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酵母Set9调控蛋白Pdp1的PWWP结构域的结构生物学研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-10页
第1章 Pdp1 PWWP 结构域的结构和相互作用的研究第10-75页
   ·背景介绍第10-37页
     ·真核细胞染色体的结构第10-16页
     ·组蛋白的共价修饰第16-19页
     ·组蛋白 H4K20 甲基化第19-20页
     ·组蛋白 H4K20 甲基转移酶第20-22页
     ·组蛋白 H4K20 不同甲基化状态的功能第22-24页
     ·识别组蛋白甲基化修饰的结构域第24-29页
     ·总结第29-30页
  参考文献第30-37页
   ·酵母甲基转移酶 Set9 调控蛋白 Pdp1 的 PWWP 结构域的结构研究第37-75页
     ·Pdp1 的功能介绍第37-42页
     ·实验材料和实验方法第42-58页
       ·生物信息学调研第42-43页
       ·引物设计第43-44页
       ·PCR 体系第44-45页
       ·胶回收 PCR 片段和限制性内切酶酶切实验第45页
       ·连接和转化第45-46页
       ·初步表达测试第46页
       ·点突变实验第46-47页
       ·Pdp1 PWWP 结构域的表达与纯化第47-48页
       ·蛋白质浓度测定第48-49页
       ·多肽合成与纯化第49-50页
       ·荧光偏振实验第50-51页
       ·NMR 扰动(perturbation)实验第51-52页
       ·NMR 波谱解析三维溶液结构第52-58页
       ·分子动力学模拟第58页
     ·实验结果与讨论第58-75页
第2章 MOZ tandem PHD 结构域的结构和相互作用的研究第75-129页
   ·背景介绍第75-103页
     ·组蛋白的乙酰化第75-76页
     ·组蛋白乙酰化在转录中的作用第76-79页
     ·组蛋白乙酰化对染色质结构的直接影响第79-82页
     ·组蛋白乙酰化是一种分子标签第82-84页
     ·组蛋白乙酰化是组蛋白密码的一部分第84-85页
     ·组蛋白的乙酰转移酶 HATs第85-91页
       ·组蛋白乙酰转移酶的分类第86-89页
       ·组蛋白乙酰转移酶的亚基以及底物的偏好性第89-91页
     ·组蛋白乙酰转移酶 MOZ 属于 MYST 家族第91-92页
     ·PHD 锌指结构域第92-95页
  参考文献第95-103页
   ·人乙酰转移酶 MOZ 的串联 PHD 结构域的结构研究第103-129页
     ·串联 PHD 结构域的功能介绍第103-105页
     ·实验材料和实验方法第105-109页
       ·表达载体第105页
       ·TEV 酶的表达纯化第105-106页
       ·MOZ 串联 PHD 结构域的表达条件第106页
       ·MOZ 串联 PHD 结构域实验的各种 Buffer 配方第106-107页
       ·多肽合成与纯化第107页
       ·荧光偏振实验第107-108页
       ·NMR 波谱解析三维溶液结构第108-109页
     ·实验结果与讨论第109-129页
       ·MOZ 串联 PHD 结构域的序列比对第109-110页
       ·MOZ 串联 PHD 结构域的边界选择第110页
       ·MOZ 串联 PHD 结构域的克隆第110-111页
       ·MOZ 串联 PHD 结构域的表达与纯化第111-115页
       ·MOZ 串联 PHD 结构域的溶液结构第115-118页
       ·MOZ 与 DPF3b 串联 PHD 结构域的结构比较第118-119页
       ·MOZ 与组蛋白 H3 的相互作用研究第119-122页
       ·点突变实验验证相互作用信息第122-124页
       ·MOZ 串联 PHD 结构域与 H3K14ac 的复合物结构(进行中)第124页
       ·讨论第124-127页
       ·总结第127-129页
附录 1 Pdp1 PWWP 结构域原子化学位移列表第129-170页
附录 2 MOZ 串联 PHD 结构域原子化学位移列表第170-194页
致谢第194-195页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第195-196页

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