| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-17页 |
| 英文缩略词表 | 第17-18页 |
| 文献综述 | 第18-34页 |
| 1 遗传和环境因素 | 第18-23页 |
| 2 滑膜免疫过程和炎症 | 第23-25页 |
| 3 适应性免疫途径 | 第25-28页 |
| 4 先天免疫系统的激活 | 第28-30页 |
| 5 间质组织应答 | 第30页 |
| 6 细胞因子和细胞内信号传递途径 | 第30-33页 |
| 7 结构损伤 | 第33-34页 |
| ·软骨损伤 | 第33页 |
| ·骨质侵蚀 | 第33-34页 |
| 8 结论 | 第34页 |
| 研究思路和意义 | 第34-35页 |
| 前言 | 第35-37页 |
| 第一章 绪论 | 第37-42页 |
| 1 文本挖掘的研究背景 | 第37-40页 |
| ·文本挖掘的定义 | 第37页 |
| ·海量生物医学文本数据积累 | 第37-38页 |
| ·目前主流的生物医学文献挖掘技术 | 第38-39页 |
| ·文本挖掘在中医药研究中的应用 | 第39-40页 |
| 2 中医药生物信息学的研究背景 | 第40-42页 |
| ·生物信息学的定义 | 第40页 |
| ·生物信息学在中医药研究中的运用 | 第40-42页 |
| 第二章 治疗RA常用中西药联合、中药配伍应用规律的挖掘 | 第42-56页 |
| 1 材料与方法 | 第43-48页 |
| ·中医药词表库的构建 | 第43-44页 |
| ·文本数据收集 | 第44-45页 |
| ·类风湿关节炎文本挖掘算法及过程 | 第45-48页 |
| 2 结果 | 第48-54页 |
| ·治疗RA西药文献频数 | 第48-49页 |
| ·治疗RA中成药文献频数 | 第49-50页 |
| ·RA西药、中成药联合使用文献频数 | 第50-51页 |
| ·中药复方配伍规律 | 第51-54页 |
| 3 讨论 | 第54-56页 |
| 第三章 雷公藤与MTX、黄芪与当归药理网络的构建及其治疗RA机制的生物信息学分析 | 第56-104页 |
| 1 材料和方法 | 第57-66页 |
| ·材料 | 第57-61页 |
| ·方法 | 第61-66页 |
| 2 结果 | 第66-97页 |
| ·RA患者和健康人差异表达基因的IPA网络分析 | 第66-67页 |
| ·雷公藤联合MTX人类药物靶标蛋白IPA网络分析 | 第67-80页 |
| ·黄芪联合当归靶蛋白IPA网络分析 | 第80-91页 |
| ·应用IPA分析雷公藤联合MTX、黄芪联合当归治疗RA机制 | 第91-97页 |
| 3 讨论 | 第97-104页 |
| ·蛋白质泛素化途径（protein ubiquitination pathway)可能是雷公藤、MTX、雷公藤联合MTX、黄蔑联合当归治疗RA的作用机制之一。 | 第97-100页 |
| ·雷公藤与MTX联合应用，不仅作用于蛋白质泛素化途径，较单独应用MTX效果，增加了更广泛的生物通路。 | 第100-102页 |
| ·热休克蛋白（heat shock proteins，HSP)是黄苗与当归联合应用、RA患者及健康人的差异基因作用于蛋白质泛素化途径时的共同IE点之一。 | 第102-104页 |
| 结论 | 第104-105页 |
| 本文创新点 | 第105-106页 |
| 展望 | 第106-107页 |
| 参考文献 | 第107-119页 |
| 致谢 | 第119-120页 |
| 中医药科研项目查新报告书 | 第120-123页 |
