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玉米纹枯病菌(Rhizoctonia solani AG-1-IA)β-1,4-内切纤维素酶的基因克隆表达及功能研究

符号说明第1-11页
中文摘要第11-12页
Abstract第12-14页
1. 引言第14-30页
   ·玉米纹枯病研究进展第14-20页
     ·症状第15页
     ·病原菌第15-16页
       ·病原的种类和融合群第15页
       ·病原的生理生态和生物学特性第15-16页
     ·玉米纹枯病病原的致病因子及侵染途径第16-17页
       ·致病因子第16-17页
       ·侵染途径第17页
     ·玉米纹枯病的发病规律及防治措施第17-20页
       ·发病规律第17页
       ·防治措施第17-19页
         ·清除病原菌菌丝和菌核第18页
         ·栽培防治第18页
         ·药物防治第18页
         ·生物防治第18-19页
       ·玉米纹枯病抗病机制及抗病种质资源的筛选研究第19-20页
         ·抗病机制第19-20页
           ·植物抗病基因第19页
           ·植物防卫反应第19-20页
         ·抗病种质资源筛选第20页
   ·病原真菌的致病性研究进展第20-23页
   ·立枯丝核菌胞壁降解酶-纤维素酶的研究进展第23-27页
     ·纤维素酶系的组成第23页
     ·纤维素酶的催化机制第23-24页
     ·纤维素酶基因的克隆第24-27页
     ·纤维素酶基因的表达第27页
   ·选题的立题依据、研究内容、技术路线第27-30页
     ·选题的立题依据第27-28页
     ·研究内容第28-29页
     ·技术路线第29-30页
2. 材料与方法第30-64页
   ·材料第30-34页
     ·供试菌株第30页
     ·菌株和质粒第30页
     ·主要生化和分子生物学试剂、酶第30-31页
     ·仪器第31页
     ·培养基第31页
     ·溶液配制第31-34页
   ·基因克隆第34-51页
     ·立枯丝核菌β-1,4-内切纤维素酶的基因克隆及序列分析第34-48页
       ·PCR 引物设计第34-38页
       ·立枯丝核菌总RNA 的提取(Tranzol 法)第38页
       ·紫外检测RNA 产率和纯度第38页
       ·反转录cDNA 第一链的合成第38-39页
       ·β-1,4-内切纤维素酶基因cDNA 中间片段的分离第39-43页
         ·β-1,4-内切纤维素酶基因cDNA 中间片段的扩增第39-40页
         ·PCR 产物回收第40-41页
         ·与载体连接第41页
         ·大肠杆菌感受态细胞的制备和转化第41-42页
           ·大肠杆菌感受态的制备第41-42页
           ·大肠杆菌感受态的转化第42页
         ·重组质粒的筛选与鉴定第42-43页
           ·菌落PCR 检测第42-43页
           ·序列测定第43页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因3’末端的分离第43-44页
       ·Rhizoctonia .solani β-1,4-内切纤维素酶基因5’末端的分离第44-47页
         ·菌丝体DNA 的抽提第44-45页
         ·Rhizoctonia .solani β-1,4-内切纤维素酶基因的5’-TAIL 扩增第45-47页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因全长cDNA 和DNA 的克隆第47-48页
       ·Rhizoctonia .solani β-1,4-内切纤维素酶基因全长序列的生物信息学分析第48页
     ·Rhizoctonia solani beta-tubulin 基因的克隆第48-51页
       ·PCR 引物设计第48-50页
       ·beta-tubulin 基因的扩增第50-51页
   ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因的表达分析第51页
     ·β-1,4-内切纤维素酶基因在玉米中的表达情况第51页
     ·β-1,4-内切纤维素酶基因在不同诱导底物中的表达情况第51页
   ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因在毕赤酵母中的表达第51-61页
     ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因序列的限制性酶切位点分析第51页
     ·表达引物设计第51-53页
     ·质粒提取第53-54页
     ·酵母表达载体的构建第54-55页
     ·序列测定第55页
     ·线性化质粒DNA 的制备第55-56页
     ·线状质粒DNA 的脱磷酸化处理第56页
     ·酵母转化(电击法)第56-57页
       ·pichia pastoris GS115 感受态细胞的制备第56-57页
       ·重组表达质粒pPIC9K第57页
     ·酵母转化子的筛选与鉴定第57-59页
       ·酵母转化子甲醇利用表型的平板筛选第57页
       ·酵母转化子的PCR 鉴定第57-59页
         ·pPIC9K AOX1 通用引物鉴定第57-58页
         ·Rhizoctonia solani EG-1 和EG-2 基因的特异性引物鉴定第58-59页
     ·外源基因多拷贝整合转化子筛选第59-60页
     ·酵母工程菌的培养和β-1,4-内切纤维素酶的诱导分泌表达第60-61页
     ·表达产物的生物学活性检测第61页
     ·表达产物β-1,4-内切纤维素酶的SDS-PAGE 分析第61页
     ·表达β-1,4-内切纤维素酶工程菌产酶曲线的测定第61页
   ·巴斯德毕赤酵母分泌表达产物的纯化第61-63页
     ·发酵液的制备第61页
     ·硫酸铵沉淀第61页
     ·Ni-NTA 亲和层析纯化第61-62页
     ·蛋白质分子量测定和纯度鉴定第62-63页
       ·SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳第62页
       ·电泳迁移率的计算和标准曲线的制作第62页
       ·分子量测定第62-63页
     ·蛋白质含量测定第63页
   ·重组表达β-1,4-内切纤维素酶的酶学性质研究第63-64页
     ·反应最适温度第63页
     ·反应最适pH 值第63页
     ·重组表达β-1,4-内切纤维素酶的底物特异性第63页
     ·重组表达β-1,4-内切纤维素酶的致病性研究第63-64页
3. 结果与分析第64-107页
   ·Rhizoctonia solani 总RNA 的提取第64页
   ·基因克隆第64-87页
     ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因的克隆第64-85页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因中间片段的分离第64-65页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因3’末端cDNA 的分离第65-66页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因cDNA 5’末端的分离第66-67页
       ·Rhizoctonia solaniβ-1,4-内切纤维素酶基因ORF cDNA 的分离及扩增片断的序列拼接第67-68页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因Genomic DNA 的扩增第68-69页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因的核苷酸序列和推测的氨基酸序列分析第69-73页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因的核苷酸序列分析第73-74页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因的氨基酸序列分析第74-78页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因的结构域分析第78-79页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶的氨基酸组成第79-81页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶的立体结构预测第81-82页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因的结构及加工后的修饰分析第82页
       ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因的同源性比较第82-85页
     ·beta-tubulin 基因的克隆第85页
     ·Rhizoctonia solani beta-tubulin 基因核苷酸序列和推测的氨基酸序列分析第85-86页
     ·Rhizoctonia solani beta-tubulin 基因的结构域分析第86-87页
   ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因的表达分析第87-91页
     ·β-1,4-内切纤维素酶基因在玉米中的表达情况第87-89页
     ·β-1,4-内切纤维素酶基因在不同诱导底物中的表达情况第89-91页
   ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因在毕赤酵母中的表达第91-102页
     ·β-1,4-内切纤维素酶基因序列的限制性酶切位点分析第91页
     ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因成熟肽序列的扩增第91-93页
     ·Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶基因在毕赤酵母中的表达第93-102页
       ·酵母表达载体的构建和鉴定第93-97页
         ·酵母表达载体pPIC9K 的分析第93-94页
         ·酵母表达载体的构建第94-97页
       ·重组酵母表达质粒转化Pichia pastoris GS115 及酵母转化子的筛选第97-100页
         ·酵母转化子甲醇利用表型的筛选第97-98页
         ·酵母转化子的PCR 鉴定第98-99页
         ·外源基因多拷贝整合转化子的筛选第99-100页
       ·外源基因在P. pastoris 中的高效表达及表达产物的检测第100-102页
         ·外源基因在P. pastoris 中的诱导表达和高效表达酵母菌株的筛选第100页
         ·Rhizoctonia solani 酵母工程菌PEG-45 产酶曲线的测定第100-101页
         ·重组表达产物β-1,4-内切纤维素酶的SDS-PAGE 检测第101-102页
   ·重组表达产物β-1,4-内切纤维素酶的纯化第102-103页
     ·镍柱亲和层析第102页
     ·重组表达产物β-1,4-内切纤维素酶的纯化过程总表第102-103页
     ·重组表达产物β-1,4-内切纤维素酶的分子量和纯度鉴定第103页
   ·重组表达Rhizoctonia solani β-1,4-内切纤维素酶的酶学性质研究第103-105页
     ·重组表达β-1,4-内切纤维素酶的最适反应温度第103-104页
     ·重组表达β-1,4-内切纤维素酶的最适反应pH 值第104页
     ·重组表达β-1,4-内切纤维素酶对不同底物活性的测定第104-105页
   ·重组表达β-1,4-内切纤维素酶对玉米的致病性研究第105-107页
4. 讨论第107-112页
   ·玉米纹枯病菌β-1,4-内切纤维素酶的基因克隆第107页
   ·β-1,4-内切纤维素酶基因的结构第107-108页
   ·β-1,4-内切纤维素酶基因的表达分析第108页
   ·β-1,4-内切纤维素酶在毕赤酵母中的表达第108-110页
     ·表达载体构建第108页
     ·线性化对转化效率的影响第108-109页
     ·影响外源基因高效表达的原因第109页
       ·外源基因的特性第109页
       ·基因的拷贝数第109页
       ·培养条件第109页
     ·蛋白的翻译及加工第109-110页
   ·重组表达β-1,4-内切纤维素酶的纯化和性质研究第110-111页
   ·重组表达β-1,4-内切纤维素酶对玉米的致病性分析第111-112页
5. 结论与建议第112-114页
   ·结论第112页
   ·建议第112-114页
参考文献第114-125页
致谢第125-126页
硕士学位论文内容简介及自评第126页

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