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金鱼头瘤相关基因差减文库的构建与分析

目录第1-7页
摘要第7-8页
Abstract第8-10页
缩略语表第10-11页
第一章 前言第11-23页
 1 研究问题的由来第11页
 2 金鱼外部形态的变异及头瘤的特点第11-15页
   ·金鱼的起源及品种选育第11-12页
   ·金鱼的性状变异第12-14页
   ·金鱼头瘤的分布和形态特征第14页
   ·金鱼头瘤的研究现状第14-15页
 3 差异表达基因克隆技术及研究进展第15-19页
   ·mRNA差异显示技术(DDRT-PCR)第15页
   ·cDNA代表性差异分析(RDA)第15-16页
   ·cDNA扩增片段多样性技术(cDNA-AFLP)第16页
   ·基因表达系列分析(SAGE)第16-17页
   ·cDNA芯片技术(cDNA microarray)第17页
   ·消减抑制杂交(SSH)第17-19页
 4 实时荧光定量PCR的原理及数据分析第19-21页
   ·实时荧光定量PCR的原理第19-21页
   ·相对定量PCR的数据分析方法第21页
     ·双标准曲线法第21页
     ·2~(-△△CT)法第21页
 5 研究目的和意义第21-23页
第二章 金鱼头瘤相关基因差减文库的构建及筛选第23-43页
 1 材料与方法第23-34页
   ·实验用鱼第23-24页
   ·主要试剂和仪器第24页
   ·总RNA的提取和检测第24-25页
     ·总RNA的提取第24-25页
     ·总RNA的检测第25页
   ·SMART cDNA合成第25-26页
     ·第一链cDNA反转录第25-26页
     ·双链cDNA合成第26页
     ·双链cDNA纯化第26页
   ·消减抑制杂交第26-30页
     ·RsaI酶切第27页
     ·接头连接及效率检测第27-28页
     ·消减杂交第28-29页
     ·抑制PCR第29页
     ·差减效率检测第29-30页
     ·差减产物纯化第30页
   ·差减文库的生成第30-31页
     ·载体连接第30页
     ·细菌转化第30页
     ·涂板及细菌培养第30-31页
   ·PCR阳性克隆筛选第31页
   ·斑点杂交筛选第31-33页
     ·探针合成第31-32页
     ·探针标记效率检测第32页
     ·杂交膜准备及样品固定第32页
     ·斑点杂交及显色第32-33页
     ·差异表达克隆筛选第33页
   ·文库测序及比对分析第33-34页
     ·文库测序第33页
     ·序列Blast比对第33页
     ·基因功能注释第33-34页
 2 结果与分析第34-41页
   ·总RNA的检测第34页
   ·SMART cDNA的合成第34-35页
   ·消减抑制杂交第35-38页
     ·RsaI酶切第35-36页
     ·Tester cDNA接头连接效率检测第36-37页
     ·差减杂交及效率检测第37-38页
   ·PCR阳性克隆筛选第38页
   ·斑点杂交筛选第38-39页
   ·文库序列测定第39页
   ·文库序列比对分析第39-41页
     ·文库序列Blast比对第39-40页
     ·文库序列注释分类第40-41页
 3 讨论第41-43页
   ·实验金鱼品种的选择及组织取样第41页
   ·cDNA文库构建的影响因素第41页
   ·关于文库序列功能分类注释第41-43页
第三章 金鱼头瘤功能基因的分类注释及表达分析第43-52页
 1 材料与方法第43-46页
   ·实验材料第43页
   ·主要试剂和仪器第43-44页
   ·总RNA的提取及反转录第44页
     ·总RNA的提取第44页
     ·第一链cDNA反转录第44页
   ·金鱼头瘤功能基因的半定量鉴定第44-45页
     ·假定功能基因的选择第44-45页
     ·特异引物设计第45页
     ·功能基因不同组织间的半定量分析第45页
   ·金鱼头瘤功能基因的荧光定量分析第45-46页
     ·功能基因的荧光定量分析第45-46页
     ·数据处理第46页
 2 结果与分析第46-49页
   ·金鱼头瘤功能基因不同组织间的半定量分析第46-47页
   ·金鱼头瘤功能基因不同时相的定量分析第47-49页
 3 讨论第49-52页
   ·金鱼头瘤功能基因在组织生长过程中的表达变化及其功能第49-51页
   ·金鱼头瘤形成机制的预测第51-52页
参考文献第52-60页
附录1第60-63页
附录2第63-66页
硕士期间发表的论文第66-67页
致谢第67-68页
附件第68页

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