| 中文摘要 | 第1-9页 |
| 英文摘要（Abstract） | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 蛋白与DNA的相互作用（文献综述） | 第12页 |
| 引言 | 第12-28页 |
| 第一节 识别的结构及化学基础 | 第13-15页 |
| 1．1 DNA螺旋大、小沟中的碱基对与氨基酸侧链之间形成氢键 | 第13-14页 |
| 1．2 碱基对与氨基酸的特异识别 | 第14-15页 |
| 第二节 结构域与DNA在识别中的结构互补是识别的结构基础 | 第15-20页 |
| 2．1 蛋白与DNA的结构互补 | 第15页 |
| 2．2 各种结构家族与DNA的识别 | 第15-19页 |
| 2．3 DNA的弯曲 | 第19-20页 |
| 第三节 434阻遏蛋白与基因调控 | 第20-23页 |
| 3．1 调控的关键因素 | 第20页 |
| 3．2． 噬菌体434阻遏蛋白与DNA的相互作用 | 第20-21页 |
| 3．3 R1—69/DNA复合体 | 第21-23页 |
| 第四节 创造新的DBP | 第23-25页 |
| 4．1 用突变的方法进行噬菌体434阻遏蛋白的基因工程改造 | 第23-24页 |
| 4．2 利用已知的结构域创造新的DBP | 第24-25页 |
| 4．3 体外表达序列特异性结合蛋白的研究 | 第25页 |
| 第五节 研究蛋白结构及其与DNA相互作用的研究方法 | 第25-28页 |
| 5．1 研究蛋白结构的方法 | 第25-26页 |
| 5．2 筛选序列特异结合蛋白的方法 | 第26-28页 |
| 第二章 单链阻遏蛋白研究背景 | 第28-33页 |
| 一． 应用单链策略的方法获得新的DBP | 第28-29页 |
| 二． 434单链阻遏蛋白的获得和研究 | 第29-31页 |
| 三． 单链阻遏蛋白DAN结合序列的筛选路线 | 第31-33页 |
| 第三章 单链阻遏蛋白的表达和纯化 | 第33-46页 |
| 第一节 材料与方法 | 第33-39页 |
| 一． 菌株与试剂 | 第33页 |
| 二． 实验方法 | 第33-39页 |
| 2．1 细菌的培养和菌种的保存 | 第33-34页 |
| 2．2 大肠杆菌质粒的提取 | 第34页 |
| 2．3 DNA酶切和连接反应 | 第34-35页 |
| 2．4 DNA片段的回收 | 第35-36页 |
| 2．5 大肠杆菌感受态细胞的制备和转化 | 第36-37页 |
| 2．6 单链阻遏蛋白的表达和纯化 | 第37-39页 |
| 第二节 结果与讨论 | 第39-46页 |
| 2．1 单链阻遏蛋白表达载体的构建 | 第39-42页 |
| 2．2 单链阻遏蛋白的表达及纯化 | 第42-46页 |
| 第四章 筛选单链阻遏蛋白RR_（TRES）的最佳操纵区序列 | 第46-59页 |
| 第一节 材料及方法 | 第46-54页 |
| 一． 材料及试剂 | 第46-47页 |
| 二． 实验方法 | 第47-54页 |
| 2．1 模板、引物的设计合成 | 第47页 |
| 2．2 PCR扩增获得N6库 | 第47-49页 |
| 2．3 ~（32）P标记纯化后的PCR产物，并纯化 | 第49-50页 |
| 2．4 体外结合，循环筛选434单链阻遏蛋白的DNA结合序列 | 第50-53页 |
| 2．5 库测序 | 第53-54页 |
| 第二节 结果与讨论 | 第54-59页 |
| 2．1 模板和引物的合成和检测 | 第54-55页 |
| 2．2 N6库的获得和分析 | 第55-56页 |
| 2．3 标记PCR产物获得 | 第56-57页 |
| 2．4 体外结合和循环筛选单链阻遏蛋白RR_（TRES）的最佳DNA结合序列 | 第57-59页 |
| 第五章 单链阻遏蛋白DNA结合序列的获得和分析 | 第59-77页 |
| 第一节 材料与方法 | 第59-67页 |
| 一． 实验材料及试剂 | 第59-60页 |
| 二． 实验方法 | 第60-67页 |
| 2．1 非对称PCR获得单链DNA | 第60-61页 |
| 2．2 单链DNA的磷酸化 | 第61页 |
| 2．3 DNA的插入 | 第61-62页 |
| 2．4 插入突变效率的检测 | 第62-63页 |
| 2．5 测序获得插入操纵区的序列 | 第63-64页 |
| 2．6 电泳迁移率变动实验（EMSA） | 第64-66页 |
| 2．7 亲和力比较中所合成的寡核苷酸片段 | 第66-67页 |
| 第二节． 结果与讨论 | 第67-77页 |
| 2．1 环插入法获得含有插入突变的载体 | 第67-68页 |
| 2．2 测序获得被筛选到的操纵区的序列 | 第68-70页 |
| 2．3 分析筛选结果 | 第70-73页 |
| 2．4 重新设计双突变的单链阻遏蛋白的操纵区结合序列 | 第73-77页 |
| 第六章 非同位素方法筛选单链阻遏蛋白的DNA结合序列初探 | 第77-86页 |
| 第一节． 材料与方法 | 第77-81页 |
| 一． 实验材料 | 第77页 |
| 二． 实验方法 | 第77-79页 |
| 2．1． 半胱氨酸密码子的引入 | 第78页 |
| 2．2 蛋白表达载体的构建 | 第78-79页 |
| 2．3 蛋白表达及纯化 | 第79页 |
| 2．4 含自由巯基的蛋白的获得 | 第79页 |
| 2．5． 从N20库中筛选结合位点 | 第79-81页 |
| 第二节 结果与讨论 | 第81-86页 |
| 2．1 表达含有半胱氨酸尾的单链阻遏蛋白的载体的构建 | 第81-83页 |
| 2．2 序列测定 | 第83-84页 |
| 2．3 蛋白的表达和纯化 | 第84页 |
| 2．4 筛选目的DNA片段N20库的获得 | 第84-86页 |
| 第七章 结论与展望 | 第86-90页 |
| 参考文献 | 第90-99页 |
| 附录 副论文 | 第99-112页 |
| 图版 | 第112-113页 |
| 致谢 | 第113-114页 |
| 在学期间发表、待发表论文 | 第114页 |
