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基于高通量测序研究基底硬度与转化生长因子TGF-β1对肝细胞功能的影响

中文摘要第3-4页
英文摘要第4-5页
英文缩写词表第6-10页
1 绪论第10-22页
    1.1 国内外研究现状第10-19页
        1.1.1 TGF-β1 对肝纤维化的影响第12-16页
        1.1.2 基底硬度对细胞功能的影响第16-18页
        1.1.3 高通量测序技术第18-19页
    1.2 问题的提出及研究意义第19-20页
        1.2.1 问题的提出第19-20页
        1.2.2 研究意义第20页
        1.2.3 创新点第20页
    1.3 研究目的与研究内容第20-21页
        1.3.1 研究目的第20页
        1.3.2 研究内容第20-21页
    1.4 技术路线第21-22页
2 硬度可控的基底膜的制备及检测第22-34页
    2.1 引言第22-23页
    2.2 实验材料和实验设备第23-24页
        2.2.1 主要实验细胞第23页
        2.2.2 主要实验试剂第23页
        2.2.3 实验设备第23-24页
        2.2.4 试剂的配制第24页
    2.3 实验方法第24-28页
        2.3.1 聚乙烯醇水凝胶基底膜的制备方法第24-25页
        2.3.2 聚乙烯醇水凝胶弹性模量的测定第25-27页
        2.3.3 扫描电镜观察PVA水凝胶表面形貌第27页
        2.3.4 细胞培养第27页
        2.3.5 细胞凋亡检测方法第27-28页
    2.4 实验结果第28-33页
        2.4.1 PVA水凝胶弹性模量的测量结果第28-29页
        2.4.2 扫描电镜对聚乙烯醇水凝胶基底膜表面形貌的测定结果第29-30页
        2.4.3 细胞凋亡第30页
        2.4.4 细胞形态第30-33页
    2.5 讨论第33-34页
3 高通量测序及基因的挖掘第34-47页
    3.1 引言第34页
    3.2 材料与方法第34-37页
        3.2.1 测序样品准备及RNA的提取第34-35页
        3.2.2 RNA样品质量的检测第35页
        3.2.3 文库建立及测序第35-37页
        3.2.4 数据过滤处理第37页
    3.3 结果与分析第37-45页
        3.3.1 RNA-Seq序列数据比对与质控分析第37-39页
        3.3.2 RNA-Seq差异基因定量分析第39-42页
        3.3.3 RNA-Seq功能注释第42-44页
        3.3.4 肝纤维化相关基因挖掘第44-45页
    3.4 讨论第45-47页
4 基底硬度和TGF-Β1 对肝细胞功能的影响第47-61页
    4.1 引言第47-48页
    4.2 实验材料、设备和试剂第48-50页
        4.2.1 主要实验材料第48-49页
        4.2.2 实验设备第49页
        4.2.3 试剂的配制第49-50页
    4.3 实验方法第50-54页
        4.3.1 免疫荧光第50页
        4.3.2 实时荧光定量PCR(RT-PCR)第50-51页
        4.3.3 western blot(蛋白免疫印迹)第51-54页
    4.4 实验结果及分析第54-59页
        4.4.1 基底硬度和TGF-β1 对肝细胞骨架构象的影响第54-56页
        4.4.2 基底硬度和TGF-β1 对肝细胞骨架及粘附分子的基因表达水平的测定与分析第56-58页
        4.4.3 基底硬度和TGF-β1 对肝细胞骨架及粘附分子的蛋白表达水平的测定与分析第58-59页
    4.5 讨论第59-61页
5 结论与展望第61-63页
    5.1 主要结论第61页
    5.2 后续工作展望第61-63页
致谢第63-64页
参考文献第64-68页

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