| 中文摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-23页 |
| 1 引言 | 第8-9页 |
| 2 图谱克隆法的主要组成 | 第9-13页 |
| ·遗传图谱 | 第9-10页 |
| ·目的基因分子标记的常见方法 | 第10-11页 |
| ·以分子杂交为基础的分子标记技术 | 第10页 |
| ·以PCR为基础的分子标记技术 | 第10-11页 |
| ·随机扩增多态性DNA | 第10页 |
| ·特定序列位点 | 第10-11页 |
| ·DNA单链构象多态性 | 第11页 |
| ·扩增片段长度多态性 | 第11页 |
| ·单核苷酸多态性 | 第11页 |
| ·构建基因组文库与特定区域的物理图谱 | 第11-13页 |
| ·构建基因组文库 | 第11-12页 |
| ·构建特定区域的物理图谱 | 第12-13页 |
| ·物理图谱的类型 | 第12页 |
| ·限制酶切图谱(Restriction Maps) | 第12页 |
| ·跨叠片段图谱(Contig Maps) | 第12-13页 |
| ·DNA序列图谱 | 第13页 |
| ·共分离标记的获得与目的基因克隆及确认 | 第13页 |
| 3 稻瘟病菌无毒基因研究进展 | 第13-22页 |
| ·稻瘟病菌无毒性的遗传分析 | 第13-15页 |
| ·稻瘟病菌无毒基因的分子标记 | 第15页 |
| ·稻瘟病菌遗传图谱、物理图谱 | 第15-18页 |
| ·稻瘟病菌基因文库的构建 | 第18-19页 |
| ·稻瘟病菌的转化体系 | 第19页 |
| ·稻瘟病菌的全基因组测序 | 第19-20页 |
| ·稻瘟病菌无毒基因变异机制 | 第20-22页 |
| 4 本研究的工作基础和内容 | 第22-23页 |
| 第二章 无毒基因AVR-Pii两个SCAR标记间物理图谱构建 | 第23-37页 |
| 1 材料与方法 | 第24-26页 |
| ·供试稻瘟病菌菌株 | 第24页 |
| ·稻瘟病菌基因组文库 | 第24页 |
| ·SCAR标记OPI07_(700)与OPM10_(1314)的分析 | 第24-25页 |
| ·SCAR标记的Genomic Southern分析 | 第24-25页 |
| ·SCAR标记的定位与染色体步移方向的确定 | 第25页 |
| ·不同菌株间SCAR标记的序列分析 | 第25页 |
| ·稻瘟病菌基因组TAC文库的筛选 | 第25页 |
| ·克隆重叠群远端片段的亚克隆及其序列分析 | 第25-26页 |
| ·SCAR标记间物理图谱构建的方法 | 第26页 |
| 2 结果与分析 | 第26-35页 |
| ·SCAR标记OPM10_(1314)和OPI07_(700)的分析 | 第26-29页 |
| ·两个SCAR标记在基因组中的拷贝数 | 第26-27页 |
| ·SCAR标记在染色体上的定位与染色体步移方向的确定 | 第27页 |
| ·不同菌株间SCAR标记的序列分析 | 第27-29页 |
| ·SCAR标记OPM10_(1314)和OPI07_(700)区域物理图谱的构建 | 第29-35页 |
| ·以SCAR标记OPI07_(700)为起点进行染色体步移 | 第29-32页 |
| ·以SCAR标记OPM10_(1314)为起点进行染色体步移 | 第32-34页 |
| ·标记OPM10_(1314)和OPI07_(700)区域物理图谱的构建 | 第34-35页 |
| 3 讨论 | 第35-37页 |
| 第三章 无毒基因AVR-Pii区域物理图谱的构建 | 第37-49页 |
| 1 材料与方法 | 第38页 |
| ·TAC文库的筛选 | 第38页 |
| ·阳性克隆末端片段的亚克隆及所在Contig的分析 | 第38页 |
| ·探针的基因组Southern blot分析或CAPS(酶切扩增多态性序列)标记的检测 | 第38页 |
| ·依据数据库进行染色体步移起点的选择 | 第38页 |
| ·目的基因区域物理图谱的构建方法 | 第38页 |
| 2 结果与分析 | 第38-46页 |
| ·以SCAR标记OPI07_(700)为起点向目的基因进行染色体步移 | 第38-41页 |
| ·依据数据库进行染色体步移 | 第41-46页 |
| ·依据数据库进行染色体步移起点的选择 | 第41-42页 |
| ·依据数据库进行染色体步移的探针在不同菌株中的扩增情况及其CAPS分析 | 第42-43页 |
| ·数据库中所选三个位置的染色体步移 | 第43-46页 |
| 3 讨论 | 第46-49页 |
| 第四章 遗传分析用后代群体的构建 | 第49-53页 |
| 1 材料与方法 | 第49-50页 |
| ·供试稻瘟病菌菌株和水稻品种 | 第49页 |
| ·稻瘟病菌有性杂交及所用培养基 | 第49页 |
| ·共分离分析用后代致病性的测定 | 第49-50页 |
| 2 结果与分析 | 第50页 |
| ·杂交后代对水稻品种石狩白毛的致病性测定 | 第50页 |
| ·无毒性与毒性杂交组合J9×J32子囊孢子后代在石狩白毛上的致病性测定结果 | 第50页 |
| 3 讨论 | 第50-53页 |
| 第五章 结论与讨论 | 第53-56页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
