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大豆疫霉无毒基因PsAvr5和PsAvrlc的克隆及PsAvr3c的多态性研究

目录第1-8页
摘要第8-11页
ABSTRACT第11-14页
引言第14-16页
上篇 文献综述第16-59页
 第一章 卵菌和植物协同进化的互作模式第17-31页
  1 病原卵菌第18页
  2 引起植物免疫反应的卵菌PAMPs及其他激发子第18-20页
   ·GP42第18-19页
   ·CBEL第19页
   ·INF1第19-20页
   ·NLPs第20页
  3 卵菌分泌的效应分子第20-23页
   ·分泌到胞外的卵菌效应分子第21-23页
   ·分泌到胞内的卵菌效应分子第23页
  4 卵菌效应分子激发的免疫反应和植物的抗病基因第23-25页
   ·抗病基因和无毒基因的互作第23-24页
   ·植物的抗病基因第24-25页
   ·抗病基因和无毒基因的协同进化第25页
  5 小结第25-26页
  参考文献第26-31页
 第二章 植物病原卵菌无毒基因的研究进展第31-59页
  1 植物病原卵菌无毒基因克隆方法概述第31-35页
   ·植物病原卵菌无毒基因的遗传特性研究和连锁标记的鉴定第32-33页
   ·植物病原卵菌无毒基因的克隆方法第33-35页
  2 已经克隆的植物病原卵菌无毒基因第35-42页
   ·Phytophthora sojae中已经克隆的无毒基因第35-38页
   ·Phytophthora infestans中已经克隆的无毒基因第38-40页
   ·Hyaloperonospora parasitica中已经克隆的无毒基因第40-42页
  3 植物病原卵菌无毒基因的结构概况第42-46页
   ·N端结构概况第42-43页
   ·C端结构概况第43页
   ·无毒蛋白的蛋白结构分析第43-46页
  4 植物病原卵菌无毒基因的转录特征第46页
  5 植物病原卵菌无毒基因的毒性功能第46-49页
   ·PsAvr1b可以抑制BAX诱导的细胞死亡第47页
   ·PsAvr3b是一个调控植物免疫系统的Nudix水解酶第47-48页
   ·PiAvr3a互作并稳定马铃薯E3连接酶CMPG1来调控植物免疫系统第48页
   ·PiAvrblb2阻碍了一种植物蛋白酶的分泌从而破坏了植物免疫反应第48-49页
   ·ATR1和ATR13可以抑制植物免疫反应第49页
  6 植物病原卵菌无毒基因的变异机制第49-52页
   ·基因缺失第49-50页
   ·序列变异第50页
   ·转录沉默第50-52页
  参考文献第52-59页
下篇 研究内容第59-126页
 第一章 大豆疫霉无毒基因PsAvr5的克隆第60-84页
  摘要第60页
  ABSTRACT第60-62页
  1 材料与方法第62-66页
   ·供试菌株和大豆鉴别寄主第62页
   ·大豆疫霉菌F_1和F_2后代的产生第62页
   ·CAPs标记分析第62-63页
   ·载体构建,大豆疫霉遗传转化和植物基因枪瞬时转化第63-64页
   ·基因组DNA的提取和转化子的筛选第64-65页
   ·Quantitative real-time PCR分析第65页
   ·菌株毒力表型的测定第65-66页
  2 结果与分析第66-79页
   ·遗传作图和菌株的单体型分析推断PsAvr3a和PsAvr5是等位基因第66-68页
   ·PsAvr3a~(P6497)在Rps5大豆叶片上引起特异性细胞死亡第68-70页
   ·PsAvr3a~(P6497)基因过表达转化子的获得第70-71页
   ·PsAvr3a~(P6497)基因过表达转化子菌株在含有Rps3a和Rps5的大豆鉴别寄主上表现为无毒性状第71-74页
   ·PsAvr3a~(P6497)基因沉默转化子的获得第74-76页
   ·PsAvr3a~(P6497)基因沉默转化子菌株在含有Rps3a和Rps5的大豆鉴别寄主上不表现为无毒性状第76-79页
  3 讨论第79-80页
  参考文献第80-84页
 第二章 大豆疫霉无毒基因PsAvr1c克隆的初探第84-110页
  摘要第84-85页
  ABSTRACT第85-87页
  1 材料与方法第87-92页
   ·供试菌株和大豆鉴别寄主第87页
   ·大豆疫霉菌毒力表型的测定第87-88页
   ·基因组DNA的提取第88-89页
   ·CAPs标记分析第89页
   ·RNA的提取和cDNA的合成第89-90页
   ·大豆疫霉菌F_1和F_2后代的产生第90页
   ·遗传连锁分析第90页
   ·无毒池和毒性池的构建及测序分析第90-92页
     ·F_2后代的选取第90页
     ·基因组DNA的提取第90-91页
     ·池的构建第91页
     ·测序数据的分析第91-92页
  2 结果与分析第92-104页
   ·大豆疫霉亲本菌株的毒力表型测定第92页
   ·杂合F_1后代的毒力表型测定第92-93页
   ·F_2代群体毒性特征的遗传分析第93-95页
   ·大豆疫霉无毒基因PsAvr1c候选基因的分析第95-101页
     ·具有序列多态性特征的PsAvr1c候选基因的分析第95-100页
     ·具有转录多态性特征的PsAvr1c候选基因的分析第100-101页
   ·无毒池和毒性池的全基因组测序分析第101-104页
     ·基因组DNA的分析第102-103页
     ·无毒池和毒性池的构建第103-104页
     ·测序结果的分析第104页
  3 讨论第104-106页
  参考文献第106-110页
 第三章 中国大豆疫霉群体中Avr3c的多态性研究第110-126页
  摘要第110页
  ABSTRACT第110-113页
  1 材料与方法第113-114页
   ·供试菌株第113页
   ·毒力表型的测定第113页
   ·基因组DNA的提取第113-114页
   ·目的片段的扩增与测序第114页
   ·正向选择分析第114页
  2 结果与分析第114-119页
   ·供试菌株第114-115页
   ·Avr3c目的片段的扩增结果第115-116页
   ·Avr3c的测序结果与多态性分析第116-118页
   ·向选择分析第118-119页
  3 讨论第119-122页
  参考文献第122-126页
附录一 PsAvr5研究中用到的大豆疫霉菌株第126-128页
附录二 PsAvr1c候选基因的CAPs标记信息第128-130页
附录三 P.sojae Avh基因的RT-PCR引物第130-134页
全文总结第134-136页
攻读博士学位期间发表的研究论文第136-138页
致谢第138-139页

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