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基于分子模拟的间位开环产物水解酶结构与功能关系研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
TABLE OF CONTENTS第11-14页
图目录第14-17页
表目录第17-19页
主要符号表第19-20页
1 间位开环水解酶的研究进展第20-48页
    1.1 芳香化合物的微生物代谢概述第20-22页
    1.2 间位开环产物水解酶的功能、来源与分类第22-25页
        1.2.1 间位开环产物水解酶的功能第22-23页
        1.2.2 间位开环产物水解酶的来源第23-24页
        1.2.3 间位开环产物水解酶的分类第24-25页
    1.3 间位开环产物水解酶的特性和催化机制第25-38页
        1.3.1 间位开环产物水解酶的生理生化特性第25-27页
        1.3.2 间位开环产物水解酶的一级结构特征第27-28页
        1.3.3 间位开环产物水解酶的三级结构特征第28-36页
        1.3.4 间位开环产物水解酶催化机制的研究进展第36-38页
    1.4 酶的半理性设计研究进展第38-45页
    1.5 本论文的研究目的、意义与研究框架第45-48页
2 BphD的克隆表达、基本特性和生物信息学分析第48-66页
    2.1 材料与方法第48-53页
        2.1.1 实验材料第48-49页
        2.1.2 实验方法第49-53页
    2.2 结果与讨论第53-65页
        2.2.1 BphD编码基因克隆、表达及纯化第53-55页
        2.2.2 BphD的催化动力学分析第55-56页
        2.2.3 BphD的催化性能对pH、温度、抑制剂的依赖性第56-59页
        2.2.4 BphD及MfphA的生物信息学分析第59-65页
    2.3 本章小结第65-66页
3 间位开环产物水解酶的区域互换研究第66-85页
    3.1 材料和方法第66-72页
        3.1.1 实验材料第66-67页
        3.1.2 实验方法第67-72页
    3.2 结果与讨论第72-84页
        3.2.1 交叉点选择的生物信息学分析第72-76页
        3.2.2 杂合酶的编码基因克隆、表达和纯化第76-78页
        3.2.3 杂合酶的催化动力学分析第78-79页
        3.2.4 杂合酶底物特异性的分子机制第79-84页
    3.3 本章小结第84-85页
4 间位开环产物水解酶的非活性位点残基改造第85-106页
    4.1 材料与方法第85-90页
        4.1.1 材料与方法第85-86页
        4.1.2 实验方法第86-90页
    4.2 结果与讨论第90-105页
        4.2.1 突变位点的选择第90-93页
        4.2.2 Met148位点突变文库的构建和突变体表达第93-94页
        4.2.3 突变体的稳态/非稳态动力学分析第94-97页
        4.2.4 突变体的分子动力学模拟第97-105页
    4.3 本章小结第105-106页
5 间位开环产物水解酶的催化混杂性第106-122页
    5.1 材料与方法第106-108页
        5.1.1 实验材料第106-107页
        5.1.2 实验方法第107-108页
    5.2 结果与讨论第108-121页
        5.2.1 BphD和MfphA的酯酶活性第108-111页
        5.2.2 BphD用于SiO_2和NaTi_2(PO_4)_3的合成第111-121页
    5.3 本章小结第121-122页
6 间位开环产物水解酶的固定化研究第122-145页
    6.1 材料与方法第122-126页
        6.1.1 实验材料第122-123页
        6.1.2 实验方法第123-126页
    6.2 结果与讨论第126-144页
        6.2.1 分子模拟用于MCP水解酶的固定化最优条件预测第126-128页
        6.2.2 SBA-15的合成与表征第128-129页
        6.2.3 MfphA和BphD在SBA-15上的吸附动力学第129-130页
        6.2.4 基于SBA-15的固定化酶特性第130-132页
        6.2.5 间位开环产物水解酶/碳纳米管复合物的制备与催化特性第132-135页
        6.2.6 基于碳纳米管的固定化酶特性第135-139页
        6.2.7 碳纳米管-酶复合物的形成及酶结构的变化第139-142页
        6.2.8 SWCNT对MfphA的抑制机制探索第142-144页
    6.3 本章小结第144-145页
7 结论与展望第145-148页
    7.1 结论第145-146页
    7.2 创新点摘要第146页
    7.3 展望第146-148页
参考文献第148-157页
攻读博士学位期间科研项目及科研成果第157-159页
致谢第159-160页
作者简介第160页

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