| 中文摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 绪论 | 第8-14页 |
| 1.1 课题研究背景意义 | 第8页 |
| 1.2 国内外发展现状 | 第8-10页 |
| 1.2.1 有关于将XML数据文档转换到MS SQL 2008 R2技术 | 第8-9页 |
| 1.2.2 有关于生物的可视化技术 | 第9-10页 |
| 1.3 相关简介 | 第10-11页 |
| 1.3.1 IntAct数据库简介 | 第10-11页 |
| 1.3.2 UniProt数据库简介 | 第11页 |
| 1.4 实验条件介绍 | 第11-12页 |
| 1.5 本文主要研究内容 | 第12-14页 |
| 第二章 数据预处理 | 第14-21页 |
| 2.1 相关简介 | 第14-15页 |
| 2.1.1 分布式计算 | 第14-15页 |
| 2.1.2 XML数据文档 | 第15页 |
| 2.2 下载相关数据 | 第15-16页 |
| 2.3 处理IntAct原始数据 | 第16-17页 |
| 2.4 处理UniProt原始数据 | 第17-21页 |
| 第三章 数据库关联查询 | 第21-26页 |
| 3.1 实验准备 | 第21页 |
| 3.2 相关简介 | 第21-23页 |
| 3.2.1 T-SQL语言说明 | 第21-23页 |
| 3.3 实验步骤 | 第23-26页 |
| 第四章 生成可视化XGMML数据文档 | 第26-36页 |
| 4.1 实验准备 | 第26页 |
| 4.2 相关简介 | 第26-28页 |
| 4.2.1 XGMML文件格式 | 第26-27页 |
| 4.2.2 逆向工程 | 第27-28页 |
| 4.3 问题出现 | 第28页 |
| 4.4 实验原理 | 第28-29页 |
| 4.5 实验步骤 | 第29-36页 |
| 4.5.1 初始化TXT生物学数据网络 | 第29-30页 |
| 4.5.2 编码转换 | 第30-31页 |
| 4.5.3 生成可视化数据文档 | 第31-36页 |
| 第五章 蛋白质XGMML数据文档网络图的网页可视化阶段 | 第36-43页 |
| 5.1 实验准备 | 第36页 |
| 5.2 相关简介 | 第36-38页 |
| 5.2.1 Cytoscape Web | 第36-37页 |
| 5.2.2 JQuery | 第37页 |
| 5.2.3 AJAX | 第37-38页 |
| 5.2.4 HTML语言 | 第38页 |
| 5.2.5 JavaScript | 第38页 |
| 5.3 实验原理 | 第38-39页 |
| 5.4 实验步骤 | 第39-43页 |
| 5.4.1 构建基本网页 | 第39页 |
| 5.4.2 数据访问 | 第39-40页 |
| 5.4.3 呈图 | 第40-43页 |
| 第六章 结论 | 第43-48页 |
| 6.1 数据预处理阶段 | 第43-45页 |
| 6.2 数据关联查询阶段 | 第45-46页 |
| 6.3 生成可视化的XGMML数据文档阶段 | 第46-47页 |
| 6.4 蛋白质XGMML数据文档网络图的网页可视化阶段 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-50页 |
| 在学期间的研究成果 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 附录 | 第52-53页 |