| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-19页 |
| 第一章 绪论 | 第19-36页 |
| ·研究背景 | 第19-22页 |
| ·分子系统地理学及其在头足类中的应用 | 第22-29页 |
| ·分子系统地理学的建立与发展 | 第22-24页 |
| ·头足类分子系统地理学的研究进展 | 第24-29页 |
| ·头足类的种群遗传结构 | 第24-25页 |
| ·头足类系统地理格局 | 第25-26页 |
| ·影响头足类系统地理格局的因素 | 第26-28页 |
| ·系统演化关系—从系统进化的角度探讨头足类的分布格局 | 第28-29页 |
| ·国内外研究现状及存在问题 | 第29-32页 |
| ·国内外研究现状 | 第29-31页 |
| ·存在的问题 | 第31-32页 |
| ·研究内容与意义 | 第32-36页 |
| ·研究内容 | 第32-33页 |
| ·技术路线 | 第33-34页 |
| ·研究目的与意义 | 第34-36页 |
| 第二章 柔鱼类 SSR 标记的分离、鉴定及通用性检测 | 第36-62页 |
| ·柔鱼 SSR 标记的分离与鉴定 | 第36-46页 |
| ·材料与方法 | 第36-41页 |
| ·实验材料 | 第36-37页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第37页 |
| ·微卫星富集文库的构建 | 第37-39页 |
| ·测序、引物设计及 SSR 标记的筛选 | 第39-40页 |
| ·微卫星 PCR 扩增 | 第40页 |
| ·PCR 产物的纯化及其分子量数据的读取 | 第40页 |
| ·数据统计与分析 | 第40-41页 |
| ·结果 | 第41-46页 |
| ·基因组 DNA 酶切与 SSR 目的片段的检测 | 第41-42页 |
| ·阳性克隆的筛选与鉴定 | 第42-43页 |
| ·测序结果与 SSR 标记的筛选 | 第43-44页 |
| ·SSR 位点多态性 | 第44-46页 |
| ·茎柔鱼 SSR 标记的分离与鉴定 | 第46-55页 |
| ·材料与方法 | 第46-47页 |
| ·实验材料 | 第46页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第46页 |
| ·PE 文库的制备与测序 | 第46页 |
| ·引物设计及 SSR 标记的筛选 | 第46页 |
| ·微卫星 PCR 扩增 | 第46-47页 |
| ·PCR 产物的纯化及其分子量数据的读取 | 第47页 |
| ·数据统计与分析 | 第47页 |
| ·结果 | 第47-55页 |
| ·SSR 在茎柔鱼基因组中的分布 | 第47-50页 |
| ·SSR 位点的多态性 | 第50-55页 |
| ·3种柔鱼类 SSR 标记的通用性检测 | 第55-59页 |
| ·材料与方法 | 第55-56页 |
| ·实验材料 | 第55页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第55页 |
| ·微卫星 PCR 扩增 | 第55页 |
| ·PCR 产物的纯化及其分子量数据的读取 | 第55页 |
| ·数据统计与分析 | 第55-56页 |
| ·结果 | 第56-59页 |
| ·讨论 | 第59-62页 |
| ·SSR 标记的获得方法 | 第59-60页 |
| ·SSR 标记的通用性检测 | 第60页 |
| ·无效等位基因 | 第60-62页 |
| 第三章 北太平洋柔鱼分子系统地理学研究 | 第62-87页 |
| ·基于 mtDNA 标记的北太平洋柔鱼分子系统地理学研究 | 第63-76页 |
| ·材料与方法 | 第63-65页 |
| ·实验材料 | 第63-64页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第64页 |
| ·PCR 扩增 | 第64页 |
| ·PCR 产物的纯化与测序 | 第64页 |
| ·数据分析 | 第64-65页 |
| ·结果 | 第65-76页 |
| ·序列分析 | 第65-72页 |
| ·种群遗传结构 | 第72-75页 |
| ·群体历史动态 | 第75-76页 |
| ·基于 SSR 标记的北太平洋柔鱼种群遗传结构研究 | 第76-82页 |
| ·材料与方法 | 第76-77页 |
| ·实验材料 | 第76页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第76页 |
| ·微卫星 PCR 扩增 | 第76页 |
| ·PCR 产物的纯化及其分子量数据的读取 | 第76页 |
| ·数据统计与分析 | 第76-77页 |
| ·结果 | 第77-82页 |
| ·SSR 位点的多态性及群体的遗传多样性 | 第77-78页 |
| ·群体遗传分化与种群遗传结构 | 第78-82页 |
| ·讨论 | 第82-87页 |
| ·群体遗传多样性 | 第82-83页 |
| ·种群遗传结构与管理单元的划分 | 第83-84页 |
| ·柔鱼的生活史特征及栖息地海洋环境条件 | 第84-85页 |
| ·群体历史动态 | 第85-87页 |
| 第四章 西南大西洋阿根廷滑柔鱼分子系统地理学研究 | 第87-102页 |
| ·基于线粒体 DNA 标记的阿根廷滑柔鱼分子系统地理学研究 | 第88-95页 |
| ·材料与方法 | 第88-90页 |
| ·实验材料 | 第88页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第88-89页 |
| ·PCR 扩增 | 第89页 |
| ·PCR 产物的纯化与测序 | 第89页 |
| ·数据分析 | 第89-90页 |
| ·结果 | 第90-95页 |
| ·序列分析 | 第90-91页 |
| ·群体遗传多样性 | 第91-92页 |
| ·群体遗传分化 | 第92-94页 |
| ·群体历史动态 | 第94-95页 |
| ·阿根廷滑柔鱼 2 个产卵群遗传变异的微卫星分析 | 第95-99页 |
| ·材料与方法 | 第95-96页 |
| ·实验材料 | 第95页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第95页 |
| ·微卫星 PCR 扩增 | 第95页 |
| ·PCR 产物的纯化及其分子量数据的读取 | 第95页 |
| ·数据统计与分析 | 第95-96页 |
| ·结果 | 第96-99页 |
| ·SSR 位点多态性与群体遗传多样性 | 第96-98页 |
| ·群体间遗传分化 | 第98-99页 |
| ·讨论 | 第99-102页 |
| ·群体遗传多样性与遗传分化 | 第99页 |
| ·阿根廷滑柔鱼生活史特征及栖息地海洋环境条件 | 第99-101页 |
| ·群体历史动态 | 第101-102页 |
| 第五章 东太平洋茎柔鱼分子系统地理学研究 | 第102-126页 |
| ·基于线粒体 DNA 标记的东太平洋茎柔鱼分子系统地理学研究 | 第103-110页 |
| ·材料与方法 | 第103-104页 |
| ·实验材料 | 第103页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第103页 |
| ·PCR 扩增 | 第103页 |
| ·PCR 产物的纯化与测序 | 第103-104页 |
| ·数据分析 | 第104页 |
| ·结果 | 第104-110页 |
| ·序列分析 | 第104-106页 |
| ·群体遗传多样性 | 第106-107页 |
| ·群体间遗传分化 | 第107-109页 |
| ·群体历史动态 | 第109-110页 |
| ·基于 SSR 标记的茎柔鱼赤道海域群体与秘鲁外海群体遗传变异分析 | 第110-114页 |
| ·材料与方法 | 第110-113页 |
| ·实验材料 | 第110页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第110页 |
| ·微卫星 PCR 扩增 | 第110页 |
| ·PCR 产物的纯化及其分子量数据的读取 | 第110页 |
| ·数据统计与分析 | 第110-113页 |
| ·结果 | 第113-114页 |
| ·SSR 位点的多态性 | 第113页 |
| ·群体遗传多样性及群体间遗传分化 | 第113-114页 |
| ·秘鲁外海茎柔鱼大型群与中型群的遗传变异分析 | 第114-121页 |
| ·材料与方法 | 第114-116页 |
| ·实验材料 | 第114-115页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第115页 |
| ·PCR 扩增 | 第115页 |
| ·PCR 产物的纯化、测序及分子量数据的读取 | 第115页 |
| ·数据分析 | 第115-116页 |
| ·结果 | 第116-121页 |
| ·Cytb 与 COⅠ基因片段序列分析 | 第116-118页 |
| ·群体遗传多样性 | 第118-120页 |
| ·群体间遗传分化 | 第120-121页 |
| ·讨论 | 第121-126页 |
| ·群体遗传多样性 | 第121页 |
| ·种群遗传结构及管理单元的划分 | 第121-123页 |
| ·茎柔鱼的生活史特征及栖息地海洋环境条件 | 第123页 |
| ·群体历史动态 | 第123-126页 |
| 第六章 柔鱼类分子系统学研究 | 第126-135页 |
| ·分子系统学及其在头足类中的应用 | 第126-127页 |
| ·柔鱼类分子系统学研究 | 第127-135页 |
| ·材料与方法 | 第127-129页 |
| ·样本采集与基因组 DNA 的提取 | 第127-129页 |
| ·PCR 扩增及测序 | 第129页 |
| ·数据分析 | 第129页 |
| ·结果 | 第129-132页 |
| ·序列分析 | 第129-132页 |
| ·种间分化时间 | 第132页 |
| ·讨论 | 第132-135页 |
| 第七章 主要结论与展望 | 第135-137页 |
| ·主要结论 | 第135页 |
| ·存在的问题与展望 | 第135-137页 |
| 参考文献 | 第137-152页 |
| 博士期间科研情况 | 第152-154页 |
| 致谢 | 第154页 |
