基于公共数据库的药物靶点相互作用网络研究
| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-19页 |
| 第一节 复杂网络简介 | 第10-14页 |
| ·网络的几个重要参数 | 第11-12页 |
| ·复杂网络 | 第12-14页 |
| 第二节 生物网络介绍 | 第14-18页 |
| ·引言 | 第14页 |
| ·蛋白质相互作用网络 | 第14-15页 |
| ·代谢网络 | 第15-17页 |
| ·药物靶标网络及药物-药物网络 | 第17-18页 |
| 第三节 本文的学习内容以及创新点 | 第18-19页 |
| 第二章 数据来源与分析方法简述 | 第19-36页 |
| 第一节 数据来源介绍 | 第19-24页 |
| ·RCSB PDB数据库介绍 | 第19-21页 |
| ·SCOP数据库介绍 | 第21-22页 |
| ·ENZYME database介绍 | 第22-23页 |
| ·DrugBank介绍 | 第23-24页 |
| 第二节 数据库构建编程 | 第24-26页 |
| 第三节 数据整合及数据库构建 | 第26-36页 |
| ·RCSB PDB数据库中数据的采集 | 第26-32页 |
| ·SCOP数据库中数据采集方法 | 第32-33页 |
| ·ENZYME分类数据信息采集方法 | 第33-34页 |
| ·DrugBank数据信息采集方法 | 第34-36页 |
| 第三章 数据讨论 | 第36-56页 |
| 第一节 DrugBank数据库数据讨论 | 第36-42页 |
| ·DrugBank数据库与pdb数据库的对接 | 第36-39页 |
| ·DrugBank数据库中分子量分布统计 | 第39-41页 |
| ·本节结论 | 第41-42页 |
| 第二节 RCSB PDB数据库数据讨论 | 第42-44页 |
| 第三节 配体作用倾向性分析 | 第44-56页 |
| ·Scop分类号与EC分类号对比研究 | 第44-45页 |
| ·金属离子与蛋白质结合的倾向性分析 | 第45-49页 |
| ·与二噁英类有机化合物作用的酶的分布倾向性 | 第49-50页 |
| ·与青霉素类有机化合物作用的酶的分布倾向性 | 第50-53页 |
| ·与含有氯苯基有机化合物作用的酶的分布倾向性 | 第53-55页 |
| ·本节结论 | 第55-56页 |
| 第四章 网络分析 | 第56-69页 |
| 第一节 网络构建 | 第56-59页 |
| 第二节 网络分析 | 第59-69页 |
| ·网络整体分析 | 第59-60页 |
| ·网络组成分析 | 第60页 |
| ·只有两个节点的子网 | 第60-61页 |
| ·辐射型子网络 | 第61-62页 |
| ·小世界网络 | 第62-63页 |
| ·大型无标度网络 | 第63-67页 |
| ·本节结论 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第74页 |
