致谢 | 第4-5页 |
中文摘要 | 第5-8页 |
ABSTRACT | 第8-11页 |
第1章 引言 | 第15-27页 |
1.1 热休克蛋白的功能与分类 | 第16-17页 |
1.2 热休克反应 | 第17-18页 |
1.3 热休克蛋白Hsp90的结构与功能 | 第18-24页 |
1.4 Hsp90和肿瘤 | 第24-25页 |
1.5 以Hsp90为靶点的抗肿瘤抑制剂 | 第25-27页 |
第2章 Hsp90功能执行的动力学分子机制研究 | 第27-73页 |
2.1 引言 | 第27-36页 |
2.1.1 ps—ns尺度的运动 | 第28-33页 |
2.1.2 μs–ms时间尺度运动 | 第33-36页 |
2.2 实验材料 | 第36-39页 |
2.2.1 试剂 | 第36-37页 |
2.2.2 菌株和质粒 | 第37页 |
2.2.3 引物 | 第37-38页 |
2.2.4 仪器 | 第38-39页 |
2.3 实验方法 | 第39-49页 |
2.3.1 质粒信息 | 第39页 |
2.3.2 克隆构建 | 第39-41页 |
2.3.3 蛋白质样品的表达 | 第41-42页 |
2.3.4 蛋白质样品的纯化 | 第42-45页 |
2.3.5 Hsp90αNMΔ片段标记蛋白的合成 | 第45-48页 |
2.3.6 Hsp90α(9-236)自由态、Hsp90α(9-236):ADP和Hsp90α(9-236):AMPPCP复合物以及Hsp90α(293-554)的主链化学位移归属 | 第48页 |
2.3.7 Hsp90α(9-236)自由态、Hsp90α(9-236):ADP和Hsp90α(9-236):AMPPCP复合物的动力学行为分析 | 第48-49页 |
2.3.8 NMR滴定实验 | 第49页 |
2.3.9 ITC滴定实验 | 第49页 |
2.4 实验结果 | 第49-70页 |
2.4.1 ATP依赖的Hsp90αN端结构域构象变化机制研究 | 第49-63页 |
2.4.2 ATP依赖的Hsp90αNMΔ(删除了部分富电荷连接区的N端和中间结构域)构象变化机制研究 | 第63-70页 |
2.5 实验小结 | 第70-73页 |
第3章 靶向Hsp90α中间结构域的变构抑制剂发现及其效应机制研究 | 第73-109页 |
3.1 引言 | 第73-79页 |
3.1.1 基于片段的药物筛选 | 第73-76页 |
3.1.2 基于NMR的筛选技术 | 第76-79页 |
3.2 实验材料 | 第79-80页 |
3.2.1 试剂 | 第79-80页 |
3.2.2 菌株和质粒 | 第80页 |
3.2.3 引物 | 第80页 |
3.2.4 仪器 | 第80页 |
3.3 实验方法 | 第80-86页 |
3.3.1 质粒信息 | 第80页 |
3.3.2 克隆的构建 | 第80页 |
3.3.3 蛋白质样品的表达 | 第80-81页 |
3.3.4 蛋白质样品的纯化 | 第81-82页 |
3.3.5 Hsp90α NMΔ 片段标记蛋白的合成 | 第82-83页 |
3.3.6 以Hsp90α (293-554)为靶点的基于片段的活性化合物筛选 | 第83页 |
3.3.7 NMR滴定实验 | 第83-85页 |
3.3.8 细胞增殖抑制实验 | 第85-86页 |
3.4 实验结果 | 第86-107页 |
3.4.1 以Hsp90α中间结构域为靶点的基于片段的活性化合物筛选与阳性化合物结合模式的初步表征 | 第86-90页 |
3.4.2 化合物1-E6的结构优化 | 第90-94页 |
3.4.3 化合物16-171与Hsp90αNMΔ的相互作用模式研究 | 第94-96页 |
3.4.4 共伴侣分子P23存在下16-171化合物与Hsp90αNMΔ相互作用模式研究 | 第96-102页 |
3.4.5 共伴侣分子Aha1存在下化合物16-171与Hsp90αNMΔ的相互作用模式研究 | 第102-107页 |
3.4.6 化合物16-171和16-175的抗肿瘤活性检测 | 第107页 |
3.5 实验小结 | 第107-109页 |
第4章 结果与讨论 | 第109-113页 |
参考文献 | 第113-127页 |
附录 | 第127-139页 |
作者简历 | 第139页 |
攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第139页 |