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全基因组水平研究斑马鱼早期发育小RNA的表达与功能

致谢第1-6页
摘要第6-7页
ABSTRACT第7-8页
专业词汇中英文对照表第8-11页
第1章 引言第11-21页
   ·研究背景介绍第11-19页
     ·斑马鱼发育初期的生理过程概述第11-12页
     ·小RNA在发育中的功能概述第12-13页
     ·miRNA在发育中的功能研究第13-16页
     ·piRNA在发育中的功能研究第16-19页
   ·研究意义第19-21页
第2章 实验与数据处理第21-27页
   ·研究方法第21-23页
     ·小RNA建库测序的流程及方法概述第21-22页
     ·数据处理中用到的分析软件第22-23页
   ·实验过程第23页
   ·数据分析过程第23-27页
     ·测序数据前期处理第23-24页
     ·基因组比对第24页
     ·小RNA比对结果统计第24页
     ·小RNA测序数据中miRNA的研究第24-25页
     ·小RNA测序数据中piRNA的研究第25页
     ·小RNA测序数据中一些表达量比较高的读段的分析第25-27页
第3章 结果与讨论第27-39页
   ·斑马鱼发育初期小RNA数据统计第27-29页
     ·测序数据的前处理和基因组比对第27页
     ·序列比对情况显示小RNA特征第27-29页
   ·斑马鱼发育初期miRNA的分析第29-32页
     ·miRNA不同时期表达差异明显第29-31页
     ·miR-430对预测靶标基因影响显著第31-32页
   ·斑马鱼发育初期piRNA的表达情况第32-35页
     ·piRNA簇在基因组上的分布特征第32-33页
     ·piRNA表达簇中转座子含量较高第33-35页
   ·其它小RNA也作用于转座子LTR第35-37页
   ·斑马鱼发育初期一些表达量很高,潜在功能未知的序列第37-39页
第4章 结论与展望第39-41页
参考文献第41-47页
附录第47-51页
作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果第51页

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