| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 1 绪论 | 第9-17页 |
| ·武功山概述 | 第9页 |
| ·DNA测序概述 | 第9-10页 |
| ·草甸退化研究现状 | 第10-11页 |
| ·自然因子 | 第10页 |
| ·人为因子 | 第10页 |
| ·社会因子 | 第10-11页 |
| ·微生物多样性研究方法 | 第11-14页 |
| ·土壤微生物多样性的概念 | 第11-12页 |
| ·土壤微生物多样性方法研究 | 第12-14页 |
| ·经典土壤微生物研究方法 | 第12-13页 |
| ·磷脂脂肪酸(PLFA)分析法的应用 | 第13页 |
| ·群落水平单碳源利用模式(CLPP) | 第13页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术的应用 | 第13-14页 |
| ·DNA测序方法 | 第14-15页 |
| ·第一代高通量测序方法 | 第14页 |
| ·第二代高通量测序方法 | 第14-15页 |
| ·第三代高通量测序方法 | 第15页 |
| ·高通量测序在微生物研究的利用现状 | 第15页 |
| ·研究的目的与意义 | 第15-17页 |
| 2 试验内容与设计 | 第17-21页 |
| ·研究内容 | 第17页 |
| ·研究区概况 | 第17-18页 |
| ·研究区概况 | 第17页 |
| ·试验地选择 | 第17-18页 |
| ·研究的技术路线图 | 第18-19页 |
| ·材料与方法 | 第19页 |
| ·样品采集与测试 | 第19页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第19页 |
| ·测序 | 第19页 |
| ·PCR扩增 | 第19页 |
| ·PCR产物的混样和纯化 | 第19页 |
| ·文库构建和上机测序 | 第19页 |
| ·信息分析流程 | 第19-21页 |
| ·测序数据处理 | 第19-20页 |
| ·OTU聚类和物种注释 | 第20页 |
| ·样品复杂度分析（Alpha Diversity） | 第20页 |
| ·多样品比较分析（Beta Diversity） | 第20-21页 |
| 3 结果与分析 | 第21-38页 |
| ·武功山金顶区域土壤养分总体特征 | 第21-22页 |
| ·RAW Data预处理统计及质控统计 | 第22-23页 |
| ·OTU分析及物种注释 | 第23-27页 |
| ·OTU分析 | 第23-25页 |
| ·物种注释 | 第25-27页 |
| ·武功山退化草甸土壤微生物群落多样性分析 | 第27-33页 |
| ·物种多样性曲线 | 第27-31页 |
| ·物种多样性指数分析 | 第31-32页 |
| ·Alpha多样性指数组间差异分析 | 第32-33页 |
| ·武功山退化草甸土壤微生物群落结构分析 | 第33-38页 |
| 4 结论与展望 | 第38-40页 |
| ·结论 | 第38页 |
| ·讨论与展望 | 第38-40页 |
| 参考文献 | 第40-44页 |
| 致谢 | 第44页 |