| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 缩略词表 | 第13-14页 |
| 1 文献综述 | 第14-32页 |
| 1.1 土壤中磷的有效性和利用 | 第14-17页 |
| 1.2 植物中磷的营养功能及其响应低磷胁迫的机制 | 第17-20页 |
| 1.3 油菜磷高效性状的QTL定位 | 第20-22页 |
| 1.4 关联分析的基本原理、影响因素及其在植物重要性状遗传分析中的应用 | 第22-30页 |
| 1.4.1 关联分析的理论基础 | 第23-26页 |
| 1.4.2 关联分析的影响因素以及统计模型 | 第26-28页 |
| 1.4.3 植物重要农艺性状关联分析的研究进展 | 第28-30页 |
| 1.5 IBD、Tajima's D和基因多样性检验 | 第30-32页 |
| 2 研究目的、意义和研究内容 | 第32-34页 |
| 2.1 研究目的和意义 | 第32-33页 |
| 2.2 研究内容 | 第33-34页 |
| 3 甘蓝型油菜根构型响应低磷胁迫的遗传变异 | 第34-78页 |
| 3.1 材料与方法 | 第34-41页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第34-35页 |
| 3.1.2 DNA提取和基因型分型 | 第35-36页 |
| 3.1.3 甘蓝型油菜SNP标记质量控制及物理位置电子比对 | 第36页 |
| 3.1.4 不同磷水平油菜根构型的筛选鉴定 | 第36-38页 |
| 3.1.5 群体基因型评估 | 第38-40页 |
| 3.1.6 关联分析 | 第40-41页 |
| 3.2 结果与分析 | 第41-69页 |
| 3.2.1 油菜关联分析群体根构型及其变异 | 第41-47页 |
| 3.2.2 甘蓝型关联分析群体群体结构、亲缘关系和多样性分析 | 第47-52页 |
| 3.2.3 甘蓝型油菜不同磷水平苗期根系形态构型全基因组关联分析 | 第52-60页 |
| 3.2.4 甘蓝型油菜不同磷水平苗期根构型显著关联SNP与根构型QTL共定位 | 第60-63页 |
| 3.2.5 候选基因的表达 | 第63-69页 |
| 3.3 讨论 | 第69-78页 |
| 3.3.1 甘蓝型油菜全基因组关联分析假阳性控制 | 第69-73页 |
| 3.3.2 甘蓝型油菜连锁不平衡 | 第73-74页 |
| 3.3.3 油菜响应低磷胁迫的根构型候选基因的确定 | 第74-76页 |
| 3.3.4 甘蓝型油菜关联分析群体BnA3Hap单倍型及其地理分布 | 第76-78页 |
| 4 油菜磷高效和低效品种育种过程中重要农艺性状遗传位点的选择和传递 | 第78-100页 |
| 4.1 材料与方法 | 第81-83页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第81-82页 |
| 4.1.2 DNA提取和基因型分型 | 第82页 |
| 4.1.3 SNP质控以及物理位置电子比对 | 第82页 |
| 4.1.4 Tapidor和宁油7号号系谱IBD分析 | 第82-83页 |
| 4.1.5 Tapidor和宁油7号系谱Tajima‘s D和遗传多样性检验 | 第83页 |
| 4.1.6 育种过程中的基因群 | 第83页 |
| 4.2 结果与分析 | 第83-95页 |
| 4.2.1 Tapidor和宁油7号系谱中SNP标记在参考基因组上的分布 | 第83-84页 |
| 4.2.2 Tapidor和宁油7号系谱的IBD传递差异 | 第84-88页 |
| 4.2.3 Tapidor和宁油7号系谱在基因水平上育种选择的差异 | 第88-92页 |
| 4.2.4 Tapidor和宁油7号系谱品种育种过程中有利基因群的传递 | 第92-95页 |
| 4.3 讨论 | 第95-100页 |
| 4.3.1 油菜磷高效和低效品种育种过程中根构型等性状的选择和传递 | 第95-97页 |
| 4.3.2 油菜磷高效和低效品种育种过程中根构型等性状调控的QTL及其候选基因的选择和传递 | 第97-100页 |
| 5 结论 | 第100-102页 |
| 5.1 低磷和正常磷甘蓝型油菜全基因组根构型变异位点 | 第100页 |
| 5.2 油菜磷高效和低效品种育种过程中根构型等性状调控基因的选择和传递 | 第100-102页 |
| 6 研究中的创新点和不足 | 第102-104页 |
| 6.1 本研究的创新点 | 第102页 |
| 6.2 本研究的不足之处 | 第102-104页 |
| 7. 展望 | 第104-105页 |
| 参考文献 | 第105-125页 |
| 附录I. DNA提取及检测 | 第125-127页 |
| 附录II. 油菜 60K芯片杂交 | 第127-131页 |
| 附录III. 关联分析群体无磷纸和营养液培养低磷和正常磷根构型性状显著关联SNP标记及其解释表型变异 | 第131-144页 |
| 附录IV. 甘蓝型油菜磷高效品种宁油7号和磷低效品种Tapidor系谱19条染色体的SNP block图以及IBD分布 | 第144-146页 |
| 附录V. 甘蓝型油菜磷高效品种宁油7号和磷低效品种Tapidor系谱19条染色体的Tajima' s D检验及候选基因 | 第146-148页 |
| 附录VI. 甘蓝型油菜磷高效品种宁油7号和磷低效品种Tapidor系谱19条染色体的基因多样性检验及候选基因 | 第148-150页 |
| 附录VII. 作者简介、发表论文和奖励 | 第150-153页 |
| 致谢 | 第153-155页 |
