| 摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩略词索引 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-29页 |
| 1 草菇 | 第13-22页 |
| ·概况 | 第13-14页 |
| ·草菇不同生长发育时期的生物学特征 | 第14-22页 |
| 2 蛋白组学研究进展 | 第22-25页 |
| ·蛋白质组研究方法 | 第23-25页 |
| ·真菌蛋白质组学的主要研究内容 | 第25页 |
| 3 食用菌蛋白质组学的研究现状 | 第25-27页 |
| 4 本课题的研究背景、工作基础和主要研究内容 | 第27-29页 |
| ·本课题的研究背景 | 第27-28页 |
| ·本研究的工作基础 | 第28页 |
| ·主要研究内容 | 第28-29页 |
| 第二章 菌丝样品和子实体样品的制备 | 第29-43页 |
| 1 材料和方法 | 第29-32页 |
| ·供试菌株和培养基 | 第29页 |
| ·菌落形态观察 | 第29-30页 |
| ·草菇菌丝培养和收集 | 第30页 |
| ·DNA 提取和纯度鉴定 | 第30页 |
| ·草菇同核菌株和异核菌株的 SV 标记验证 | 第30-31页 |
| ·出菇实验 | 第31-32页 |
| ·子实体采集及显微观察 | 第32页 |
| 2 结果与分析 | 第32-41页 |
| ·草菇菌株的活化及菌落形态观察 | 第32-35页 |
| ·不可孕同核菌株和可孕异核菌株的 SV 鉴定 | 第35-37页 |
| ·草菇三个菌丝样品的采集及形态观察 | 第37-38页 |
| ·草菇五个不同生长发育时期子实体样品的采集及形态观察 | 第38-41页 |
| 3 讨论 | 第41-42页 |
| 4 小结 | 第42-43页 |
| 第三章 草菇不同生长发育时期蛋白质组的 ITRAQ 结合 2D LC-MS/MS 分析 | 第43-64页 |
| 1 材料和方法 | 第43-51页 |
| ·供试样品 | 第43页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第43-44页 |
| ·实验方法 | 第44-51页 |
| 2 结果与分析 | 第51-62页 |
| ·草菇不同发育时期蛋白样品质量检测结果 | 第51-55页 |
| ·iTRAQ 结合 2D LC-MS/MS 分析结果 | 第55-61页 |
| ·理化性质分析结果 | 第61-62页 |
| 3 讨论 | 第62-63页 |
| 4 小结 | 第63-64页 |
| 第四章 草菇不同生长发育时期蛋白质组数据的生物信息学分析 | 第64-123页 |
| 1 材料和方法 | 第64-68页 |
| ·原始数据 | 第64-65页 |
| ·外源数据库蛋白质信息获取 | 第65页 |
| ·草菇不同生长发育时期蛋白质组数据全局分析 | 第65-66页 |
| ·主成分分析 | 第65页 |
| ·全局相关性计算 | 第65页 |
| ·相关系数热图 | 第65页 |
| ·层次聚类分析 | 第65-66页 |
| ·K-均值计算 | 第66页 |
| ·草菇不同生长发育时期差异蛋白质组数据分析 | 第66-68页 |
| ·相关系数 | 第66页 |
| ·差异蛋白质筛选 | 第66页 |
| ·差异蛋白理化性质分析 | 第66页 |
| ·GO 分析 | 第66-67页 |
| ·KEGG 代谢通路分析 | 第67-68页 |
| ·差异蛋白质互作网络分析 | 第68页 |
| 2 结果与分析 | 第68-118页 |
| ·草菇不同生长发育时期蛋白质组数据全局分析结果 | 第68-75页 |
| ·主成分分析结果 | 第68-69页 |
| ·全局相关性计算结果 | 第69-70页 |
| ·相关系数热图分析结果 | 第70-71页 |
| ·层次聚类分析结果 | 第71-73页 |
| ·K-均值计算结果 | 第73-75页 |
| ·草菇不同生长发育时期差异蛋白质组数据分析结果 | 第75-118页 |
| ·差异蛋白质相关系数分析结果 | 第75页 |
| ·差异蛋白筛选结果 | 第75-77页 |
| ·差异蛋白质理化性质分析 | 第77-79页 |
| ·GO 注释分析结果 | 第79-86页 |
| ·KEGG 代谢通路分析结果 | 第86-107页 |
| ·差异蛋白质互作网络分析结果 | 第107-118页 |
| 3 讨论 | 第118-122页 |
| 4 小结 | 第122-123页 |
| 总结与展望 | 第123-124页 |
| 参考文献 | 第124-134页 |
| 附件 | 第134-167页 |
| 致谢 | 第167-168页 |
| 在读期间发表论文和参加基金项目 | 第168页 |
