| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-20页 |
| 第一部分 水稻稻曲病菌的研究 | 第20-97页 |
| 第一章 文献综述 | 第20-37页 |
| 1 水稻稻曲菌介绍 | 第21-25页 |
| ·稻曲菌的命名和分类地位 | 第21页 |
| ·稻曲菌分离方法 | 第21-23页 |
| ·厚垣孢子悬浮液法 | 第22页 |
| ·组织块分离 | 第22页 |
| ·稻曲球分离法 | 第22页 |
| ·菌核分离法 | 第22-23页 |
| ·稻曲病菌的孢子 | 第23-24页 |
| ·厚垣孢子 | 第23页 |
| ·子囊孢子 | 第23-24页 |
| ·分生孢子 | 第24页 |
| ·稻曲病的侵染循环 | 第24-25页 |
| ·稻曲病的侵染源 | 第24-25页 |
| ·侵染时期和侵染途径 | 第25页 |
| 2 脉冲电泳核型分析技术 | 第25-30页 |
| ·PFGE技术的原理 | 第25-26页 |
| ·PFGE技术的种类及其特点 | 第26-27页 |
| ·脉冲场梯度凝胶电泳(Pulsed field gradient gel electrophoresis,PFGGE) | 第26页 |
| ·正向交变电场凝胶电泳(Orthogonal field alternation gel electrophoresis,OFAGE) | 第26页 |
| ·横向交变凝胶电泳(Transverse alternating field gel electrophoresis,TAFE) | 第26页 |
| ·倒转电场凝胶电泳(Field inversion gel electrophoresis,FIGE) | 第26-27页 |
| ·转动凝胶电泳(Roatating gel electrophoresis,RGE) | 第27页 |
| ·转动电场电泳(Rotating gel electrophoresis,RFE) | 第27页 |
| ·双重脉冲场凝胶电泳(Secondary pulsed field gel electrophoresis,SPFG) | 第27页 |
| ·钳位均匀电场电泳(Contour-Clamped homogeneous electric field,CHEF) | 第27页 |
| ·PFGE的影响因素 | 第27-28页 |
| ·缓冲液与温度的影响 | 第28页 |
| ·脉冲电压的影响 | 第28页 |
| ·脉冲角度的影响 | 第28页 |
| ·脉冲时间的影响 | 第28页 |
| ·PFGE技术的应用 | 第28-30页 |
| ·染色体分离、核型分析 | 第29页 |
| ·基因定位 | 第29页 |
| ·分类鉴定 | 第29-30页 |
| 3 根癌农杆菌介导真菌 | 第30-33页 |
| ·ATMT转化原理 | 第31页 |
| ·ATMT技术过程 | 第31-32页 |
| ·构建双元载体 | 第31页 |
| ·工程菌株的培养与处理 | 第31-32页 |
| ·共培养、转化 | 第32页 |
| ·阳性转子的鉴定 | 第32页 |
| ·ATMT介导真菌的应用 | 第32-33页 |
| 4 真菌交配型研究 | 第33-34页 |
| ·交配型基因的结构 | 第33页 |
| ·真菌交配型基因功能 | 第33页 |
| ·稻曲病菌交配型研究现状 | 第33-34页 |
| 5 真菌基因组研究 | 第34-36页 |
| ·真菌基因组研究情况 | 第34页 |
| ·真菌基因组测序方法 | 第34-36页 |
| ·基于鸟枪法的真菌进组测序 | 第34-35页 |
| ·第二代测序技术 | 第35-36页 |
| 6 本课题的立题依据和研究目的 | 第36-37页 |
| 第二章 水稻稻曲菌的分离 | 第37-48页 |
| 1 材料与方法 | 第37-42页 |
| ·材料 | 第37-40页 |
| ·稻曲球样本收集和保存 | 第37-39页 |
| ·培养基 | 第39页 |
| ·抗生素 | 第39页 |
| ·实验试剂 | 第39-40页 |
| ·鉴定稻曲菌的PCR引物 | 第40页 |
| ·方法 | 第40-42页 |
| ·稻曲菌的分离与纯化 | 第40-41页 |
| ·稻曲菌检测 | 第41-42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-46页 |
| ·稻曲菌的分离 | 第42-44页 |
| ·稻曲菌菌落形态 | 第44-45页 |
| ·PCR鉴定分离菌株 | 第45-46页 |
| 3 讨论 | 第46-48页 |
| 第三章 稻曲菌形态学研究 | 第48-54页 |
| 1 材料与方法 | 第48-49页 |
| ·材料 | 第48页 |
| ·稻曲菌菌株、稻曲球、菌核 | 第48页 |
| ·主要仪器 | 第48页 |
| ·主要实验试剂 | 第48页 |
| ·培养基 | 第48页 |
| ·方法 | 第48-49页 |
| ·稻曲菌培养性状观察 | 第48-49页 |
| ·稻曲菌的厚垣孢子显微观察 | 第49页 |
| ·稻曲菌的菌核观察 | 第49页 |
| 2 结果与分析 | 第49-53页 |
| ·稻曲菌培养性状观察 | 第49页 |
| ·稻曲菌厚垣孢子和分生孢子萌发的显微观察 | 第49-50页 |
| ·厚垣孢子的扫描电镜观察 | 第50-52页 |
| ·稻曲菌菌核的电镜观察 | 第52-53页 |
| 3 讨论 | 第53-54页 |
| 第四章 稻曲菌生物学特性的研究 | 第54-68页 |
| 1 材料与方法 | 第54-57页 |
| ·材料 | 第54-55页 |
| ·供试菌株 | 第54页 |
| ·培养基 | 第54页 |
| ·主要生化试剂 | 第54-55页 |
| ·方法 | 第55-57页 |
| ·不同培养基对稻曲菌菌丝生长的影响 | 第55页 |
| ·碳、氮源对稻曲菌菌丝生长的影响 | 第55页 |
| ·温度对稻曲菌菌丝生长的影响 | 第55页 |
| ·pH对稻曲菌菌丝生长的影响 | 第55-56页 |
| ·水势对稻曲菌菌丝生长的影响 | 第56页 |
| ·光照对稻曲菌菌丝生长的影响 | 第56页 |
| ·温度和培养时间对稻曲菌分生孢子的影响 | 第56页 |
| ·稻曲菌分生孢子致死温度测定 | 第56页 |
| ·数据统计分析 | 第56-57页 |
| 2 结果与分析 | 第57-65页 |
| ·培养基对稻曲菌菌丝生长的影响 | 第57-58页 |
| ·C、N源对菌丝生长的影响 | 第58-60页 |
| ·温度对稻曲菌菌丝生长的影响 | 第60-61页 |
| ·pH对稻曲菌菌丝生长的影响 | 第61-62页 |
| ·水势对稻曲菌菌丝生长的影响 | 第62-63页 |
| ·光照对稻曲菌菌丝生长的影响 | 第63-64页 |
| ·温度和保湿时间对稻曲菌分生孢子的影响 | 第64-65页 |
| ·稻曲菌分生孢子致死温度测定 | 第65页 |
| 3 讨论 | 第65-68页 |
| 第五章 稻曲菌核型分析 | 第68-75页 |
| 1 材料与方法 | 第68-69页 |
| ·材料 | 第68页 |
| ·菌株 | 第68页 |
| ·主要仪器 | 第68页 |
| ·主要试剂 | 第68页 |
| ·方法 | 第68-69页 |
| ·脉冲电泳胶块制备和处理 | 第68-69页 |
| ·脉冲电泳 | 第69页 |
| 2 结果与分析 | 第69-73页 |
| ·稻曲菌的分生孢子和菌丝核型观察 | 第69-70页 |
| ·CHEF凝胶电泳 | 第70页 |
| ·脉冲电泳分析 | 第70-73页 |
| 3 讨论 | 第73-75页 |
| 第六章 稻曲菌GFP的转化 | 第75-81页 |
| 1 材料与方法 | 第75-78页 |
| ·材料 | 第75-76页 |
| ·供试菌株 | 第75页 |
| ·培养基 | 第75页 |
| ·抗生素以及化学试剂 | 第75-76页 |
| ·方法 | 第76-78页 |
| ·根癌农杆菌培养 | 第76-77页 |
| ·稻曲菌分生孢子培养 | 第77页 |
| ·稻曲菌对潮霉素B(Hyg)浓度的敏感性测定 | 第77页 |
| ·转化 | 第77页 |
| ·稻曲菌转化子的PCR检测 | 第77-78页 |
| 2 结果与分析 | 第78-80页 |
| ·稻曲菌对潮霉素B(Hyg)浓度的敏感性测定 | 第78页 |
| ·阳性转化子的筛选 | 第78-79页 |
| ·稻曲菌阳性转化子的PCR检测 | 第79-80页 |
| 3 讨论 | 第80-81页 |
| 第七章 稻曲菌交配型的鉴定 | 第81-91页 |
| 1 材料与方法 | 第81-84页 |
| ·材料 | 第81-82页 |
| ·供试菌株 | 第81页 |
| ·培养基 | 第81页 |
| ·抗生素和诱导剂 | 第81页 |
| ·生化试剂 | 第81-82页 |
| ·鉴定Mating type基因PCR引物 | 第82页 |
| ·方法 | 第82-84页 |
| ·DNA提取 | 第82页 |
| ·Mating type基因的PCR扩增 | 第82-83页 |
| ·PCR产物电泳及回收 | 第83页 |
| ·Mating type基因的克隆与测序 | 第83页 |
| ·Multiplex PCR检测Mating type基因的分布 | 第83页 |
| ·Multiplex PCR鉴定子囊孢子菌株的Mating type基因 | 第83-84页 |
| 2 结果与分析 | 第84-89页 |
| ·稻曲菌MAT基因的鉴定 | 第84-85页 |
| ·蛋白序列对比和系统发育关系分析 | 第85-87页 |
| ·Mating-type基因在自然界菌株中的分布情况 | 第87-89页 |
| ·稻曲菌的交配型鉴定 | 第89页 |
| 3 讨论 | 第89-91页 |
| 第八章 稻曲菌基因组初步分析 | 第91-97页 |
| 1 材料与方法 | 第91-93页 |
| ·材料 | 第91-92页 |
| ·供试菌株 | 第91页 |
| ·培养基 | 第91页 |
| ·主要化学试剂 | 第91-92页 |
| ·方法 | 第92-93页 |
| ·稻曲菌菌株DNA提取 | 第92页 |
| ·构建文库、测序 | 第92-93页 |
| ·数据装配分析 | 第93页 |
| 2 结果与分析 | 第93-95页 |
| ·稻曲菌DNA提取结果 | 第93-94页 |
| ·稻曲菌基因组180bp文库测序结果 | 第94-95页 |
| 3 讨论 | 第95-97页 |
| 第二部分 立枯丝核菌AG1 IC的研究 | 第97-115页 |
| 第一章 文献综述 | 第97-102页 |
| 1 立枯丝核菌的分类地位 | 第98页 |
| 2 立枯丝核菌侵染植物 | 第98-100页 |
| ·侵染范围 | 第98-99页 |
| ·侵染循环和侵染过程 | 第99页 |
| ·致病机制 | 第99-100页 |
| 3 立枯丝核菌的核型研究 | 第100-101页 |
| ·立枯丝核菌菌丝细胞核数目 | 第100页 |
| ·立枯丝核菌核型研究 | 第100-101页 |
| 4 本研究的目的与意义 | 第101-102页 |
| 第二章 AG1 IC侵染过程的研究 | 第102-109页 |
| 1 材料与方法 | 第102-103页 |
| ·材料 | 第102-103页 |
| ·菌株 | 第102页 |
| ·供试寄主 | 第102页 |
| ·主要试剂 | 第102页 |
| ·实验仪器 | 第102-103页 |
| ·方法 | 第103页 |
| ·侵染过程的光学显微镜观察 | 第103页 |
| ·侵染过程的扫描电镜观察 | 第103页 |
| 2 结果与分析 | 第103-107页 |
| ·AG1 IC侵染症状的观察 | 第103-105页 |
| ·AG1 IC侵染结构的观察 | 第105-107页 |
| 3 讨论 | 第107-109页 |
| 第三章 立枯丝核菌的核型分析 | 第109-115页 |
| 1 材料与方法 | 第109-110页 |
| ·材料 | 第109页 |
| ·供试菌株 | 第109页 |
| ·培养基 | 第109页 |
| ·主要化学试剂 | 第109页 |
| ·方法 | 第109-110页 |
| ·细胞核观察 | 第109-110页 |
| ·染色体压片 | 第110页 |
| 2 结果与分析 | 第110-114页 |
| ·立枯丝核菌AG1 IC的形态 | 第110-111页 |
| ·AG1 IC菌丝的核型观察 | 第111-113页 |
| ·染色体数目分析 | 第113-114页 |
| 3 讨论 | 第114-115页 |
| 参考文献 | 第115-133页 |
| 致谢 | 第133-135页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文情况 | 第135页 |
