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玉米苗期盐胁迫响应转录本表达谱构建

摘要第1-10页
Abstract第10-13页
1 前言第13-39页
   ·盐胁迫对植物的危害第13-14页
   ·盐胁迫及植物对盐胁迫响应的可能机理第14-38页
     ·小分子渗透调节物质第14-16页
     ·钙离子第16-17页
     ·活性氧第17-19页
     ·盐胁迫对光合作用的影响第19-20页
     ·多胺等小分子第20页
     ·植物激素与盐胁迫抗性第20-23页
       ·脱落酸与盐胁迫抗性第21-22页
       ·赤霉素与盐胁迫抗性第22页
       ·激动素对盐胁迫抗性的影响第22-23页
       ·生长素与盐胁迫抗性第23页
     ·转录因子在盐胁迫抗性中的作用第23-25页
       ·b-ZIP转录因子第23-24页
       ·DREB转录因子第24-25页
       ·NAC转录因子第25页
     ·蛋白激酶与盐胁迫抗性第25-27页
       ·MAPK第26页
       ·CDPK第26页
       ·RLK第26-27页
     ·蛋白质降解与盐胁迫第27-31页
       ·泛素与泛素系统第27-29页
       ·SUMO化第29-30页
       ·泛素化体系参与植物的胁迫响应第30-31页
     ·高通量方法广泛用于盐胁迫相关基因的检出第31-32页
     ·小RNA与盐胁迫第32-38页
       ·microRNA的形成过程第33-35页
       ·microRNA以转录后抑制的方式影响靶基因的表达第35页
       ·microRNA与发育第35-36页
       ·玉米microRNA的研究情况第36-37页
       ·microRNA与逆境响应第37-38页
   ·本研究的目的和意义第38-39页
2 材料与方法第39-45页
   ·植株和菌株材料第39页
   ·植株生长条件和处理条件第39-40页
   ·盐胁迫响应ESTs的获得第40-42页
     ·玉米总RNA提取及mRNA分离第40页
     ·抑制消减杂交文库构建第40-41页
     ·消减文库的macroarray杂交第41页
     ·cDNA芯片杂交第41-42页
     ·消减文库获得片段的启动子区域的预测第42页
   ·耐盐microRNA的获得第42-45页
     ·microRNA芯片杂交第42-43页
     ·microRNA基因启动子区域cis元件预测第43页
     ·microRNA靶基因预测第43-44页
     ·microRNA表达分析第44页
     ·microRNA靶基因的表达分析第44-45页
3 结果与分析第45-66页
   ·玉米两个自交系的盐抗性比较第45-46页
   ·SSH文库构建及筛选第46-48页
   ·cDNA文库杂交第48-49页
   ·玉米的盐胁迫抗性是一种多基因控制的复杂性状,存在分子调控网络。第49-54页
     ·盐胁迫影响转录和翻译相关因子转录本的表达第50页
     ·盐胁迫响应的蛋白激酶编码基因受到不同调节,而蛋白磷酸酯酶编码基因被诱导第50页
     ·盐胁迫条件下,Ub/26S蛋白酶体系的作用加强第50-51页
     ·盐胁迫抑制光合作用第51页
     ·盐胁迫条件下,核糖体蛋白质编码基因倾向于被抑制表达第51页
     ·盐胁迫下,细胞骨架成分蛋白质的编码基因倾向于受到抑制第51页
     ·与膜上物质转运相关的蛋白质编码基因被盐胁迫条件诱导第51页
     ·盐胁迫与其它胁迫具有共同响应因子第51-52页
     ·盐响应EST的RT-PCR分析第52-54页
     ·盐胁迫响应ESTs的电子定位和promoter分析第54页
   ·microRNA芯片杂交结果第54-66页
     ·玉米根系盐胁迫响应miRNA第54-57页
     ·两系中差异的microRNA比较第57页
     ·盐胁迫响应的miRNA在胁迫条件下的可能功能第57-60页
     ·盐胁迫响应microRNA靶基因预测,启动子区域cis位点预测第60-62页
     ·stem-loop RT-PCR验证microRNA的表达第62页
     ·microRNA靶基因的RT-PCR分析第62-66页
4 讨论第66-73页
   ·耐盐表型筛选标准选择第66-67页
   ·其它胁迫条件的响应基因在盐胁迫下的玉米细胞中也被检测到第67-68页
   ·盐胁迫响应信号系统的编码基因在两自交系中的表达受到微调第68-69页
   ·microRNA介导的转录后调控在玉米的盐胁迫响应中起到很大作用第69-70页
   ·玉米盐胁迫响应基因的其它调节机制第70-72页
     ·转录水平:RNA合成与RNA降解的动态平衡第70-71页
     ·翻译水平:蛋白质正确折叠、调控、与降解的动态平衡第71页
     ·翻译后水平调节第71-72页
   ·两自交系中差异表达的盐胁迫响应ESTs和miRNAs可解释两系的表型差异第72-73页
参考文献第73-82页
附录附表和附图第82-107页
 附录1 玉米自交系水培培养液配方(改良1×Hoagland's培养液)第82页
 附录2 玉米组织总RNA的提取第82-83页
 附录3 玉米mRNA的分离第83-84页
 附录4 抑制消减杂交(SSH)文库构建第84-85页
 附录5 显影液、定影液配方第85-86页
 附录6 cDNA芯片杂交流程第86-87页
 附录7 Stem-loop RT-PCR流程(据Varkonyi-Gasic等2007)第87-89页
 附录8:玉米盐胁迫响应ESTs的电子定位第89-90页
 附录9-A:PCR primers for microRNA promoter amplify第90页
 附录9-B:5 of the maize micorRNA promoter sequences obtained by PCR amplifying and sequencing第90-91页
 附表1:RT-PCR及Real-time RT-PCR引物序列第91-92页
 附表2:Stem-loop RT引物及随后的PCR引物第92-93页
 附表3:预测的micriRNA靶基因及相应RT-PCR引物第93-94页
 附表4:用SSH技术和芯片技术检测到的玉米盐胁迫响应EST的同源比较及功能注释第94-101页
 附表5:盐胁迫响应ESTs对应基因启动子区域的关键胁迫响应cis位点预测第101-105页
 附表6:玉米盐胁迫响应zma-miRNA基因启动子区关键的胁迫响应cis元件第105-107页
简历第107-108页
致谢第108页

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