| 中文摘要 | 第1-7页 |
| 英文摘要 | 第7-8页 |
| 1 文献综述 | 第8-23页 |
| ·牛亚科动物在生物分类学上的地位 | 第8页 |
| ·牛属动物在生物分类学上的地位 | 第8-9页 |
| ·中国黄牛的起源和分类地位 | 第9-10页 |
| ·我国现有大额牛的分布起源和分化研究 | 第9-10页 |
| ·线粒体基因与cytb基因 | 第10-14页 |
| ·线粒体基因组 | 第11-13页 |
| ·cytb基因 | 第13-14页 |
| ·乙醇脱氢酶基因（ADH基因） | 第14-15页 |
| ·乙醇脱氢酶及其编码基因的类型 | 第14-15页 |
| ·ADH基因在分子系统学的应用 | 第15页 |
| ·分子进化与分子系统学研究方法 | 第15-22页 |
| ·分子系统学和进化研究中的一些基本论点 | 第16-18页 |
| ·核酸分子系统学研究方法 | 第18-20页 |
| ·分子系统学的方法论 | 第20-22页 |
| ·本研究的目的 | 第22-23页 |
| 2 材料和方法 | 第23-27页 |
| ·实验动物 | 第23页 |
| ·实验步骤 | 第23-27页 |
| ·血液DNA提取 | 第23-24页 |
| ·PCR扩增及测序反应引物 | 第24页 |
| ·PCR扩增反应体系和反应条件 | 第24-25页 |
| ·DNA扩增产物琼脂糖凝胶电泳检测 | 第25-26页 |
| ·DNA扩增产物聚丙烯酰胺凝胶电泳银染检测 | 第26页 |
| ·PCR产物的回收、纯化与测序 | 第26-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-51页 |
| ·独龙牛基因组DNA提取结果检测 | 第27页 |
| ·cytb和ADH基因PCR扩增产物的电泳检测结果 | 第27-29页 |
| ·cytb基因 | 第29-35页 |
| ·cytb基因全序列处理 | 第29页 |
| ·cytb基因全序列分析 | 第29-30页 |
| ·cytb基因全序列不同个体间的差异 | 第30-35页 |
| ·cytb不同个体间氨基酸组成差异以及密码子使用偏奇 | 第35页 |
| ·乙醇脱氢酶基因 | 第35-37页 |
| ·ADH基因全序列处理 | 第35-36页 |
| ·ADH基因部分序列分析 | 第36-37页 |
| ·基于cytb全序列对牛亚科10个牛种进行系统分析 | 第37-50页 |
| ·大额牛13个个体简单聚类分析 | 第37-38页 |
| ·牛亚科10个牛种cytb基因序列分析 | 第38-44页 |
| ·牛亚科不同种间遗传距离 | 第44-47页 |
| ·系统发育树构建 | 第47-50页 |
| ·基于ADH基因序列对本基金项目中所测5种牛种的亲缘性分析 | 第50-51页 |
| 4 讨论 | 第51-54页 |
| ·cytb与ADH基因序列分析 | 第51-52页 |
| ·基于cytb全序列探讨大额牛种群现状、起源以及分类地位 | 第52-54页 |
| 5 结论 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
| 附图 | 第59-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第62页 |
