.12 3′RACE | 第28页 |
| 2.2.13 大肠杆菌感受态制备的方法 | 第28-29页 |
| 2.2.14 转化 | 第29页 |
| 2.2.15 Northern blot | 第29-30页 |
| 2.2.16 鸡胚原代背根神经（DRG）细胞的分离与培养 | 第30-31页 |
| 2.2.17 鸡胚原代背根神经（DRG）细胞在微流体中的培养 | 第31-32页 |
| 2.2.18 间接免疫荧光技术 | 第32页 |
| 2.2.19 PRV感染PK-15 细胞和神经细胞 | 第32-33页 |
| 2.2.20 qPCR | 第33页 |
| 2.2.21 siRNA干扰 | 第33-34页 |
| 2.2.22 病毒滴度（PFU）的测定 | 第34-35页 |
| 3 实验结果 | 第35-49页 |
| 3.1 PRV lncRNA转录组测序 | 第35页 |
| 3.2 PRV lncRNA转录组测序数据的分析 | 第35-38页 |
| 3.2.1 测序数据预处理 | 第35-36页 |
| 3.2.2 测序数据的分析 | 第36-38页 |
| 3.3 lncRNA的验证 | 第38-41页 |
| 3.3.1 RT-PCR验证病毒和宿主细胞编码的lncRNA | 第38-40页 |
| 3.3.2 Northern blot验证病毒和宿主细胞编码的lncRNA | 第40页 |
| 3.3.3 3'RACE验证PRV编码的lncRNA | 第40-41页 |
| 3.4 不同PRV毒株之间LUI、LDI、CTO的保守性分析 | 第41-42页 |
| 3.5 鸡胚原代神经细胞的分离与培养 | 第42-44页 |
| 3.5.1 鸡胚原代神经细胞的分离 | 第42-43页 |
| 3.5.2 鸡胚原代神经细胞的培养 | 第43-44页 |
| 3.6 LUI、LDI和CTO在神经细胞中的表达 | 第44-47页 |
| 3.6.1 LUI、LDI和CTO在神经细胞中的表达 | 第44页 |
| 3.6.2 LUI、LDI和CTO在神经细胞中的表达时序 | 第44-46页 |
| 3.6.3 微环境对LUI、LDI和CTO的表达的影响 | 第46-47页 |
| 3.7 PRV编码的lncRNA对病毒复制的影响 | 第47-49页 |
| 4 讨论与结论 | 第49-53页 |
| 4.1 PRV lncRNA转录组测序与分析 | 第49页 |
| 4.2 lncRNA的验证和保守性分析 | 第49-50页 |
| 4.3 鸡胚原代神经细胞的分离和培养 | 第50-51页 |
| 4.4 PRV编码的lncRNA在神经细胞中的表达 | 第51-52页 |
| 4.5 PRV lncRNA对病毒复制的影响 | 第52页 |
| 4.6 结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 致谢 | 第58页 |
