基于广义伪氨基酸组成的蛋白质序列的数值刻画
摘要 | 第4-5页 |
ABSTRACT | 第5页 |
1 绪论 | 第8-12页 |
1.1 生物信息学产生的背景及发展 | 第8-9页 |
1.2 生物信息学的主要研究内容 | 第9-11页 |
1.2.1 序列比较 | 第9页 |
1.2.2 系统发育分析 | 第9-10页 |
1.2.3 生物信息学中的分类问题 | 第10-11页 |
1.3 本文的主要工作 | 第11-12页 |
2 特征向量的构造 | 第12-24页 |
2.1 蛋白质序列的图形表示 | 第12-17页 |
2.2 蛋白质序列的数值刻画 | 第17-24页 |
2.2.1 矩阵表示 | 第17-18页 |
2.2.2 序列不变量 | 第18-19页 |
2.2.3 伪氨基酸组成(Pse AAC) | 第19-24页 |
3 基于广义伪氨基酸组成的蛋白质序列的数值刻画 | 第24-38页 |
3.1 方法 | 第24-29页 |
3.1.1 6-字母序列的构造 | 第24-27页 |
3.1.2 (21+λ)维向量的构造 | 第27-29页 |
3.2 结果 | 第29-36页 |
3.2.1 实验I:基于两个数据集的系统发育分析 | 第29-34页 |
3.2.2 实验II: DNA结合蛋白的识别 | 第34-36页 |
3.3 讨论 | 第36-38页 |
3.3.1 氨基酸性质的选择 | 第36页 |
3.3.2 特征分析 | 第36-38页 |
总结与展望 | 第38-39页 |
参考文献 | 第39-45页 |
论文发表情况 | 第45-46页 |
致谢 | 第46-47页 |