| 缩略词 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-29页 |
| 1 反转录转座子研究进展 | 第13-23页 |
| ·水仙起源与分布 | 第13页 |
| ·LTR 类反转录转座子的类型、结构特点和转座机制 | 第13-16页 |
| ·LTR 类反转录转座子的类型、结构特点 | 第13-15页 |
| ·LTR 类反转录转座子的转座原理 | 第15-16页 |
| ·反转录转座子的特征 | 第16-18页 |
| ·分布 | 第16-17页 |
| ·反转录转座子的高度异质性 | 第17-18页 |
| ·反转录转座子高拷贝性 | 第18页 |
| ·反转录转座子的活性及其对基因组的影响 | 第18-20页 |
| ·反转录转座子的活性 | 第18-19页 |
| ·反转录转座子对基因组的影响 | 第19-20页 |
| ·基于反转录转座子的分子标记及其应用 | 第20-23页 |
| ·基于反转录转座子的分子标记及其类型 | 第20-21页 |
| ·基于反转录转座子的标记开发与应用 | 第21-23页 |
| 2 BAC 文库 | 第23-29页 |
| ·BAC 文库的构建 | 第25-27页 |
| ·高分子量核 DNA 的制备及部分消化 | 第25-27页 |
| ·酶切的核 DNA 片段和载体的连接、转化 | 第27页 |
| ·人工选取单克隆 | 第27页 |
| ·对构建的文库进行质量鉴定 | 第27页 |
| ·鉴定酶切后得到的片段大小 | 第27页 |
| ·验证细胞器 DNA 的含量 | 第27页 |
| ·文库构建的类型 | 第27-28页 |
| ·BAC 文库的主要应用 | 第28-29页 |
| ·基因的图位克隆 | 第28页 |
| ·转基因研究 | 第28页 |
| ·构建的文库测序 | 第28-29页 |
| 第二章 中国水仙 BAC 文库的构建与评价 | 第29-43页 |
| 1 材料与方法 | 第29-35页 |
| ·试验材料 | 第29-30页 |
| ·HMW-DNA 的制备 | 第30页 |
| ·HMW-DNA 的酶切和二次回收 | 第30页 |
| ·Southern blot 检测细胞器 DNA 的污染 | 第30-34页 |
| ·水仙叶片 RNA 的提取 | 第30-31页 |
| ·cDNA 第一链的合成 | 第31-32页 |
| ·photosystem II CP43 蛋白保守序列的克隆 | 第32-33页 |
| ·PCR 产物的回收、纯化 | 第33页 |
| ·PCR 扩增产物与克隆载体的连接 | 第33页 |
| ·连接产物的转化、测序 | 第33页 |
| ·水仙 photosystem II CP43 蛋白保守序列探针制备及效率检测 | 第33-34页 |
| ·HMW-DNA 过度酶切及转膜 | 第34页 |
| ·杂交、洗膜和免疫检测 | 第34页 |
| ·连接、转化体系的建立 | 第34-35页 |
| ·BAC 文库质量检测 | 第35页 |
| ·用 Southern blot 检测细胞器 DNA | 第35页 |
| ·BAC 文库片段大小检测 | 第35页 |
| 2 结果与分析 | 第35-40页 |
| ·水仙大片段 DNA 的检测 | 第35-36页 |
| ·HMW-DNA 的部分酶切 | 第36页 |
| ·Southern blot 检测细胞器 DNA 的污染 | 第36-38页 |
| ·水仙 RNA 的提取及 RT-PCR | 第36-37页 |
| ·HMW-DNA 过度酶切及转膜 | 第37-38页 |
| ·Southern blot 检测细胞器 DNA 污染结果 | 第38页 |
| ·大片段 DNA 的分离和回收 | 第38页 |
| ·连接、转化体系优化结果 | 第38-39页 |
| ·Southern blot 检测细胞器 DNA | 第39-40页 |
| ·文库的保存 | 第40页 |
| ·BAC 文库插入片段大小检测 | 第40页 |
| ·文库测序 | 第40页 |
| 3 讨论 | 第40-42页 |
| ·文库构建 | 第40-42页 |
| ·文库质量及作用 | 第42页 |
| 4 小结 | 第42-43页 |
| 第三章 BAC 末端测序与 LTR 反转录转座子的分离 | 第43-56页 |
| 1 材料与方法 | 第43-45页 |
| ·试验材料 | 第43页 |
| ·方法 | 第43-45页 |
| ·BAC DNA 的提取与末端测序 | 第43页 |
| ·水仙叶片总 DNA 的提取 | 第43-44页 |
| ·总 DNA 的检测 | 第44页 |
| ·LTR 的 PCR 引物设计、PCR 扩增和电泳 | 第44-45页 |
| 2 结果与分析 | 第45-53页 |
| ·BAC 克隆的末端序列结果分析 | 第45页 |
| ·水仙 DNA 的质量和完整性的检测 | 第45-47页 |
| ·DNA 质量的检测 | 第45-46页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳检测 DNA 的完整性 | 第46-47页 |
| ·反转录转座子的反转录酶序列克隆 | 第47-48页 |
| ·参考 Voytas 等设计引物克隆反转录酶序列 | 第47页 |
| ·copia-like 反转录转座子的反转录酶序列克隆 | 第47-48页 |
| ·copia-like 反转录转座子的 RT 序列比较及分类 | 第48-53页 |
| 3 讨论 | 第53-54页 |
| ·LTR 反转录转座子 RT 基因保守区克隆 | 第53-54页 |
| ·LTR 反转录转座子的异质性 | 第54页 |
| ·水仙种间亲缘关系及进化 | 第54页 |
| 4 小结 | 第54-56页 |
| 第四章 水仙 IRAP 和 REMAP 标记开发及水仙品种间多态性分析 | 第56-68页 |
| 1 材料与方法 | 第56-61页 |
| ·材料 | 第56-58页 |
| ·总 DNA 提取 | 第58页 |
| ·引物设计 | 第58-59页 |
| ·IRAP 引物检测 | 第59页 |
| ·REMAP 引物检测 | 第59页 |
| ·六个多花水仙品种的 RAPD 分析 | 第59-60页 |
| ·6 个多花水仙品种的 ISSR 分析 | 第60页 |
| ·6 个多花水仙品种的 IRAP 分析 | 第60-61页 |
| ·6 个多花水仙品种的 REMAP 分析 | 第61页 |
| 2 结果与分析 | 第61-66页 |
| ·IRAP 引物筛选结果 | 第61-62页 |
| ·REMAP 引物组合筛选结果 | 第62页 |
| ·RAPD 引物扩增结果 | 第62-63页 |
| ·ISSR 引物扩增结果 | 第63-64页 |
| ·IRAP 引物扩增结果 | 第64-65页 |
| ·REMAP 引物扩增结果 | 第65-66页 |
| 3 讨论 | 第66-67页 |
| 4 结论与展望 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-80页 |
| 附录 1：水仙基因组反转录转座子 3’-LTR 序列 | 第80-82页 |
| 附录 2：水仙反转录转座子 RT 序列 | 第82-91页 |
| 附录 3：部分 BAC 末端测序序列 | 第91-106页 |
| 致谢 | 第106页 |
