摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
缩略语表 | 第8-11页 |
1 前言 | 第11-23页 |
1.1 植物硫代谢与缺硫胁迫 | 第11-19页 |
1.1.1 植物硫运输途径 | 第11-13页 |
1.1.2 植物硫同化途径及其机制 | 第13-16页 |
1.1.3 植物缺硫胁迫 | 第16-18页 |
1.1.4 水稻缺硫胁迫的研究现状 | 第18-19页 |
1.2 RNA-seq技术及应用 | 第19-21页 |
1.2.1 RNA-seq技术概述及原理 | 第19-20页 |
1.2.2 RNA-seq技术的应用 | 第20-21页 |
1.3 研究目的及意义 | 第21-23页 |
2 材料与方法 | 第23-33页 |
2.1 实验材料 | 第23-26页 |
2.1.1 主要实验材料 | 第23页 |
2.1.2 主要试剂盒及试剂 | 第23页 |
2.1.3 常用试剂配置 | 第23-25页 |
2.1.4 仪器和设备 | 第25页 |
2.1.5 PCR引物 | 第25-26页 |
2.2 方法 | 第26-31页 |
2.2.0 水稻培养与样品采集 | 第26-27页 |
2.2.1 生化指标的测定 | 第27页 |
2.2.2 水稻总RNA的提取和质量检测 | 第27-28页 |
2.2.3 mRNA-seq文库的构建及高通量测序 | 第28页 |
2.2.4 生物信息学分析 | 第28-29页 |
2.2.5 硫胁迫差异表达基因的验证(qRT-PCR) | 第29-31页 |
2.3 数据统计 | 第31-33页 |
3 结果与分析 | 第33-57页 |
3.1 缺硫胁迫对水稻幼苗生长的影响 | 第33-35页 |
3.2 缺硫胁迫下水稻幼苗生化指标测定 | 第35-38页 |
3.3 缺硫胁迫下转录水平的应答机制 | 第38-57页 |
3.3.1 高通量测序和质控分析 | 第38-40页 |
3.3.2 序列比对 | 第40-41页 |
3.3.3 差异表达基因的筛选与验证 | 第41-44页 |
3.3.4 差异表达基因的功能富集分析 | 第44-49页 |
3.3.5 差异表达转录因子分析 | 第49-51页 |
3.3.6 缺硫胁迫对硫转运及代谢通路基因表达的影响 | 第51-57页 |
4 讨论 | 第57-63页 |
4.1 缺硫处理下水稻幼苗表型及部分生化指标测定 | 第57-59页 |
4.2 水稻缺硫胁迫应答基因的表达调控 | 第59-60页 |
4.3 缺硫胁迫对硫转运及代谢通路基因表达的影响 | 第60-63页 |
5 结论 | 第63-65页 |
参考文献 | 第65-77页 |
致谢 | 第77-79页 |
攻读学位期间发表的学术论文与科研成果 | 第79-81页 |
附录 | 第81-82页 |