摘要 | 第1-9页 |
Abstract | 第9-11页 |
第一章 引言 | 第11-19页 |
·选题背景及意义 | 第11-12页 |
·国内外研究现状 | 第12-17页 |
·蛋白质结构预测方法的研究现状 | 第12-15页 |
·噪声算法的研究现状 | 第15-17页 |
·本文的主要工作 | 第17-18页 |
·本文的结构安排 | 第18-19页 |
第二章 蛋白质结构预测的理论知识 | 第19-30页 |
·蛋白质的基本内容 | 第19-24页 |
·蛋白质基础 | 第19-22页 |
·蛋白质的层次结构 | 第22-24页 |
·蛋白质数据库 | 第24页 |
·蛋白质结构预测方法 | 第24-26页 |
·同源建模法 | 第25页 |
·反向折叠法 | 第25页 |
·从头预测法 | 第25-26页 |
·经典的蛋白质结构预测优化模型 | 第26-29页 |
·格点模型 | 第26-27页 |
·非格点模型 | 第27-29页 |
·本章小结 | 第29-30页 |
第三章 基于列表的噪声算法 | 第30-46页 |
·预备知识 | 第30-32页 |
·TSP问题 | 第30-31页 |
·噪声算法的基本原理 | 第31-32页 |
·应用于TSP问题的噪声算法 | 第32页 |
·基于列表的噪声算法LBNM的基本内容 | 第32-35页 |
·邻域结构 | 第32-33页 |
·产生初始噪声列表 | 第33-34页 |
·基于列表的降噪策略 | 第34页 |
·LBNM算法描述 | 第34-35页 |
·仿真实验结果与分析 | 第35-45页 |
·基于列表的降噪策略与其他降噪策略的比较分析 | 第35-38页 |
·LBNM算法对噪声列表长度的敏感度分析 | 第38-39页 |
·对不同的邻域结构进行比较 | 第39-40页 |
·LBNM算法与其他算法的比较分析 | 第40-45页 |
·本章小结 | 第45-46页 |
第四章 基于列表的噪声算法在蛋白质结构预测中的应用 | 第46-66页 |
·基于列表的多agent自适应邻域噪声算法 | 第46-52页 |
·自适应的邻域结构 | 第46-48页 |
·Multi-move | 第48页 |
·Multi-agent | 第48-49页 |
·采样粒度 | 第49-50页 |
·MLBNM算法描述 | 第50-52页 |
·蛋白质测试序列 | 第52页 |
·对蛋白质序列的仿真实验和结果分析 | 第52-65页 |
·Multi-move仿真结果及分析 | 第53-56页 |
·独立并行与使用信息交互策略的性能比较 | 第56-58页 |
·四条Fibonacci人工蛋白质的预测性能比较 | 第58-61页 |
·四条较短真实蛋白质序列的仿真结果与分析 | 第61-63页 |
·两条较长真实蛋白质序列的仿真结果与分析 | 第63-65页 |
·本章小结 | 第65-66页 |
第五章 总结与展望 | 第66-68页 |
参考文献 | 第68-73页 |
致谢 | 第73页 |